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Contribution à l'étude de virus de mollusques marins apparentés ...

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Tris-HCl pH8 1 ml<br />

Préparer extemporanément<br />

TE-RNase<br />

Tris-HCl pH 8 10 mM<br />

EDTA 1 mM<br />

RNase 20 Ilg/1l1<br />

Préparer <strong>à</strong> partir d'un stock <strong>de</strong> RNase <strong>à</strong> 10 mg/ml, conservé <strong>à</strong> -20°C.<br />

Acétate <strong>de</strong> Na 3M<br />

Isopropanol<br />

Ethanol 70%<br />

Métho<strong>de</strong><br />

1 - Ensemencer une colonie <strong>de</strong> la souche bactérienne dans 3 ml <strong>de</strong> SOB contenant <strong>de</strong><br />

l'arnpicilline, et agiter 15-20h <strong>à</strong> 37°C.<br />

2 - Centrifuger 1,5 ml <strong>de</strong> culture (12 000 g, 30 secon<strong>de</strong>s) et éliminer le surnageant.<br />

3 - Ajouter 400 III <strong>de</strong> STET, puis 30 III <strong>de</strong> lysozyme et vortexer. Incuber <strong>à</strong> 4°C, 30<br />

secon<strong>de</strong>s <strong>à</strong> 10 minutes.<br />

4 - Lyser en plaçant les tubes dans un bain-marie bouillant 1 <strong>à</strong> 2 minutes, puis laisser<br />

refroidir 5 minutes.<br />

5 - Centrifuger (12 OOOg, 10 <strong>à</strong> 30 minutes). Le culot, contient les débris bactériens et<br />

l'ADN chromosomique, il est éliminé <strong>à</strong> l'ai<strong>de</strong> d'un cure <strong>de</strong>nts.<br />

6 - Au surnageant contenant les plasmi<strong>de</strong>s, ajouter 40 III d'acétate <strong>de</strong> Na 3M et 500 III<br />

d'isopropanol prérefroidi. Vortexer et laisser 5-30 minutes <strong>à</strong> -20°C.<br />

7 - Centrifuger (12 OOOg, 5 min), éliminer le surnageant.<br />

8 - Laver le culot d'ADN précipité par addition d'éthanol 70%, centrifuger (12 OOOg, 5<br />

min) et éliminer le surnageant.<br />

9 - Sécher le culot sous vi<strong>de</strong> (5 min), ajouter 50 III <strong>de</strong> TE-RNase et vortexer<br />

brièvement.<br />

10 - Analyser les plasmi<strong>de</strong>s par digestion enzymatique et électrophorèse, puis stocker <strong>à</strong><br />

-20°C.<br />

Maxipréparation <strong>de</strong> plasmi<strong>de</strong>s<br />

Réactifs<br />

Solution 1<br />

Sucrose 25%<br />

Tris-HCl pH 8 50 mM<br />

EDTApH 8 5 mM<br />

Contrôler le pH sans l'ajuster, il doit être supérieur ou égal <strong>à</strong> 8.<br />

Solution II<br />

Tris-HCl pH 8<br />

EDTApH 8<br />

Triton XIOO<br />

Lysozyme (voir plus haut)<br />

Chlorure <strong>de</strong> Césium (CsCI)<br />

50 mM<br />

5mM<br />

5%<br />

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