Alberto Risueño Pérez - Gredos - Universidad de Salamanca
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Capítulo 2<br />
Análisis <strong>de</strong> expresión diferencial <strong>de</strong><br />
genes y microRNAs para la <strong>de</strong>tección <strong>de</strong><br />
biomarcadores en muestras <strong>de</strong> leucemia y<br />
mieloma múltiple<br />
2.1. Introducción<br />
Capítulo 2<br />
El cáncer es una enfermedad causada por alteraciones genéticas en oncogenes, genes<br />
supresores <strong>de</strong> tumores y en otros productos <strong>de</strong> transcripción como microRNAs (Croce, 2008;<br />
Weinberg, 2007). Estas alteraciones comienzan con alteraciones cromosómicas (trisomías,<br />
<strong>de</strong>leciones, o translocaciones) o mutaciones puntuales que afectan a la estructura y expresión<br />
<strong>de</strong> <strong>de</strong>terminados genes (Knudson, 2001). Estos genes alterados provocan una <strong>de</strong>sregulación<br />
en el ciclo celular y muerte celular programada (apoptosis), confiriendo a la célula una<br />
actividad proliferativa <strong>de</strong>scontrolada que termina por <strong>de</strong>splazar al tejido sano. El término<br />
cáncer engloba en realidad diversas enfermeda<strong>de</strong>s, que se pue<strong>de</strong>n categorizar en función <strong>de</strong><br />
su localización en el organismo, el tipo celular <strong>de</strong>l que proce<strong>de</strong>n, las alteraciones genómicas<br />
concretas que muestran y el estadio en el que se encuentren. Los trabajos actuales enfocados<br />
en la obtención <strong>de</strong> biomarcadores preten<strong>de</strong>n mejorar el conocimiento molecular sobre los<br />
mecanismos celulares específicos que causan o impulsan la transformación tumoral <strong>de</strong>ntro <strong>de</strong><br />
la enorme complejidad que supone el cáncer. A esta búsqueda están ayudando enormemente<br />
las mo<strong>de</strong>rnas técnicas genómicas <strong>de</strong> alto rendimiento, como los microarrays o la secuenciación<br />
masiva, que permiten medir miles <strong>de</strong> características <strong>de</strong> una <strong>de</strong>terminada muestra en un solo<br />
experimento proporcionando una gran cantidad <strong>de</strong> variables con las que trabajar. El hallazgo<br />
<strong>de</strong> patrones entre las comparaciones <strong>de</strong> tejido sano y distintos tipos <strong>de</strong> cáncer, permite refinar<br />
y encontrar nuevos subtipos <strong>de</strong> enfermedad que antes se consi<strong>de</strong>raban una sola,<br />
proporcionando <strong>de</strong> esta manera un trato más personalizado al paciente. Esta estratificación <strong>de</strong><br />
pacientes conlleva una mejora a nivel <strong>de</strong> diagnóstico, <strong>de</strong> prognosis y <strong>de</strong> tratamiento, así como<br />
un avance para el <strong>de</strong>sarrollo y utilización <strong>de</strong> fármacos más específicos y eficaces.<br />
La bioinformática es clave en los estudios genómicos en cáncer, como herramienta esencial<br />
para lograr análisis robustos <strong>de</strong> datos complejos. Existen numerosas técnicas computacionales<br />
<strong>de</strong> aprendizaje automático que permiten extraer información relevante <strong>de</strong> entre la cantidad<br />
masiva <strong>de</strong> datos proporcionada por experimentos <strong>de</strong> alto rendimiento. Estas técnicas se<br />
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