23. Ulusal Biyokimya Kongresi Ãzel SayÄ±sÄ± - TÃ¼rk Biyokimya Dergisi

More documents

Recommendations

Info

XXIII. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES‹ 29 Kasım - 2 Aralık 2011 Hilton Hotel - Adana 23. Ulusal Biyokimya Kongresi, Adana [23 rd National Biochemistry Congress, Adana / TURKEY] İÇİNDEKİLER P. 067 / BENZOKSAZOL VE BENZOTİYAZOL HALKASI İÇEREN BAZI BİLEŞİKLERİN GLUTATYON TRANSFERAZ P1-1 İLE İNHİBİSYON VE DOCKİNG ÇALIŞMALARI Yaman MUŞDAL 1 ,Yasemin AKSOY 1 , Deniz CEYHAN 1 , Esin AKI 2 , İlkay YILDIZ 2 , İsmail YALÇIN 2 ,Tuğba TAŞKIN 3 , Usama HEGAZY 4 , Bengt MANNERVİK 4 P. 067 / INHIBITION AND DOCKING STUDIES OF SOME BENZOXAZOLE AND BENZOTHIAZOL RING CONTAINING COMPOUNDS FOR GLUTATHIONE TRANSFERASE P1-1 Yaman MUŞDAL 1 ,Yasemin AKSOY 1 , Deniz CEYHAN 1 , Esin AKI 2 , İlkay YILDIZ 2 , İsmail YALÇIN 2 ,Tuğba TAŞKIN 3 , Usama HEGAZY 4 , Bengt MANNERVİK 4 CONTENTS 1 Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyokimya, Ankara 2 Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi, Farmasotik Kimya, Ankata 3 Gaziantep Üniversitesi, Fen Fakultesi, Organik Kimya, Gaziantep 4 Uppsala Üniversitesi, Uppsala, Biyokimya ve Organik Kimya, Sweden Glutatyon transferazlar, faz II detoksifikasyon enzim ailesinin bir üyesi olup, endojen ve ksenobiyotik elektrofilik bileşiklerin indirgenmiş glutatyona konjugasyonunu kataliz ederler. Bu ailenin insanlarda en az yedi tane sitozolik izoenzimi bulunmaktadır. GST P1-1 bu üyelerden bir tanesidir ve birçok kanser hücre hattında aşırı ekspresyon göstermektedir. Aşırı eksprese olan hücrelerde bazı kanser ilaçlarını inaktive etmekte ve ilaç direnci oluşumuna neden olmaktadır. Bu çalışmamızda, GST P1-1 inhibisyon çalışmaları için benzoksazol ve benzotiyazol halkası içeren bileşikler tasarlandı ve sentezlendi. Bu amaçla, rekombinant GST P1-1 enzimi E.coli XL-1 Blue hücrelerinden eksprese edildi ve ardından S-hekzilglutatyon Sefaroz 6B afinite kromatografisi kullanılarak saflaştırıldı. Yan gruplarında küçük farklılıklar bulunan benzoksazol ve benzotiyazol halkası içeren bileşiklerin inhibisyon etkileri test edildi. GST P1-1 inhibisyon çalışmaları CDNB substratı ile spektrofotometrik olarak 340 nm’de bir dakika boyunca absorbanstaki değişim ölçülerek yapıldı. IC50 değerleri GraphPad Prism 4.0 yazılımı kullanılarak belirlendi. Yan gruplarında ve aktivitelerinde ufak değişimler gösteren bileşiklerin docking çalışmaları Discovery Studio (DS) 2.1 yazılımı kullanılarak çalışıldı. GST P1’lerin olası kristal yapıları protein veri bankasından (odb: 2JH9 ve 1AQW) elde edildi. İncelemeler aktivite sonuçlarının docking çalışmaları ile tutarlı olduğunu göstermektedir. 1 Medical Biochemistry, Health Sciences, Hacettepe University, Ankara 2 Pharmaceutical Chemistry, Pharmacy, Gazi University, Ankara 3 Organic Chemistry, Faculty of Science, Gaziantep University, Gaziantep 4 Biochemistry and Organic Chemistry, Faculty of Science, University of Uppsala, Upssala, Sweden Glutathione transferases, are a unique family of phase II detoxification enzymes that catalyze the conjugation of endogenous and xenobiotic electrophilic compounds to reduced glutathione. There are at least seven cytosolic isozymes of this family found in humans. GST P1-1 is one of these members and it is overexpressed in many cancer cell lines. It inactivates some of the cancer drugs in overexpressed cells and leads to formation of drug resistance. In our study, benzoxazole and benzothiazol ring containing compounds were designed and synhesized for the inbition studies for GST P1-1. For this reason, recombinant GST P1-1 enzyme was expressed in E. coli XL-1 Blue cells and then purified by using S-hexylglutathione Sepharose 6B affinity chromatography. The inhibitor effects of benzoxazole and benzothiazol ring containg compounds with small difference in their side groups were tested. GST P1-1 inhibition studies were done spectrophotometrically by measuring the absorbance change for one minute at 340 nm for the CDNB substrate. IC50 values of the compounds were determined by using GraphPad Prism 4.0 software. The docking studies of a set of compounds with variation in side groups and activity were performed by using Discovery Studio (DS) 2.1 software based on the possible two crystal structures of the GST P1 obtained from the protein data bank (pdb: 2JH9 and 1AQW). The observation shows that the activity rusults are consistent with the docking studies based on both of the crystal structures. Turk J Biochem, 2011; 36 (S2) http://www.TurkJBiochem.com
XXIII. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES‹ 29 Kasım - 2 Aralık 2011 Hilton Hotel - Adana 23. Ulusal Biyokimya Kongresi, Adana [23 rd National Biochemistry Congress, Adana / TURKEY] İÇİNDEKİLER P. 068 / ALBUMİN, BİLİRUBİN, ALP, KREATİNİN, TESTOSTERON VE 25-OH D VİTAMİNİ MEVSİMSEL DEĞİŞKENLİĞİ Mustafa ÖRKMEZ, Mehmet BOZOK, Ş.Nur AKSOY, A.Binnur ERBAĞCI Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyokimya AD, Gaziantep Biyolojik değişkenlik, hata ve kesinlik için analitik kalite hedeflerinin belirlenmesi, seri ölçümlerin doğru değerlendirilmesi ve referans aralıkların klinik yararının saptanmasında önem taşımaktadır. Bu çalışmada albumin, bilirubin, Alkalen Fosfataz (ALP), testosteron ve kreatinin mevsimsel değişkenliğinin geriye dönük olarak saptanması ve 25-OH D Vitamini değişkenliği ile ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Gaziantep Üniversitesi Araştırma Hastanesi’ne 2009-2011 yıllarında başvuran 18-65 yaş arası hastalara ait testlerin sonuçlarından yararlanılmıştır. Biyokimyasal analizler ve testosteron sırasıyla Abbott Architech C16000 ve i2000, 25(OH)D3 analizleri Chromsystems HPLC ile gerçekleştirilmiştir. Her parametre için 15.000-60.000 hastanın aylık ve mevsimsel ortalamaları karşılaştırılmış, 25(OH)D3 mevsimsel değişkenliği ile ilişkisi araştırılmıştır. Meteoroloji raporlarına dayanarak Nisan-Eylül ayları yaz, Ekim-Mart ayları kış dönemi olarak kabul edilmiştir. Her iki cinsiyet için yaz döneminde kreatinin ve total bilirubin düzeylerinin daha yüksek, albumin düzeyinin daha düşük seyrettiği (p
Page 1 and 2:
XXIII. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES
Page 3 and 4:
Page 5 and 6:
Page 7 and 8:
Page 9 and 10:
Page 11 and 12:
Page 13 and 14:
Page 15 and 16:
Page 17 and 18:
Page 19 and 20:
Page 21 and 22:
Page 23 and 24:
Page 25 and 26:
Page 27 and 28:
Page 29 and 30:
Page 31 and 32:
Page 33 and 34:
Page 35 and 36:
Page 37 and 38:
Page 39 and 40:
Page 41 and 42:
Page 43 and 44:
Page 45 and 46:
Page 47 and 48:
Page 49 and 50:
Page 51 and 52:
Page 53 and 54:
Page 55 and 56:
Page 57 and 58:
Page 59 and 60:
Page 61 and 62:
Page 63 and 64:
Page 65 and 66:
Page 67 and 68:
Page 69 and 70:
Page 71 and 72:
Page 73 and 74:
Page 75 and 76:
Page 77 and 78:
Page 79 and 80:
Page 81 and 82:
Page 83 and 84:
Page 85 and 86:
Page 87 and 88:
Page 89 and 90:
Page 91 and 92:
Page 93 and 94:
Page 95 and 96:
Page 97 and 98:
Page 99 and 100:
Page 101 and 102:
Page 103 and 104:
Page 105 and 106:
Page 107 and 108:
Page 109 and 110:
Page 111 and 112:
Page 113 and 114:
Page 115 and 116:
Page 117 and 118:
Page 119 and 120:
Page 121 and 122:
Page 123 and 124:
Page 125 and 126:
Page 127 and 128:
Page 129 and 130:
Page 131 and 132:
Page 133 and 134:
Page 135 and 136:
Page 137 and 138:
Page 139 and 140:
Page 141 and 142:
Page 143 and 144: XXIII. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES
Page 193: XXIII. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES
Page 245 and 246:
Page 247 and 248:
Page 249 and 250:
Page 251 and 252:
Page 253 and 254:
Page 255 and 256:
Page 257 and 258:
Page 259 and 260:
Page 261 and 262:
Page 263 and 264:
Page 265 and 266:
Page 267 and 268:
Page 269 and 270:
Page 271 and 272:
Page 273 and 274:
Page 275 and 276:
Page 277 and 278:
Page 279 and 280:
Page 281 and 282:
Page 283 and 284:
Page 285 and 286:
Page 287 and 288:
Page 289 and 290:
Page 291 and 292:
Page 293 and 294:
Page 295 and 296:
Page 297 and 298:
Page 299 and 300:
Page 301 and 302:
Page 303 and 304:
Page 305 and 306:
Page 307 and 308:
Page 309 and 310:
Page 311 and 312:
Page 313 and 314:
Page 315 and 316:
Page 317 and 318:
Page 319 and 320:
Page 321 and 322:
Page 323 and 324:
Page 325 and 326:
Page 327 and 328:
Page 329 and 330:
Page 331 and 332:
Page 333 and 334:
Page 335 and 336:
Page 337 and 338:
Page 339 and 340:
Page 341 and 342:
Page 343 and 344:
Page 345 and 346:
Page 347:
show all

23. Ulusal Biyokimya Kongresi Ãzel SayÄ±sÄ± - TÃ¼rk Biyokimya Dergisi

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?

23. Ulusal Biyokimya Kongresi Ãzel SayÄ±sÄ± - TÃ¼rk Biyokimya Dergisi