2011 年底结题项目汇编 - 国家自然科学基金委员会医学科学部

医 学 科 学 部 六 处 青 年 科 学 基 金 项 目 H2610 非 传 染 病 流 行 病 学 238原 发 性 肝 癌 蛋 白 质 相 互 作 用 网 络 构 建 方 法 研 究批 准 号 :30800943项 目 负 责 人 : 吴 骋所 在 单 位 : 中 国 人 民 解 放 军 第 二 军 医 大 学本 研 究 以 原 发 性 肝 癌 为 切 入 点 , 探 讨 了 构 建 蛋 白 质 相 互 作 用 网 络 的 新 算 法 。 首 先 , 对 前 期 建 立的 肝 癌 患 者 临 床 资 料 库 进 行 了 改 进 和 优 化 以 适 合 存 储 大 规 模 的 肝 癌 细 胞 基 因 表 达 与 蛋 白 质 序 列 数据 , 便 于 临 床 资 料 与 基 因 、 蛋 白 质 数 据 之 间 作 用 关 系 的 分 析 。 其 次 , 为 了 提 高 蛋 白 质 互 作 网 络 的 构建 效 率 , 研 究 对 比 了 国 内 外 蛋 白 质 序 列 的 编 码 方 法 , 提 出 了 新 的 序 列 编 码 方 法 , 融 合 了 更 多 的 蛋 白质 信 息 , 提 高 了 蛋 白 质 功 能 的 识 别 效 率 。 第 三 , 以 公 共 数 据 库 提 供 的 人 类 蛋 白 质 相 互 作 用 和 序 列 数据 和 模 拟 数 据 为 训 练 集 、 验 证 集 , 探 索 了 蛋 白 质 功 能 模 块 的 构 建 方 法 , 以 增 强 蛋 白 质 互 作 网 络 构 建的 生 物 学 意 义 ; 优 化 了 贝 叶 斯 网 络 学 习 算 法 , 基 于 所 识 别 的 蛋 白 质 功 能 模 块 , 寻 找 基 因 与 蛋 白 质 之间 、 蛋 白 质 与 蛋 白 质 之 间 存 在 的 相 互 作 用 规 则 , 构 建 了 具 有 概 率 意 义 、 可 拓 展 的 混 合 型 相 互 作 用 网络 。 所 建 立 的 方 法 有 助 于 探 索 未 知 蛋 白 质 的 功 能 分 类 、 分 析 基 因 与 蛋 白 质 之 间 的 作 用 关 系 , 探 讨 蛋白 质 相 互 作 用 的 生 物 学 意 义 , 为 疾 病 的 临 床 研 究 提 供 参 考 。关 键 词 : 原 发 性 肝 癌 ; 蛋 白 质 相 互 作 用 网 络 ; 序 列 编 码 ; 贝 叶 斯 网 络学 科 代 码 :H2610获 奖 : 国 家 级 0 省 部 级 1( 科 技 进 步 奖 一 等 奖 ) 国 际 学 术 奖 0 其 它 1[1] 贺 佳 、 高 青 斌 、 郑 兴 东 、 吴 骋 、 金 志 超 等 . 复 杂 数 据 分 析 方 法 的 建 立 及 其 在 生 物 医 学 中 的 应 用 . 上海 市 人 民 政 府 , 上 海 市 科 学 技 术 进 步 奖 , ( 一 等 奖 ) 排 名 第 四 证 书 号 :20104413-1-R04,2010/11/03.[2] 贺 佳 、 郑 兴 东 、 高 青 斌 、 吴 骋 、 金 志 超 等 . 数 据 挖 掘 方 法 研 究 及 其 在 生 物 医 学 中 的 应 用 . 上 海 市医 学 会 , 上 海 市 医 学 科 技 奖 , ( 二 等 奖 ) 排 名 4 证 书 编 号 :20080202, 2009/08/01.发 表 论 文 : 国 际 刊 物 1 国 内 核 心 刊 物 4 国 内 一 般 刊 物 0 SCI 收 录 1[1] Qing-Bin Gao, Zhi-Chao Jin, Cheng Wu, Ya-Lin Sun, *Jia He, *Xiang He. Feature ExtractionTechniques for Protein Subcellular Localization Prediction. Current Bioinformatics, 4(2), pp 120-128,2009/05/01.(SCI 收 录 )[2] 吴 骋 , 王 志 勇 , 周 伽 芮 , 贺 佳 . 临 床 电 子 数 据 采 集 系 统 的 设 计 . 医 疗 卫 生 装 备 ,, 31(06), pp 5-7,2010/6/15( 中 国 知 网 ).[3] 王 志 勇 , 吴 骋 , 魏 民 , * 余 志 明 . 肝 癌 术 后 专 病 数 据 仓 库 建 模 研 究 . 中 国 卫 生 信 息 管 理 杂 志 , 6(3),pp 69-71, 2009.[4] 金 志 超 , 陆 健 , 吴 骋 , 高 青 斌 , 孙 亚 林 , 贺 佳 . 两 种 基 于 偏 最 小 二 乘 法 的 分 类 模 型 对 肿 瘤 基 因 表 达数 据 行 多 分 类 的 比 较 研 究 . 中 国 卫 生 统 计 , 26(05), pp 450-458, 2009/10/25( 中 国 知 网 ).[5] 金 志 超 , 陆 健 , 吴 骋 , 高 青 斌 , 孙 亚 林 , 贺 佳 . 基 于 偏 最 小 二 乘 的 原 发 性 肝 癌 细 胞 遗 传 学 异 常 区 域识 别 方 法 . 中 国 卫 生 统 计 , 26(03), pp 237-240, 2009/6/25( 中 国 知 网 ).会 议 报 告 : 国 际 特 邀 0 分 组 0 国 内 特 邀 0 分 组 0培 养 人 才 : 博 士 后 0 博 士 1( 毕 业 ) 硕 士 1( 毕 业 ) 中 青 年 学 术 带 头 人 0学 术 交 流 : 举 办 国 际 会 议 0 举 办 国 内 会 议 0 出 国 参 加 国 际 会 议 1 次 3 人学 科 审 核 意 见 : 情 况 属 实NSFC 医 学 科 学 部 六 处 预 防 医 学 学 科2011 年 底 结 题 项 目 汇 编