Alberto Risueño Pérez - Gredos - Universidad de Salamanca

Tesis Doctoral
enfermedad a través de un análisis de expresión génica global detectada con microarrays,
buscando lograr una interpretación biológica más adecuada sobre las diferencias entre los
subgrupos 13q-­‐ en CLLs.
El MM es una neoplasia de células plasmáticas, también denominadas plasmocitos, que son
linfocitos B diferenciados que se originan en la médula ósea y pertenecen al sistema
inmunitario, consistiendo su principal papel en la secreción de grandes cantidades de
anticuerpos. El MM es una hemopatía maligna en la que se da una proliferación anormal de
células plasmáticas que también se puede categorizar atendiendo a las diferentes alteraciones
citogenéticas que presenta (Bergsagel and Kuehl, 2005; Chng et al., 2007a). Algunos trabajos
han tenido éxito en caracterizar molecularmente las principales categorías o clases de MM
mostrando sus diferencias más importantes (Chng et al., 2007b; Zhan et al., 2002; Zhan et al.,
2006; Zhan et al., 2003). Sin embargo, a pesar de estos esfuerzos, existe una parte de la
biología que se escapa a la señal de los genes codificantes clásicos que no ha sido explorada
convenientemente en trabajos previos. Entre esas nuevas señales transcriptómicas destaca el
papel de los miRNAs en la enfermedad y cómo se relacionan con los genes codificantes de
proteína. Es conocida la actividad regulatoria que estos pequeños fragmentos de RNA no
codificante tienen sobre ciertos genes diana, procediendo a silenciarlos mediante la unión
específica y marcaje para la degradación de sus mRNAs (Bushati and Cohen, 2007). Estos
miRNAs desempeñan un papel importante en la regulación de los diferentes procesos
biológicos en células sanas (Alvarez-­‐Garcia and Miska, 2005; Cheng et al., 2005), pero también
se ha demostrado su papel en procesos tumorales y de cancerogénesis (Croce, 2009; Osada
and Takahashi, 2007). Además, se ha comprobado que los perfiles de expresión de miRNAs
tienen capacidad para clasificar tumores (Calin and Croce, 2006; Lu et al., 2005). En este
trabajo, se realizaron los análisis de la señal de expresión de 365 miRNAs medidos en distintos
tipos de MM clasificados por las aberraciones cromosómicas más comunes en este tipo de
enfermedad. En concreto, se establecieron 5 categorías de MM: t(14;16), t(11;14), t(4;14),
deleción de retinoblastoma (delRB) y FISH normal; añadiendo como otra categoría control
células plasmáticas normales. El propósito de este estudio fue caracterizar los distintos
subtipos de MM a través de la expresión de miRNAs encontrando marcadores para cada clase
y tratar de relacionarlos con la expresión de los genes codificantes de proteína. Esta asociación
entre datos biológicos de expresión y datos clínicos de subtipos patológicos es un paso clave
para ayudar a encontrar tratamientos más personalizados para el MM.
El trabajo descrito en este capítulo se enmarca dentro de proyectos de colaboración con otros
grupos del Centro de Investigación del Cáncer de la Universidad de Salamanca y del Hospital
Clínico Universitario de Salamanca. Por este motivo, el trabajo realizado sobre muestras de CLL
y MM que se presenta en esta Tesis Doctoral se encuentra restringido al desarrollo y aplicación
de análisis bioinformáticos de datos procedentes de técnicas genómicas, sin presentar detalle
sobre el diseño de experimentos ni sobre la validación biológica-­‐funcional de biomarcadores
encontrados.
2.2. Materiales y métodos
2.2.1. Muestras de Leucemia Linfocítica Crónica y métodos aplicados
El análisis para la identificación de biomarcadores en CLL, se realizó sobre datos de expresión
genómica obtenidos utilizando el microarrays de alta densidad de Affymetrix. Las muestras
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