Contribution à l'étude de virus de mollusques marins apparentés ...

Platichtys flesus, plie, Pleuronectes platessa, et limande, Limanda limanda (Flügel et al.,
1982) ainsi que de perche, Micropterus salmoïdes, ce dernier isolat étant produit sur culture
cellulaire (Robin et al., 1984). Ces profils présentent tous un grand nombre de protéines,
respectivement 33 (12 à 220 kda) pour le flet, la plie et la limande, et 22 (30,7 à 210 kda) pour
la perche. Les résultats obtenus lors de la caractérisation du LDV de dorade présentent des
similitudes avec ces précédentes descriptions de virus proches, en particulier quant au grand
nombre de polypeptides associés aux particules virales et quant à leur gamme de taille. Une
comparaison plus précise de profils protéiques de ces virus est montrée dans le Tableau 1. Il
est possible d'identifier sept protéines de tailles similaires (à 2 kda près) pour les trois virus.
De la même façon, lorsque les profils sont comparés deux à deux, il apparaît 16 protéines
similaires entre les isolats de LDV de dorade et de flet, 14 protéines similaires entre les isolats
de LDV de flet et de perche et huit protéines entre les isolats de LDV de dorade et de perche.
Il est toutefois difficile de donner une interprétation à ces résultats et d'identifier les
protéines éventuellement conservées parmi ces virus dans la mesure où les résultats peuvent
varier selon la méthode utilisée. En effet, dans les études de Flügel et al. (1982) et de Robin et
al. (1984), des gels de concentration homogène ont été utilisés, alors que dans les essais
réalisés à partir de LDV de dorade, des gels en gradient de concentration (4-17,5%
d'acrylamide) ont été réalisés. Les gels en gradient de concentration donnent en effet une
meilleure séparation des protéines et donc permettent d'obtenir une résolution plus précise.
Les résultats peuvent de plus varier considérablement en fonction de la méthode de lyse des
particules virales, qui peut comporter des traitements physiques (congélation, ultrasons) et
chimiques (tampon de lyse pouvant contenir différents détergents à des concentrations
variables).
Outre des différences liées aux méthodes, la comparaison des profils
électrophorétiques ne permet pas de déterminer avec exactitude la conservation éventuelle des
protéines virales. Ces dernières sont en effet, dans le cas du LDV, glycosylées dans une
grande part. Du fait de la variabilité des résidus glycosylés entre différentes espèces (Lis et
Sharon, 1986), des protéines virales de séquence peptidique conservée peuvent présenter des
variations de poids moléculaire importantes, selon la provenance des isolats de virus.
Toutefois, parmi les protéines de structure du LDV de dorade, il n'a été possible d'identifier
des glycosylations que sur 14 peptides. Parmi les dix peptides qui semblent non glycosylés,
DI2 et DI3 sont des protéines apparemment conservées pour les trois isolats de LDV
comparés. DI2 et D\3 correspondent en effet à d'autres protéines de tailles similaires chez le
LDV de flet: FI7 etFl8, et chez le LDV de perche : PI6etPI7 (Tableau 1).
Une comparaison plus précise de ces protéines, par des méthodes immunologiques ou
par séquençage, pourrait permettre de déterminer si elles constituent un bon candidat pour
mettre en place un diagnostic commun des virus apparentés aux Lymphocystis chez les
pOissons.
Les résultats concernant la caractérisation des glycoprotéines virales sont en accord
avec ce qui a précédemment été décrit pour la souche de LDV Leetown NFH, isolée de
perche, Micropterus salmoïdes (Robin et al., 1986). Ces auteurs montrent la présence d'une
grande proportion de résidus glycosylés (39%) associés aux particules virales purifiées.
Toutefois, la présence de glycosylations ne semble pas être constante au sein des Iridoviridae,
puisqu'aucun résidu glycosylé n'a pu être détecté à partir de virus apparentés aux trois autres
genres de cette famille : le Tipula Iridescent Virus (TlV, Iridovirus), le Mosquito Iridescent
Virus (MIV, Chloriridovirus) et le Frog Virus 3 (FV3, Ranavirus) (Tajbakhsh et Seligy,
1990).
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