Alberto Risueño Pérez - Gredos - Universidad de Salamanca

Tesis Doctoral
Figura 1.10. Conjunto de datos de 15 microarrays conteniendo 3 réplicas de 5 tejidos distintos: hipotálamo,
corazón, médula ósea, hígado y bazo. Este conjunto de microarrays fue analizado con un método de agrupamiento
jerárquico. La figura (a) muestra los microarrays normalizados con el mapeo a genes anotados de Ensembl; la figura
(b) muestra los datos normalizados considerando únicamente la expresión de RNA no codificante (ncRNAs) derivada
de RNAdb; la figura (c) muestra los datos únicamente considerando la expresión de las sondas situadas en intrones;
y finalmente la figura (d) muestra el agrupamiento jerárquico considerando solamente las sondas situadas en la
hebra complementaria a genes. A pesar de que el mapeo a genes segrega los diferentes tejidos de una forma más
clara, en todos los casos la matriz de expresión resultante es capaz de agrupar correctamente las 3 réplicas.
1.3.6. Variación de la información en las diferentes actualizaciones de
GATExplorer
Durante el periodo 2008 a 2010 la base de datos de GATExplorer fue actualizada tres veces
(ver tabla 1.4). Con estos datos históricos se puede demostrar que la definición del genoma y
transcriptoma en metazoos sufre cambios sustanciales conforme se van logrando nuevas
evidencias biológicas. La figura 1.11 muestra el número de genes y transcritos de humano,
ratón y rata para las versiones de Ensembl v50, v53 y v57 respectivamente. Estos datos
muestran una gran variación de una versión a otra, siendo el genoma humano el que más ha
cambiado seguido de ratón y de rata. Además en el caso de humano y ratón el número de
transcritos ha aumentado considerablemente en la versión 57 respecto a la 53, mientras que
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Figura 10a Figura 10b
Figura 10c Figura 10d