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Funktionelle Analyse von Proteinen der Gpr1/Fun34/yaaH ...

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Diskussion<br />

Ce AT MTTPTNFTTEIDKLHAEITRLETGFYEN--------VNSFFLCSMALIIFFMQCGFAYLEAGAVRSKNTT 62<br />

Ce AT1 --------------------MKEDFSEN--------DNAFFLCSMSLIIFLMQCGFAFLEAGAVRSKNTT 42<br />

Ce AT2 MNTLQNLTLKMDRQPTIRMKPDKQLDCS-----LSQDDGVWMMASSFIIFTMTAGFGLLESGRVSSKDEV 65<br />

Ce AT3 MAGPEGSIFNASAMQIVQIHHYAEGSVTPEVDKLYQDDAVWIISSSFIIFTMHSGFGLLESGSVSAKDEV 70<br />

Consensus IIF M GF LE G V K 11<br />

Ce AT NILIKNLLDSCICIIGYWAIGWALAYGDS-GEGVNLFVGHSQFFLSG--------------------FSD 111<br />

Ce AT1 NILIKNLLDSCIAIVGYWALGWALAFGDCPNNTIGLFVGYSEFFLAN--------------------FSN 92<br />

Ce AT2 NCMVKNVFDVIFGGLAYWMFGYGLTFGDS-KHQLGRYVGFGDFFFDPERVSDDDSTDETHRGLLPKQITD 134<br />

Ce AT3 NIMVKNVVDVVFGGLSYWSCGFGFSYGDI-PEWRNPYVGFGKFFYDP---TRDYGTRETIN----QEGWS 132<br />

Consensus N KN D YW G GD VG FF 24<br />

Ce AT YPRFFFQYVFSATAAT-------IVSGAVAERCEFITYVTYCTVISTFIYPVLTHWGWTENGWMAKGITS 174<br />

Ce AT1 YPKFFFQYVFAATSAT-------IVSGAVAERCEFANYITYCSVISTLVYPILTHWGWHPKGWMALGITS 155<br />

Ce AT2 SESLRCQLSHNTFTFTRSHRIVKTLPTGMSERIHLKSHCFIS-FFITLVHSVAGHWVWDQEGVFRM---- 199<br />

Ce AT3 YASFLFQLSLATTAST-------IVSGAVAERAKLKSYILLG-CIVILIQALPAHWVWDKEGVFYK---- 190<br />

Consensus Q T ER HW W G 32<br />

Ce AT GIIDTKYDDFAGSGLVHLCGGSISFLAAWIMGPRIGKFPDDEDDESDEILGHSVPFTALGGFILMFGFLA 244<br />

Ce AT1 GVINTHYDDFAGSGVVHLCGGSISFLAAYMIGPRIGRFPEDDDDECDEILGHSVPFAALGGFILMFGFLA 225<br />

Ce AT2 ----MGVVDSAGCSAVHLVGGVSGLVATLYLKPRRNRFAKNGIRTVS-----DPTKAILGFLMIWWGWLA 260<br />

Ce AT3 ----KGVVDFAGCSAVHLVGGIIGLIATVFLKPRRNRFNEDSVHQMS-----SPTNALLGTFLLWWGWFG 251<br />

Consensus D AG VHL GG A PR F LG G 47<br />

Ce AT FNGGSVASISH--AGDGHTVALAMINTILSG---------------------AFAALIYLGVHYYQHGKW 291<br />

Ce AT1 FNGGSMADIVK--PGEGHIVALAMVNTILSG---------------------AFAALTYLIAHYLYHGKW 272<br />

Ce AT2 FNTSSNYAVTHGQWTEGMRSAVGTILASAGGVLQQSEILNLKNMYELKKLKHKFRGVVTVIITRLSTKKI 330<br />

Ce AT3 INAGSVWGITGGRWRLGARAAVATIMASIGG------------------------GATAITISFVKTKKL 297<br />

Consensus N S G A G K 53<br />

Ce AT TLLLTINACLSGMVAACAGCNKMEPWACIWVGLGAGLIYLAFSKLMIRLKIDDPLDAFAVHAGGGFWGLM 361<br />

Ce AT1 TLLLTINACLAGMVASCAGCNKMEPWACIWVGVGAGLIYLGLSKLMVRLKIDDPLDAFAVHAGGGFWGLT 342<br />

Ce AT2 QMDMLIDGMLASLVASTGGCLYFTPWQATLVGAIGSSLALAAYPVTEWLKIDDPVGVFPVHVVGSIWGMI 400<br />

Ce AT3 QVNFLINGILSSIVSITAICAVSRPWHALVIGSISSVFSIAVLPLLDRLHIDDPVGIVPIHLTSSIWGMI 367<br />

Consensus I L V C PW G L IDDP H WG 68<br />

Ce AT SSSIISHGGVAYALA---DAVSGAKNSGDHLTQAFAQLGWQMICALAIIAWSLGVMLPIFWILKKTGK-L 427<br />

Ce AT1 SVAFIGHDGVVYSIG---NTIGGATNGGDQIAQAFAQLGWQWVCALAIVTWSILWMWPIFALLRKIGK-L 408<br />

Ce AT2 APAIFVYRRPMNFGPPECDFQTSDEINGLLYGGGFYLLFLQSFVILVIGTYSAICAFIILFLIHHSPVGL 470<br />

Ce AT3 AVGIFCEE-DKYLG------SATNNRSGLLYSWSFELLWVQLQCTAAILIYSATTGFLALFLISKSPLGL 430<br />

Consensus G F L Q I S L 75<br />

Ce AT RVSEEVEINGLDVFKHGEMAYPLRAYGHGWHDFERANKIQAFSAKITVGEGKNTRIMKIHP--------- 488<br />

Ce AT1 RVSAEVEINGLDIYKHGESAYPLHAYGHGWHDFEAAPDSKINHSKHLP-VGRKNRIMSVHP--------- 468<br />

Ce AT2 RVDKYTEELGADLIEHGLAGFNVMTY-----TIEKKLDTKTLSAVLMIIVRWRAKAKLGAQ--------- 526<br />

Ce AT3 RVTDYEEQIGADVIEHGLAGTNVARY-----VLEKPLSTRTFQTVTKAITKWKMLAKKKSRQKRMEAAKL 495<br />

Consensus RV E G D HG Y E 84<br />

Ce AT --------------------------EMSIEQLASVYDRSGNIIPMP-----------KKSRTLFTNSAE 521<br />

Ce AT1 --------------------------EMSLEQLASVYDRTG-SVGES-----------DQPKRLFMNQTE 500<br />

Ce AT2 -------------------------RRKKIHDSGSVAPQQAESVEMN-----------VIHRRH------ 554<br />

Ce AT3 KRQEEQETFTNGTAIANGNGNVLHHRTNATESNGTGAPKRSNGPAFNNQITPLAVSSTVSTARNGPSTGR 565<br />

Consensus 84<br />

Ce AT RKMSQMMYD---------------------------------------ENKM------------------ 534<br />

Ce AT1 RRKSRMIEANALHALYLDDNEVPERKNTNPKTVSLQVPTTIIEAAEDEADKMTENDRM------------ 558<br />

Ce AT2 ---------------------------------------------------------------------- 554<br />

Ce AT3 RTESTAIEIEQPIEAVPPEVVAAAVLPPEERPGPSTNSNVSIEASVEKSPSSSTSRRSISIRSSPSIHTV 635<br />

Consensus 84<br />

Ce AT ---------------------------------------------------- 534<br />

Ce AT1 ---------------------------------------------------- 558<br />

Ce AT2 ---------------------------------------------------- 554<br />

Ce AT3 SAISTAAPDSRPSTASATSIISKKSSKNSTVGKFVKAPAPRALSPPDNNPPV 687<br />

Consensus 84<br />

Abb. 51: Alignment des Amoniumtransporter (AT) aus C. elegans (Ce) mit weiteren putativen<br />

Ammoniumtransportern (AT1-3) aus C. elegans. Je nach Konservierungsgrad sind die Aminosäuren<br />

rot (identisch) bzw. blau (strukturell ähnlich) dargestellt. Die Ammoniumtransporter–Signatur<br />

(Konsensussequenz: DxAGxxxVHLxGGxxxxxAxxxxx PR) ist gelb unterlegt. Das<br />

Alignment wurde mit Hilfe des ClustalX-1.81-Programmes (Thompson et al., 1997) erstellt.<br />

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