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Spezies- und gewebespezifischer Nachweis von bovinem ZNS ...

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Material <strong>und</strong> Methoden<br />

Versuchen mit Vollkonserven (s. Kapitel 3.2.5.1.4) wurde eine positiv getestete<br />

Rindergehirnprobe mitgeführt. Die nicht zur PCR benötigten Probemengen wurden bis zur<br />

weiteren Verwendung bei – 20°C gelagert.<br />

3.2.3.3 Polymerase Chain Reaktion (PCR)<br />

Durch Polymerase Chain Reaktion (PCR) erfolgte die Amplifikation der c-DNA aus der<br />

reversen Transkription.<br />

3.2.3.3.1 PCR mit den Primern GFAPforw <strong>und</strong> GFAPrev<br />

Die in der PCR eingesetzten Primer GFAPforw <strong>und</strong> GFAPrev wurden <strong>von</strong> Seyboldt et al.<br />

(2002) aus Sequenzinformationen der bovinen GFAP-mRNA (GenBank accession no.<br />

Y08255) entwickelt <strong>und</strong> binden an Sequenzen der Exons, die das Intron 3 (accession no.<br />

L19867) flankieren. Die Sequenzen der Primer lauten:<br />

• GFAPforw: 5`-GAGGAAGATTGAGTCTCTGGAGGA- 3`<br />

• GFAPrev: 5`-TCATACTGTGTGCGGATCTCTCTC- 3`.<br />

Der Mastermix für die PCR mit GFAPforw <strong>und</strong> GFAPrev Primern enthielt pro Reaktion<br />

folgende Komponenten (Tabelle 4):<br />

Tabelle 4: Mastermix für PCR mit den Primern GFAPforw <strong>und</strong> GFAPrev<br />

Reagenzien Konzentration Volumen (µl)<br />

10 x PCR-Puffer 5<br />

dNTPs je 10 mM/µl 1<br />

GFAPforw 100 pmol/µl 1<br />

GFAPrev 100 pmol/µl 1<br />

Taq-Polymerase 5 U/µl 0,2<br />

DEPC-Wasser 39,8<br />

Die Reagenzien wurden vorgemischt <strong>und</strong> je 48 µl dieses Gemisches entweder in 0,2 ml<br />

Achterstrips oder 0,2 ml Reaktionsgefäße (Mµlti ® -Ultra Tubes) hineinpipettiert.<br />

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