geração (semi)automática de metadados - Universidad Autónoma ...

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Los robots se van construyendo directamente en el árbol de la parte izquierda de la herramienta, es decir, el diseño se lleva a cabo trabajando con la estructura en árbol de los robots, tal y como ha presentado en el apartado 2.1. Partiendo de un transformador raíz, se van añadiendo transformadores hijos recursivamente, para lo cual la aplicación muestra diálogos similares al que se puede ver en la parte 1 de la Figura 4 (en el que se va a crear un transformador tipo PatternMatcher). Figura 4. Diseño y configuración de transformadores. En la Figura 4, los dos primeros parámetros del diálogo son propios del transformador PatternMatcher, mientras que los cuatro últimos son comunes a cualquier transformador. Además se permite la (re- )configuración de las propiedades de cada transformador una vez creado, tal y como muestra la parte 2 de la Figura 4. 4. EJEMPLO DE UTILIZACIÓN En este apartado se describe un ejemplo centrado en bioinformática, en el que se detallan las partes de un robot diseñado para acceder al portal GeneCards (GeneCards, 2007), recurso que permite la búsqueda de genes relacionados con una enfermedad. Además, para cada gen este recurso puede mostrar una página con gran cantidad de información. Concretamente, se desea construir un robot que reciba como entrada un nombre de una enfermedad y devuelva el conjunto de sondas de microarray (Affymetrix, 2007) que miden los genes relacionados con la patología. Dicha información se puede obtener mediante GeneCards, pero no directamente. En primer lugar se debe realizar una consulta por enfermedad, obteniéndose todos los genes relacionados con ella además de un enlace a información específica y ampliada de cada gen. Siguiendo cada enlace, se obtiene una página donde las sondas de microarray buscadas se encuentran en una tabla inmersa entre toda la información mostrada para el gen. El robot propuesto agilizaría por lo tanto el acceso repetitivo a la página de cada gen, además de filtrar todo el contenido que no es de interés. Para alcanzar los objetivos del robot es suficiente una estructura en serie, es decir, la salida de cada transformador del robot se pasa al siguiente. Los transformadores que componen el robot se muestran en la Tabla 2. Tabla 2. Transformadores de un robot de consulta a GeneCards. Paso Transformador Parámetros Dado el nombre de una enfermedad (entrada), crear la URL de consulta para GeneCards donde se obtienen los genes relacionados Conferência IADIS Ibero-Americana WWW/Internet 2007 Decorator head: http://www.genecards.org/cgibin/listdiseasecards.pl?type=pattern&search= tail: 221
ISBN: 978–972–8924–45-4 © 2007 IADIS Realizar la consulta. Para ello se recupera el contenido a partir de la URL creada en el paso anterior Buscar el identificador de los genes. Éstos se encuentran dentro de sus propios enlaces Crear la URL hacia la información ampliada de cada gen a partir de los identificadores del paso anterior Recuperar el contenido a partir de las URLs del paso anterior. Extraer los identificadores de sonda de microarray de las tablas donde se encuentren URLRetriever Ninguno PatternMatcher regexp:
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