23. Ulusal Biyokimya Kongresi Ãzel Sayısı - Türk Biyokimya Dergisi
23. Ulusal Biyokimya Kongresi Ãzel Sayısı - Türk Biyokimya Dergisi
23. Ulusal Biyokimya Kongresi Ãzel Sayısı - Türk Biyokimya Dergisi
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
XXIII. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES‹<br />
29 Kasım - 2 Aralık 2011<br />
Hilton Hotel - Adana<br />
<strong>23.</strong> <strong>Ulusal</strong> <strong>Biyokimya</strong> <strong>Kongresi</strong>, Adana [23 rd National Biochemistry Congress, Adana / TURKEY]<br />
İÇİNDEKİLER<br />
P. 067 / BENZOKSAZOL VE BENZOTİYAZOL HALKASI İÇEREN<br />
BAZI BİLEŞİKLERİN GLUTATYON TRANSFERAZ P1-1 İLE<br />
İNHİBİSYON VE DOCKİNG ÇALIŞMALARI<br />
Yaman MUŞDAL 1 ,Yasemin AKSOY 1 , Deniz CEYHAN 1 , Esin AKI 2 ,<br />
İlkay YILDIZ 2 , İsmail YALÇIN 2 ,Tuğba TAŞKIN 3 , Usama HEGAZY 4 ,<br />
Bengt MANNERVİK 4<br />
P. 067 / INHIBITION AND DOCKING STUDIES OF SOME<br />
BENZOXAZOLE AND BENZOTHIAZOL RING CONTAINING<br />
COMPOUNDS FOR GLUTATHIONE TRANSFERASE P1-1<br />
Yaman MUŞDAL 1 ,Yasemin AKSOY 1 , Deniz CEYHAN 1 , Esin AKI 2 ,<br />
İlkay YILDIZ 2 , İsmail YALÇIN 2 ,Tuğba TAŞKIN 3 , Usama HEGAZY 4 ,<br />
Bengt MANNERVİK 4<br />
CONTENTS<br />
1 Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi <strong>Biyokimya</strong>, Ankara<br />
2 Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi, Farmasotik Kimya, Ankata<br />
3 Gaziantep Üniversitesi, Fen Fakultesi, Organik Kimya, Gaziantep<br />
4 Uppsala Üniversitesi, Uppsala, <strong>Biyokimya</strong> ve Organik Kimya, Sweden<br />
Glutatyon transferazlar, faz II detoksifikasyon enzim ailesinin bir üyesi olup, endojen<br />
ve ksenobiyotik elektrofilik bileşiklerin indirgenmiş glutatyona konjugasyonunu<br />
kataliz ederler. Bu ailenin insanlarda en az yedi tane sitozolik izoenzimi bulunmaktadır.<br />
GST P1-1 bu üyelerden bir tanesidir ve birçok kanser hücre hattında aşırı ekspresyon<br />
göstermektedir. Aşırı eksprese olan hücrelerde bazı kanser ilaçlarını inaktive etmekte<br />
ve ilaç direnci oluşumuna neden olmaktadır. Bu çalışmamızda, GST P1-1 inhibisyon<br />
çalışmaları için benzoksazol ve benzotiyazol halkası içeren bileşikler tasarlandı ve<br />
sentezlendi. Bu amaçla, rekombinant GST P1-1 enzimi E.coli XL-1 Blue hücrelerinden<br />
eksprese edildi ve ardından S-hekzilglutatyon Sefaroz 6B afinite kromatografisi<br />
kullanılarak saflaştırıldı. Yan gruplarında küçük farklılıklar bulunan benzoksazol<br />
ve benzotiyazol halkası içeren bileşiklerin inhibisyon etkileri test edildi. GST P1-1<br />
inhibisyon çalışmaları CDNB substratı ile spektrofotometrik olarak 340 nm’de bir<br />
dakika boyunca absorbanstaki değişim ölçülerek yapıldı. IC50 değerleri GraphPad<br />
Prism 4.0 yazılımı kullanılarak belirlendi. Yan gruplarında ve aktivitelerinde ufak<br />
değişimler gösteren bileşiklerin docking çalışmaları Discovery Studio (DS) 2.1 yazılımı<br />
kullanılarak çalışıldı. GST P1’lerin olası kristal yapıları protein veri bankasından (odb:<br />
2JH9 ve 1AQW) elde edildi. İncelemeler aktivite sonuçlarının docking çalışmaları ile<br />
tutarlı olduğunu göstermektedir.<br />
1 Medical Biochemistry, Health Sciences, Hacettepe University, Ankara<br />
2 Pharmaceutical Chemistry, Pharmacy, Gazi University, Ankara<br />
3 Organic Chemistry, Faculty of Science, Gaziantep University, Gaziantep<br />
4 Biochemistry and Organic Chemistry, Faculty of Science, University of<br />
Uppsala, Upssala, Sweden<br />
Glutathione transferases, are a unique family of phase II detoxification enzymes that<br />
catalyze the conjugation of endogenous and xenobiotic electrophilic compounds to<br />
reduced glutathione. There are at least seven cytosolic isozymes of this family found<br />
in humans. GST P1-1 is one of these members and it is overexpressed in many cancer<br />
cell lines. It inactivates some of the cancer drugs in overexpressed cells and leads to<br />
formation of drug resistance. In our study, benzoxazole and benzothiazol ring containing<br />
compounds were designed and synhesized for the inbition studies for GST P1-1. For<br />
this reason, recombinant GST P1-1 enzyme was expressed in E. coli XL-1 Blue cells<br />
and then purified by using S-hexylglutathione Sepharose 6B affinity chromatography.<br />
The inhibitor effects of benzoxazole and benzothiazol ring containg compounds with<br />
small difference in their side groups were tested. GST P1-1 inhibition studies were<br />
done spectrophotometrically by measuring the absorbance change for one minute at<br />
340 nm for the CDNB substrate. IC50 values of the compounds were determined by<br />
using GraphPad Prism 4.0 software. The docking studies of a set of compounds with<br />
variation in side groups and activity were performed by using Discovery Studio (DS)<br />
2.1 software based on the possible two crystal structures of the GST P1 obtained from<br />
the protein data bank (pdb: 2JH9 and 1AQW). The observation shows that the activity<br />
rusults are consistent with the docking studies based on both of the crystal structures.<br />
Turk J Biochem, 2011; 36 (S2)<br />
http://www.TurkJBiochem.com