23. Ulusal Biyokimya Kongresi Özel Sayısı - Türk Biyokimya Dergisi

XXIII. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES‹
29 Kasım - 2 Aralık 2011
Hilton Hotel - Adana
23. Ulusal Biyokimya Kongresi, Adana [23 rd National Biochemistry Congress, Adana / TURKEY]
İÇİNDEKİLER
SÖZLÜ SUNUM ÖZETLERİ
AKCİĞER KANSERİ VE LÖSEMİ HASTALARINDA DOLAŞIMDAKİ
MİRNA’LARA AİT ERKEN SONUÇLAR
Lülüfer TAMER GÜMÜŞ 1 , Lokman AYAZ 1 , Nil DOĞRUER ÜNAL 1 ,
Şenay BALCI FİDANCI 1 , Serin AKBAYIR 1 , Ayşegül GÖRÜR 1 ,
Mehmet Sami SERİN 2 , Engin KAPLAN 3 , Nurcan ARAS ATEŞ 4 ,
Anıl TOMBAK 5 , E. Naci TİFTİK 5 , Ali ARICAN 6 , Erhan AYAN 7 ,
Mesut UZMAN 8 , Gürol EMEKTAŞ 9
1 Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyokimya, Mersin
2 Mersin Üniversitesi Eczacılık Fakültesi, Farmasötik Mikrobiyoloji, Mersin
3 Mersin Üniversitesi, İleri Teknoloji Eğitim, Araştırma ve Uygulama Merkezi, Mersin
4 Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ve Genetik, Mersin
5 Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Hematoloji, Mersin
6 Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Onkoloji, Mersin
7 Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Göğüs Cerrahi, Mersin
8 Mersin Üniversitesi, Proje Koordinasyon Birimi, Mersin
9 Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji, Mersin
MikroRNA’lar(miRNA), yaklaşık 21-23 nükleotit uzunluğunda, tek iplikli RNA
molekül türleridir. mRNA’ya bağlanarak protein translasyonunun inhibisyonuna
ve/veya mRNA’nın yıkımına neden olurlar. miRNA genlerinin %50’den fazlası
kanser ile ilişkili genomik bölgelerde yerleşmiştir. miRNA profillerinin, kanserlerin
sınıflandırılmasında, kökenlendiği dokusu bilinmeyen kanserin tanımlanmasında,
tedavinin takibinde, kanserin erken tanısında ve terapötik ajanların geliştirilmesinde
önemli faydalar sağlayacağı öngörülmektedir. Bu çalışmada, 24 lösemi(ALL, KLL) ve
22 akciğer kanseri tanısı almış 46 hasta ile 48 sağlıklı bireyde miRNA ekspresyonları
araştırıldı. EDTA içeren tüplere alınan periferik kan örnekleri, 4000 rpm’de 15 dakika
santrifüj edilerek plazmaları ayrıldı. Plazmadan izole edilen miRNA’lardan Reverse
Transcription kitiyle cDNA’lar elde edildi ve 96.96 Dynamic Array IFCs kullanılarak
Yüksek Kapasiteli Real-Time PCR(qRT-PCR) cihazı(Fluidigm, Biomark, USA) ile
384 farklı miRNA analiz edildi. Analiz edilen 384 miRNA’dan, miR-129, miR-23b,
miR-135a, miR-26a, miR-18a, miR-148b, miR-329, miR-361, miR-193a-3p, miR-
362-3p, miR-193a-5p, miR-299-3p, miR-330-5p, , miR-153, miR-301, miR-331-5p,
miR-214, miR-181a, miR-369-3p, miR-216, miR-159a, miR-339-3p, miR-183, miR-
340, miR-199b, miR-219, miR-187, miR-221, miR-324-3p, let-7b, miR-188-3p, miR-
200b, miR-200c, miR-342-5p, miR-202, miR-345, miR-655, miR-220, miR-220c,
miR-541, miR-890, miR-892a, miR-548a-5p, miR-211 ekspresyonları sadece lösemi
grubunda, let-7g, miR-484, miR-18a, miR-876-3p, miR-212 ekspresyonları sadece
PRELIMINARY RESULTS OF CIRCULATING MICRORNA IN LUNG
CANCER AND LEUKEMIA
Lülüfer TAMER GÜMÜŞ 1 , Lokman AYAZ 1 , Nil DOĞRUER ÜNAL 1 ,
Şenay BALCI FİDANCI 1 , Serin AKBAYIR 1 , Ayşegül GÖRÜR 1 ,
Mehmet Sami SERİN 2 , Engin KAPLAN 3 , Nurcan ARAS ATEŞ 4 ,
Anıl TOMBAK 5 , E. Naci TİFTİK 5 , Ali ARICAN 6 , Erhan AYAN 7 ,
Mesut UZMAN 8 , Gürol EMEKTAŞ 9
1 Medical Biochemistry, University of Mersin, Faculty of Medicine, Mersin
2 Pharmaceutical Microbiology, University of Mersin, Faculty of Pharmacy, Mersin
3 Advanced Technology Education, Research and Application Center,
University of Mersin, Mersin
4 Medical Biology and Genetics, University of Mersin, Faculty of Medicine, Mersin
5 Faculty of Medicine Hematology, University of Mersin, Mersin
6 Faculty of Medicine Oncology, University of Mersin, Mersin
7 Thoracic Surgery, University of Mersin, Faculty of Medicine, Mersin
8 Project Coordination Unit, University of Mersin, Mersin
9 Faculty of Medicine, Microbiology, University of Mersin, Mersin
Micro-RNAs(miRNAs), are the types of single-stranded RNA molecules,
approximately 21-23 nucleotides in length, that cause inhibition of protein
translation and/or destruction of mRNA with binding to it. More than 50%
of miRNA genes located in cancer-related genomic regions. It is estimated
miRNA profiling generates significant benefits in the classification of cancers,
identification of the root tissue of unknown cancers, monitoring of treatment,
early diagnosis of cancer and the development of therapeutic agents. In this study,
miRNA expression was investigated in 24 leukemia(ALL, CLL) and 22 diagnosed
with lung cancer of 46 patients and 48 healthy individuals. EDTA-anticoagulated
peripheral blood samples were centrifuged at 4000 rpm for 15 minutes then the
plasma was separated. cDNA\’s were obtained from the isolated plasma miRNAs
and 384 different miRNAs were analyzed with High Throughput Real-Time
PC(qRT-PCR) device(Fluidigm, Biomark, USA) by using 96.96 Dynamic Array
IFCs. From the 384 miRNA analyses, expressions of miR-129, miR-23b, miR-
135a, miR-26a, miR-18a, miR-148b, miR-329, miR-361, miR-193a-3p, miR-362-
3p, miR-193a-5p, miR-299-3p, miR-330-5p, , miR-153, miR-301, miR-331-5p,
miR-214, miR-181a, miR-369-3p, miR-216, miR-159a, miR-339-3p, miR-183,
miR-340, miR-199b, miR-219, miR-187, miR-221, miR-324-3p, let-7b, miR-188-
3p, miR-200b, miR-200c, miR-342-5p, miR-202, miR-345, miR-655, miR-220,
CONTENTS
ABSTRACTS OF ORAL PRESENTATIONS
Turk J Biochem, 2011; 36 (S2)
http://www.TurkJBiochem.com