Sak 03807 O Vedlegg Fagleg Rapportering 2006 - Helse Vest

323Korttidsprosjekt 911292:Oppbygging av vitenskapelig kompetanse innendiagnostisk proteomikk for å utvikle og forbedre tidligdiagnostikk av kronisk og degenerativ sykdomProsjektansvarlig: Rune J. Ulvik (rune.ulvik@med.uib.no), Universitetet i BergenProsjektet er tilknyttet Nasjonalt kompetansesenter for Multippel sklerose. Nasjonalt register. .Utvikling av nye biomarkører for tidlig diagnose av multippel sklerose”Klinisk proteomikk” er en moderne metode for påvisning av små proteinforandringer iblod og ryggmargsvæske som oppstår tidlig i utviklingen av sykdom. Metoden kanforbedre tidlig diagnose av kreft og andre kroniske sykdommer som multippel sklerose ogulike betennelsessykdommer.”Proteom” er en betegnelse for alle proteiner som finnes i en organisme, i et organ eller i enkroppsvæske som blod og ryggmargsvæske. Kroppsproteomet inneholder en million ulike proteiner,mens blodplasmaproteomet er sammensatt av rundt 10 000 proteiner. Forskning på proteomet kallesproteomikk. Med ”klinisk proteomikk” menes forskning for å bedre pasientbehandlingen.De store folkesykdommene som kreft, hjerte-kar sykdom, betennelsessykdommer og nevrologiskesykdommer kjennetegnes ved en snikende begynnelse og et forløp som kan dra i langdrag førsymptomene blir tydelige. En sentral hypotese er at i tidlig fase oppstår det forandringer i proteommønstereti organer og kroppsvæsker som kan påvises med følsom og spesifikk analyseteknikk. Slikeforandringer som betegnes som biomarkører, kan være spesifikke for ulike sykdommer og gir derformulighet for tidlig diagnose.Klinisk proteomikk bygger på massespektrometri som analysemetode. Denne teknologien er blitt myemer tilgjengelig enn tidligere tider, noe som har medført at klinisk proteomikk har hatt en rekordartetvekst over hele verden. I Bergen har etablering av den nasjonale analyseplattformen for proteomikk,PROBE gitt oss en enestående mulighet til å etablere klinisk proteomikk som nytt fagfelt.Vårt prosjekt er et tverrfaglig samarbeid mellom Inst. for indremedisin, Nervologisk avdeling ogNasjonalt kompetansesenter for multippel sklerose, Kjemisk inst, og PROBE. Vi har valgt multippelsklerose som sykdom for å bygge opp kompetanse innen klinisk proteomikk. Multippel sklerose er enkronisk degenerativ sykdom i sentralnervesystemet med ukjent årsak og med et snikende ogvarierende forløp. Det kan gå flere år før diagnosen er klar. Vanligvis rammes yngre mennesker i 25-35 års alder, og sykdommen fører til invaliditet og forkortet levetid. Utvikling av biomarkører for tidligdiagnose av multippel sklerose, vil derfor være et stort gjennombrudd for denne pasientgruppen.Et metodeproblem er at proteomet kan lett endres av utenforstående faktorer som temperatur,oppbevaring, etc. og dermed gi falske resultater. Videre fører massespektrometri til enormedatamengder som krever avanserte IT-systemer for å omforme resultatene til forståelig informasjon.Disse komplekse forhold krever et betydelig metodisk utviklingsarbeid. I 2006 har vi gjennomført enstørre metodestudie som omfatter prøvetaking, prøvebehandling, massespektrometrisk analyse ogdatabehandling. Dette har resultert i to manuskript som vil bli sendt til publikasjon tidlig i 2007.1 vitenskapelige artikler er publisert i 2006:Berven FS, Flikka K, Berle M, Vedeler C, Ulvik RJ"Proteomic-based biomarker discovery with emphasis on cerebrospinal fluid andmultiple sclerosis."Curr Pharm Biotechnol. 2006;7(3):147-58PMID: 16789900Klinisk forskning - Neurology