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EINLEITUNG
2.5.2 Genomorganisation und Polyproteinprozessierung
Das einzelsträngige RNA-Genom positiver Polarität des CSFV[Moormann, 1990] ist
ca. 12,5 Kilobasen lang und enthält einen offenen Leserahmen (ORF), der für ein
Polyprotein von etwa 4000 Aminosäuren kodiert [Meyers, 1989]. 5´ und 3´ Ende des
Genoms sind von nichttranslatierten Bereichen flankiert, wobei das 3´-Ende nicht
polyadenyliert ist [Moormann & Hulst, 1988]. Die durch das Genom kodierten viralen
Proteine entstehen durch ko- und posttranslationale Prozessierung des hypothetischen
Polyproteins. Das p23-Nichtstrukturprotein, das im 5´-Bereich des offenen Lese-
rahmens lokalisiert ist, hat die Fähigkeit sich autoproteolytisch vom N-terminalen
Bereich des Polyproteins abzuspalten [Thiel, 1991; Stark, 1993]. In 3´-Richtung folgen
das Nukleokapsidprotein p14 und die Glykoproteine E0 (gp 44/48), E1 (gp 33) und E2
(gp 55) [Thiel, 1991; Stark, 1990]. Das Glykoprotein E0, welches Ribonuklease-
aktivität aufweist und als Homodimer nachgewiesen wurde, ist auf der Oberfläche des
Virions lokalisiert. Das E1-Glykoprotein, das als Transmembranprotein fungiert
[Weiland, 1990], ist in der Lage, mit dem Oberflächenprotein E2 ein Heterodimer zu
bilden [Weiland, 1990; Thiel, 1991]. Das auf dem Virion nachgewiesene E2-
Glykoprotein [Weiland, 1992] ist Träger von Antigen Determinanten [van Rijn, 1996;
Armengol; 2001]. Anschließend an die Sequenz der Strukturproteine folgt der Nicht-
strukturproteinbereich mit den Proteinen p7 [Elberts, 1996], NS2-3 (p125), NS4A
(p10), NS4B (p30), NS5A und NS5B (p130) [Collett, 1988; Meyers, 1990;
Wiskerchen & Collett, 1991]. Ähnlich wie für BVDV wird das NS2-3 Protein in NS2
und NS3 gespalten [Thiel, 1991]. Der NS2-3 Bereich von CSFV und BVDV enthält
typische Sequenzmotive für Helikase, Potease und NTPase [Gorbalenya, 1989/i;
Bazan & Fletterick, 1989]. Im NS5B Bereich konnten Sequenzmotive für RNA-
abhängige RNA-Polymerasen nachgewiesen werden [Meyers,1989].
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