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Literaturübersicht 31
2.4.2 QTL-Auffindung
Die züchterische Nutzung von QTLS setzt deren Auffindung voraus. Dazu sind nach
DEKKERS (1999) grundsätzlich zwei verschiedene Ansätze möglich: der Kandidatengenansatz
und der Genomscanansatz. Beim Kandidatengenansatz werden die
Erkenntnisse von anderen Spezies, die vergleichsweise besser untersucht sind (z.B.
Mensch oder Maus), dazu genutzt Gene, von denen man annimmt, dass sie einen
Einfluss auf bestimmte Merkmale haben können, zu identifizieren. Grundlage für solche
Analysen ist, dass die untersuchte Population sowohl für den Marker als auch für das
untersuchte Merkmalsgen polymorph sein muss (SCHELLANDER et al., 1999). Beim
Genomscanansatz werden QTLS mittels zufällig über das Genom verteilten Markern auf
merkmalsbeeinflussende Chromosomenregionen "abgesucht". Bei einer Genomgröße
von etwas unter 3000 cM werden dafür 100 bis 150 Marker benötigt (SCHELLANDER et
al., 1999). Das QTL kann nun anhand statistischer Methoden identifiziert und seine
Position und sein Einfluss geschätzt werden (DEKKERS, 1999). Die QTL-Auffindung
mit Hilfe von Markern benötigt Kopplungsungleichgewichte zwischen dem QTL und
dem Marker-Locus (VAN ARENDONK et al., 1994).
2.4.3 Kandidatengene
Kandidatengene sind Gene, die bei anderen Spezies, wie z.B. Mensch oder Maus,
kartiert sind, und von denen man aufgrund der zur Verfügung stehenden Informationen
glaubt, dass sie dem gesuchten Gen homolog sind. Da alle Organismen aufgrund der
gemeinsamen Evolution verwandt sind, kann das vergleichende Studium der
Genomorganisation eines Organismus zu wertvollen Informationen über einen anderen
führen. Durch komparative Kartierung können Gene einer bestimmten Spezies auf der
Basis des Wissens über verwandte Gene einer anderen Art analysiert und verstanden
werden (KINGHORN et al., 2000). Die erste komparative Kartierung Mensch–Huhn
wurde auf Basis von Kopplungsdaten der kartierten Gene erstellt (BUITENHUIS et al.,
2002). Mit Hilfe der komparativen Kartierung des Mensch-Huhn Genoms konnten z.B.
die folgenden sieben Gruppen identifiziert werden: HU-4 und GG-6; HU-4 und GG-
E33+C11; HU-6 und GG-E2+C1; HU-6 und GG-17; HU-7 und GG-2; HU-8 und GG-2;
HU-12 und GG-1 (BURT et al., 1994).