Sak 03807 O Vedlegg Fagleg Rapportering 2006 - Helse Vest

187Forskningsprosjekt 911308:Fra identifikasjon av nye sykdomsgener til funksjonellgenomforskningProsjektansvarlig: Per Knappskog (pkna@helse-bergen.no), Helse Bergen HFAv menneskets 25000 gener er det bare ca 2000 som har en kjent assosiasjon til sykdom.Ved å identifisere nye sykdomsgener kan vi få viktig kunnskap om genenesnormalfunksjon og om sykdomsmekanismer, noe som vil være essensielt for utviklingenav spesifikk behandling.En sentral metode i jakten på nye sykdomsgener er undersøkelser av hele menneskets arvestoff medgenetiske markører. Slike genetiske koblings- og assosiasjonsstudier kan nå utføres mye mer effektivtenn før med opptil 1 000 000 SNP-markører per prøve på en DNA-chip. Forskningsgruppen ved Senterfor medisinsk genetikk og molekylærmedisin har de siste årene identifisert flere nyesykdomsassosierte gener med hittil ukjent eller mangelfullt kartlagt funksjon,I 2006 fikk vi støtte fra Helse Vest til innkjøp av Affymetrix-plattform for analyse av DNA-chip’er. Vihar nå etablert denne teknologien og har gjennomført genomvid-screening for flere egne prosjekter.Utstyret og den teknologiske kompetansen vil være meget anvendelig for modernetranslasjonsforskning innenfor mange medisinske forskningsmiljø.Så langt har vi gjennomført genomvid-screening med SNP-analyse for 3 nye prosjekter (limb-girdlemuskeldystrofi, spinocerebellær ataksi og alvorlig neonatal lactacidose). Vi har funnetkandidatområder for de to første tilstandene og genet for den sistnevnte sykdom.Det er utprøvd effektiv terapi for en Canadisk pasient med kulde indusert svettesyndrom ogutprøvende behandling av norske pasienter er planlagt.Videre studerer vi nå funksjonen til både decorin (assosiert med hornhinnedystrofi), CRLF1 og CLCF1(assosiert med kulde indusert svettesyndrom) genene i cellekulturer og i dyremodeller.3 vitenskapelige artikler er publisert i 2006:Rousseau F, Gauchat JF, McLeod JG, Chevalier S, Guillet C, Guilhot F, Cognet I, Froger J, Hahn AF, Knappskog PM, Gascan H,Boman H"Inactivation of cardiotrophin-like cytokine, a second ligand for ciliary neurotrophicfactor receptor, leads to cold-induced sweating syndrome in a patient."Proc Natl Acad Sci U S A. 2006;103(26):10068-73PMID: 16782820Rødahl E, Van Ginderdeuren R, Knappskog PM, Bredrup C, Boman H"A second decorin frame shift mutation in a family with congenital stromal cornealdystrophy."Am J Ophthalmol. 2006;142(3):520-1PMID: 16935612Hahn AF, Jones DL, Knappskog PM, Boman H, McLeod JG"Cold-induced sweating syndrome: a report of two cases and demonstration ofgenetic heterogeneity."J Neurol Sci. 2006;250(1-2):62-70PMID: 16952376Grunnforskning - Anesthesia & Intensive Care