Raíces y Tubérculos Andinos - Monitoreo y Evaluación de Impacto

Datos bioquímicos y moleculares: La presencia yausencia de cada polimorfismo fue determinada porinspección y se registró en una matriz de datos binarios.Mediante el programa estadístico NTSYS-PC ver. 1.8(Applied Biostatistics Inc., 1994), se calculó la similitudgenética entre cada par de entradas, mediante elcoeficiente SMC (Simple Match Coefficient) o de Jaccard(J), de acuerdo a la naturaleza genética del marcador.Mediante el método de ligamiento promedio (UPGMA),se visualizó un fenograma que es un diagramaarborescente que muestra las relaciones genéticas entreel material analizado. Además, a partir de la misma matrizde similitud se realizó un análisis multivariado deCoordenadas Principales (PCO), que es un método queposibilita la representación de variables e individuos enun mismo campo de proyección y permite estructurarla diversidad genética. Finalmente, se calculó lacorrelación entre datos morfológicos y moleculares oisoenzimáticos.Descripción de las colecciones conservadas ex situ.Durante estos años del proyecto, se ha logradocaracterizar y evaluar la totalidad de las colecciones deoca, melloco, mashua, jícama, zanahoria blanca, miso yachira mantenidas en el DENAREF. El objetivo ha sidoformar colecciones nucleares con alta representatividadgenética, para potenciar el uso de RTAs por mejoradoresy agricultores (Ver Conservación in situ de RTAs).Caracterización de la colección de melloco. A partirde los trabajos de Hermann y Del Río (1989), se estudióla variabilidad de la colección nacional de melloco y laidentificación de duplicados. Se utilizó el sistema deelectroforesis de isoenzimas. Se probaron cinco sistemasde corrida (tampón de electrodo y de gel), cuatrotampones de extracción y 16 sistemas enzimáticos(DENAREF, 1997). Para el estudio, se utilizaron 239entradas de la colección nacional de melloco. Seefectuaron tinciones para Malato Dehidrogenasa (MDH),Fosfoglucoisomerasa (PGI) y Fosfoglucomutasa (PGM),pero, debido a la poca definición de bandas en PGI yPGM, los análisis se efectuaron con MDH, que presentóseis patrones isoenzimáticos. En función de losdescriptores color principal del tubérculo y forma deltubérculo, la colección de melloco se agrupó en 20morfotipos (Figura 2.13). Al correlacionar los morfotiposde cada una de las colecciones con los patrones deMDH, se obtuvieron 55 grupos, lo que significaría el 23%de la variabilidad.Caracterización de la colección de mashua. En elestudio desarrollado por Monteros (1996), se identificóla variabilidad genética existente en las 78 entradas demashua del Banco de Germoplasma de INIAP, y seutilizaron descriptores morfológicos, agronómicos y elmétodo de patrones electroforéticos de isoenzimas.Para las características morfológicas y agronómicas, losanálisis estadísticos abarcaron dos fases: la primera, sobrela base de rangos, frecuencias y porcentajes, y la segunda,al utilizar análisis multivariados: análisis de agrupamientoy componentes principales. Para la informaciónisoenzimática, se utilizó el análisis de agrupamiento. Enla evaluación en campo, se utilizaron 44 descriptores,tanto agronómicos como morfológicos, y la colecciónpresentó una amplia variabilidad para los mismos. Enlaboratorio, el sistema de corrida Histidina - citrato, pH7,0 fue adecuado para revelar los sistemasisoenzimáticos PGM (Fosfoglucomatasa) y MDH (Malatodehidrogenasa). Se encontró polimorfismoisoenzimático para las enzimas MDH (en la cual seidentificaron tres zimotipos) y PGM (nueve zimotipos),con los cuales se discriminó a cada una de las 78 entradasde mashua.En función de la información obtenida, la colección fueagrupada en seis grupos principales y 15 subgrupos,definidos por caracteres morfológicos y agronómicosparticulares (Figura 2.14). La información isoenzimáticadeterminó 10 grupos principales dentro de la colecciónde mashua.A continuación se incluye la descripción de los grupos ysubgrupos de esta colección:Grupo A. Es un grupo que se integra por 19 entradas,las cuales se caracterizan, principalmente, por presentarel menor promedio para longitud del pecíolo (8,1 cm) yla menor relación largo/diámetro del tubérculo (2,9)dentro de los seis grupos.Subgrupo A1: conformado por las entradasECU-1 084, ECU-1 096 y ECU-1 113, las cuales secaracterizan por tener la menor longitud de hoja (3,0cm), al igual que el ancho de la hoja (4,1 cm) detodos los subgrupos.Subgrupo A2: contiene a las entradas ECU-1 101,ECU-8 567, ECU-1 128, ECU-1 102, ECU-1 105 y ECU-1 135, caracterizadas por poseer un tipo de plantasemierecta y grado de floración abundante.Subgrupo A3: con las entradas ECU-1 086, ECU-1 130,ECU-8 558, ECU-1 087, ECU-1 089 y ECU-1 095, cuyacaracterística es poseer color amarillo claro comoprimario de la pulpa del tubérculo.Subgrupo A4: este subgrupo abarca a las entradasECU-1 085 y ECU-1 099, las cuales presentan escasafloración, además del menor promedio entresubgrupos para longitud del pecíolo (6,0 cm).Subgrupo A5: conformado por las entradasECU-1 106 y ECU-1 107, cuyas características sonmenor número de tubérculos por planta (24,5) y elManejo y Conservación de RTAs49