Tierärztliche Hochschule Hannover Entwicklung von Methoden zur ...

EIGENE UNTERSUCHUNGEN
3.7 Auswertung mit dem µCT Evaluation Program
Zur quantitativen Auswertung der Scans vom XtremeCT und vom µCT 80 wurde die von
Scanco Medical AG mitgelieferte Software µCT Evaluation Program V6.0 verwendet.
Hiermit ließen sich für segmentierte Bereiche die Dichte in der Form von
Hydroxylapatit/ccm, die durchschnittliche CT-Zahl in Hounsfield Units (HU) und das
Volumen sowie die jeweilige Standardabweichung berechnen. Gesteuert über eine grafische
Benutzeroberfläche, wurde auf die Softwarebibliothek IPL zugegriffen. Die Image Processing
Language (IPL) ist eine von der Firma Scanco entwickelte, proprietäre und sehr umfangreiche
Software-Bibliothek. Sie bietet eine Vielzahl von Algorithmen zur Auswertung von µCT-
Daten.
Für Berechnungen der mittleren CT-Zahl und ihre Standardabweichung über alle Schichten
eines ausgwerteten Volumens wurde für jede auszuwertende Schicht eine Region Of Interest
(ROI) definiert. Anschließend erfolgte die Segmentierung mithilfe des Skriptes 13 „TV/BV
only“.
3.7.1 Bestimmung der optimalen Segmentierungseinstellung
Das Evaluation Programm ermöglichte die Segmentierung mithilfe von manuell gezeichneten
ROIs. Optional unterstützte die Software auch das Auffinden der Konturen des zu
segmentierenden Gewebes. Zur Segmentierung des Bereiches innerhalb einer ROI mussten
der obere sowie der untere Schwellenwert (threshold) sowie die Parameter „sigma“ und
„support“ festgelegt werden (Abb. 3.17). Es wurden anschließend ausschließlich Voxel mit
CT-Werten segmentiert, die zwischen dem oberen und dem unteren Schwellenwert lagen. Die
optimalen oberen und unteren Schwellenwerte für die Segmentierung bzw. quantitative
Auswertung der Scandaten wurden mithilfe des Evaluation Programs zunächst visuell grob
anhand eines Histogramms bestimmt (Abb. 3.17). Hierzu wurde jeweils auf beiden Seiten des
Histogramms der Bereich gesucht wo die Histogrammwerte am Nächsten bei der X-Achse
lagen. Danach wurden die mit diesen Bereichen korrespondierenden Schwellenwerte
eingestellt. Anschließend wurde der jeweils zu untersuchende Bereich im Schnittbild am
Bildschirm mit 16-facher Vergrößerung dargestellt. Von der Software wurde in Echtzeit die
Wirkung der eingestellten Schwellenwerte visuell angezeigt. Das heißt, die Bildpixel inner-
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