08.02.2014 Views

23. Ulusal Biyokimya Kongresi Özel Sayısı - Türk Biyokimya Dergisi

23. Ulusal Biyokimya Kongresi Özel Sayısı - Türk Biyokimya Dergisi

23. Ulusal Biyokimya Kongresi Özel Sayısı - Türk Biyokimya Dergisi

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

XXIII. ULUSAL B‹YOK‹MYA KONGRES‹<br />

29 Kasım - 2 Aralık 2011<br />

Hilton Hotel - Adana<br />

<strong>23.</strong> <strong>Ulusal</strong> <strong>Biyokimya</strong> <strong>Kongresi</strong>, Adana [23 rd National Biochemistry Congress, Adana / TURKEY]<br />

İÇİNDEKİLER<br />

P. 067 / BENZOKSAZOL VE BENZOTİYAZOL HALKASI İÇEREN<br />

BAZI BİLEŞİKLERİN GLUTATYON TRANSFERAZ P1-1 İLE<br />

İNHİBİSYON VE DOCKİNG ÇALIŞMALARI<br />

Yaman MUŞDAL 1 ,Yasemin AKSOY 1 , Deniz CEYHAN 1 , Esin AKI 2 ,<br />

İlkay YILDIZ 2 , İsmail YALÇIN 2 ,Tuğba TAŞKIN 3 , Usama HEGAZY 4 ,<br />

Bengt MANNERVİK 4<br />

P. 067 / INHIBITION AND DOCKING STUDIES OF SOME<br />

BENZOXAZOLE AND BENZOTHIAZOL RING CONTAINING<br />

COMPOUNDS FOR GLUTATHIONE TRANSFERASE P1-1<br />

Yaman MUŞDAL 1 ,Yasemin AKSOY 1 , Deniz CEYHAN 1 , Esin AKI 2 ,<br />

İlkay YILDIZ 2 , İsmail YALÇIN 2 ,Tuğba TAŞKIN 3 , Usama HEGAZY 4 ,<br />

Bengt MANNERVİK 4<br />

CONTENTS<br />

1 Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi <strong>Biyokimya</strong>, Ankara<br />

2 Ankara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi, Farmasotik Kimya, Ankata<br />

3 Gaziantep Üniversitesi, Fen Fakultesi, Organik Kimya, Gaziantep<br />

4 Uppsala Üniversitesi, Uppsala, <strong>Biyokimya</strong> ve Organik Kimya, Sweden<br />

Glutatyon transferazlar, faz II detoksifikasyon enzim ailesinin bir üyesi olup, endojen<br />

ve ksenobiyotik elektrofilik bileşiklerin indirgenmiş glutatyona konjugasyonunu<br />

kataliz ederler. Bu ailenin insanlarda en az yedi tane sitozolik izoenzimi bulunmaktadır.<br />

GST P1-1 bu üyelerden bir tanesidir ve birçok kanser hücre hattında aşırı ekspresyon<br />

göstermektedir. Aşırı eksprese olan hücrelerde bazı kanser ilaçlarını inaktive etmekte<br />

ve ilaç direnci oluşumuna neden olmaktadır. Bu çalışmamızda, GST P1-1 inhibisyon<br />

çalışmaları için benzoksazol ve benzotiyazol halkası içeren bileşikler tasarlandı ve<br />

sentezlendi. Bu amaçla, rekombinant GST P1-1 enzimi E.coli XL-1 Blue hücrelerinden<br />

eksprese edildi ve ardından S-hekzilglutatyon Sefaroz 6B afinite kromatografisi<br />

kullanılarak saflaştırıldı. Yan gruplarında küçük farklılıklar bulunan benzoksazol<br />

ve benzotiyazol halkası içeren bileşiklerin inhibisyon etkileri test edildi. GST P1-1<br />

inhibisyon çalışmaları CDNB substratı ile spektrofotometrik olarak 340 nm’de bir<br />

dakika boyunca absorbanstaki değişim ölçülerek yapıldı. IC50 değerleri GraphPad<br />

Prism 4.0 yazılımı kullanılarak belirlendi. Yan gruplarında ve aktivitelerinde ufak<br />

değişimler gösteren bileşiklerin docking çalışmaları Discovery Studio (DS) 2.1 yazılımı<br />

kullanılarak çalışıldı. GST P1’lerin olası kristal yapıları protein veri bankasından (odb:<br />

2JH9 ve 1AQW) elde edildi. İncelemeler aktivite sonuçlarının docking çalışmaları ile<br />

tutarlı olduğunu göstermektedir.<br />

1 Medical Biochemistry, Health Sciences, Hacettepe University, Ankara<br />

2 Pharmaceutical Chemistry, Pharmacy, Gazi University, Ankara<br />

3 Organic Chemistry, Faculty of Science, Gaziantep University, Gaziantep<br />

4 Biochemistry and Organic Chemistry, Faculty of Science, University of<br />

Uppsala, Upssala, Sweden<br />

Glutathione transferases, are a unique family of phase II detoxification enzymes that<br />

catalyze the conjugation of endogenous and xenobiotic electrophilic compounds to<br />

reduced glutathione. There are at least seven cytosolic isozymes of this family found<br />

in humans. GST P1-1 is one of these members and it is overexpressed in many cancer<br />

cell lines. It inactivates some of the cancer drugs in overexpressed cells and leads to<br />

formation of drug resistance. In our study, benzoxazole and benzothiazol ring containing<br />

compounds were designed and synhesized for the inbition studies for GST P1-1. For<br />

this reason, recombinant GST P1-1 enzyme was expressed in E. coli XL-1 Blue cells<br />

and then purified by using S-hexylglutathione Sepharose 6B affinity chromatography.<br />

The inhibitor effects of benzoxazole and benzothiazol ring containg compounds with<br />

small difference in their side groups were tested. GST P1-1 inhibition studies were<br />

done spectrophotometrically by measuring the absorbance change for one minute at<br />

340 nm for the CDNB substrate. IC50 values of the compounds were determined by<br />

using GraphPad Prism 4.0 software. The docking studies of a set of compounds with<br />

variation in side groups and activity were performed by using Discovery Studio (DS)<br />

2.1 software based on the possible two crystal structures of the GST P1 obtained from<br />

the protein data bank (pdb: 2JH9 and 1AQW). The observation shows that the activity<br />

rusults are consistent with the docking studies based on both of the crystal structures.<br />

Turk J Biochem, 2011; 36 (S2)<br />

http://www.TurkJBiochem.com

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!