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Markergestützte Selektion 92
5.2 Material und Methoden
5.2.1 Modellannahme und Simulationen
Simuliert wurde eine Population mit M männlichen und F weiblichen Eltern, wobei
jedes männliche mit F/M weiblichen Eltern angepaart wurde. Selektiert wurde bei einer
überlappenden Generation über den Zeitraum von zehn Generationen. Das
durchschnittliche Generationsintervall lag bei einem Jahr. Das quantitative Merkmal der
Basisgeneration war normal verteilt, bei einer additiv genetischen Varianz σ²A und
phänotypischer Varianz. Da die Merkmalsleistung geschlechtspezifisch ist, haben alle
männlichen Vollgeschwister den gleichen Zuchtwert. Deshalb wurde die Anzahl
selektierter Hähne pro Vollgeschwistergruppe auf eins bis zwei beschränkt. Darüber
hinaus wurden unterschiedliche Markerallelzahl und Chromosomensegmentlänge
simuliert. Die Simulation erzeugte Daten, die folgende Informationen enthielten:
Generationen, Anzahl Tiere, QTL, Zuchtwert, Inzuchtkoeffizient Hahn,
Inzuchtkoeffizient Huhn, durchschnittliche Verwandtschaft Hahn, durchschnittliche
Verwandtschaft Huhn und durchschnittliche Verwandtschaft Hahn mit Huhn. Modelle
mit zwei unterschiedlichen Anfangs-QTL-Allelfrequenzen (0,2 und 0,8) wurden
simuliert. Jede Simulation wurde 100 mal wiederholt. Generell wurden sieben Schemen
simuliert:
1. unterschiedliche Populationsgröße
2. Anpaarungssysteme
3. Zuchtwerte
4. Anzahl Söhne pro Henne
5. QTL Genotypeffekte
6. Chromosomensegmentlänge
7. Markerallelzahl
Diese Kombinationsmöglichkeiten ergaben insgesamt 1260 Datensätze, die je nach
Notwendigkeit im Hinblick auf den Zuchtfortschritt und die Inzuchtentwicklung
ausgewertet wurden. Die Selektion der Tiere basierte auf dem Merkmal Legeleistung,
dessen phänotypische Varianz auf eins gesetzt wurde. Die Heritabilität des Merkmals
wurde in verschiedenen Szenarien variiert. Von allen Tieren wurden Inzucht- und