Programmreport 2012 - DORIS - Bundesamt für Strahlenschutz

Ergebnisse
TB 01
So waren die Microarrays bei der Verwendung von Cy3-markierter Gesamt-RNA durch eine homogene Spotmorphologie,
ausreichend hohe Spotsignale und ein niedriges Hintergrundsignal gekennzeichnet (Abbildung
1). Somit waren die selbst gespotteten Microarrays zur Identifizierung von miRNAs als potenzielle Biomarker
geeignet.
Von den insgesamt 703 humanen miRNAs zeigten 16 miRNAs eine veränderte Expression bei hochexponierten
Probanden im Vergleich zu niedrigexponierten Probanden (fold change ≥ 3,0). Die drei miRNAs miR-
NA-196a*, miRNA-198 und miRNA-453 waren in der hochexponierten Probandengruppe hochreguliert und
die 13 miRNAs miRNA-24-2, miRNA-33b, miRNA-62, miRNA-100*, miRNA-147, miRNA-218-2*, miRNA-222,
miRNA-450b-3p, miRNA-548d-5p, miRNA-560, miRNA-581, miRNA-598 und miRNA-801 runterreguliert (Abbildung
2).
Mittels des Mann-Whitney Tests inklusive der Benjamini-Hochberg False Discovery Rate zur p-Wert Korrektur
wurde die Expression der 16 miRNAs auf signifikante Unterschiede zwischen Hoch- und Niedrigexponierten
getestet. Für neun der 16 miRNAs konnte ein statistisch signifikanter Unterschied (p < 0,05) gezeigt werden
(Tabelle 1).
Von den drei hochregulierten miRNAs in der hochexponierten Probandengruppe zeigte nur miRNA-453 eine
signifikante Veränderung. Von den 13 miRNAs, die in der hochexponierten Probandengruppe runterreguliert
waren, zeigten die acht miRNAs miRNA-33b, miRNA-62, miRNA-147, miRNA-450b-3p, miRNA-548d-5p,
miRNA-581, miRNA-598 und miRNA-801 einen statistisch signifikanten Unterschied.
Von den insgesamt 703 miRNAs wurden die zwei miRNAs miR-30e* und miR-302c als potenzielle Referenzen
zur Normalisierung ausgewählt, da sie die geringste Standardabweichung als Maß für eine gleichförmige
Expression über die komplette Studiengruppe von hoch- und niedrigexponierten Probanden aufwiesen.
Abbildung 1:
Oligonukleotid Microarray zum Nachweis der miRNA-Expression.
Ergebnis der Hybridisierung mit Cy3-Markierung (Probe P052). Zur Analyse der miRNA-Expression
wurden ausschließlich die Ergebnisse der Hybridisierung mit Cy3-markierter Gesamt-RNA
verwendet
6 Ergebnisse der abgeschlossenen Forschungsvorhaben im Jahr 2012 - TB 01