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Effet chez le porcelet d'une exposition à un régime co-contaminé en ...

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TRAVAIL EXPERIMENTAL7) Détermination de l’index de prolifération des lymphocytesComme expliqué dans <strong>le</strong> chapitre 1, la prolifération des lymphocytes a pu être déterminée aprèsla mise <strong>en</strong> culture du sang total, et stimulé avec <strong>un</strong> mitogène et/ou <strong>un</strong> antigène (ovalbumine). Lastimulation mitogénique du sang total (dilué au 1/15 ème ) avec la <strong>co</strong>ncanavaline A (10 µg/mL) nous apermis d’évaluer la réponse cellulaire non-spécifique. A l’inverse, la réponse cellulaire spécifique aété étudiée après la stimulation du sang total (dilué au 1/15 ème ) <strong>en</strong> prés<strong>en</strong>ce d’ovalbumine (5 et 10µg/mL). Des cultures cellulaires <strong>co</strong>ntrô<strong>le</strong>s, non stimulées ont aussi été inclus. Après 48h destimulation, nous avons rajouté de la thymidine radio-marquée (tritium 3 H, 0,5 µCi/puit) au milieu deculture, et laissé à incuber 24 heures supplém<strong>en</strong>taires. Les cultures cellulaires ont <strong>en</strong>suite étéstockées à -20°C. Après filtration des cultures, <strong>le</strong>s niveaux de thymidine tritiée in<strong>co</strong>rporée ont étémesurés à l’aide d’<strong>un</strong> <strong>co</strong>mpteur à scintillation (Kontron Instrum<strong>en</strong>t, Mila, Italie). L’index deprolifération des lymphocytes a été exprimé <strong>en</strong> cpm mesurés dans <strong>le</strong>s cultures stimulées/cpmmesurés dans <strong>le</strong>s cultures <strong>co</strong>ntrô<strong>le</strong>s non stimulées.8) Détermination de l’expression des ARNm <strong>co</strong>dant des cytokinesAfin d’extraire <strong>le</strong>s ARNs de la rate, <strong>le</strong>s échantillons <strong>co</strong>l<strong>le</strong>ctés à l’autopsie et <strong>co</strong>ngelés à -70°C, ontété broyés au FastPrep-24 (MP Biomedicals, Ilkirch, France) via l’utilisation de tubes de lyse (MPBiomedicals) <strong>co</strong>nt<strong>en</strong>ant du thiocyanate de guanidine (Extract-All®, Eurobio, <strong>le</strong>s Ulis, France), et suivid’<strong>un</strong>e extraction au phénol chloroforme. Comme m<strong>en</strong>tionné dans <strong>le</strong> chapitre 1, <strong>le</strong>s <strong>co</strong>nc<strong>en</strong>trations,l’intégrité et la qualité des ARNs ont été déterminées au spectrophotomètre Nanodrop ND1000(Labtech International, Paris, France). Les étapes de transcription inverse et de PCR temps réel ontété réalisées <strong>co</strong>mme précédemm<strong>en</strong>t. Des ARNs non-inversem<strong>en</strong>t transcrits ont été utilisés <strong>co</strong>mme<strong>co</strong>ntrô<strong>le</strong> pour vérifier que nous n’amplifions pas d’ADN génomique. En plus de cela, nos amorcesétai<strong>en</strong>t situées sur deux exons différ<strong>en</strong>ts, limitant ainsi l’amplification d’ADN génomique. Laspécificité des produits PCR a été <strong>co</strong>ntrôlée à la fin de la réaction par l’analyse de la <strong>co</strong>urbe dedissociation. Basé sur la méthode de Peirson et al. (2003), éga<strong>le</strong>m<strong>en</strong>t nommé DART-PCR (DataAnalysis for Real Time-PCR), nous avons pu déterminer l’efficacité d’amplification de chaqueéchantillon, et ainsi la fluoresc<strong>en</strong>ce initia<strong>le</strong> de chaque matrice d’ADNc. Cette approche r<strong>en</strong>d possib<strong>le</strong>l’analyse de chaque échantillon expérim<strong>en</strong>tal, basé sur sa propre réaction de cinétique plutôt que surcel<strong>le</strong> de standards artificiels. Enfin, <strong>le</strong>s va<strong>le</strong>urs de fluoresc<strong>en</strong>ce ont été normalisées par cel<strong>le</strong> de deuxgènes de ménage, la β2-µglobuline et la protéine ribosoma<strong>le</strong> L32, et l’expression des gènes a étéexprimée par rapport au groupe <strong>co</strong>ntrô<strong>le</strong>.147

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