Funktionelle Analyse von Proteinen der Gpr1/Fun34/yaaH ...
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Diskussion<br />
Ce AT MTTPTNFTTEIDKLHAEITRLETGFYEN--------VNSFFLCSMALIIFFMQCGFAYLEAGAVRSKNTT 62<br />
Ce AT1 --------------------MKEDFSEN--------DNAFFLCSMSLIIFLMQCGFAFLEAGAVRSKNTT 42<br />
Ce AT2 MNTLQNLTLKMDRQPTIRMKPDKQLDCS-----LSQDDGVWMMASSFIIFTMTAGFGLLESGRVSSKDEV 65<br />
Ce AT3 MAGPEGSIFNASAMQIVQIHHYAEGSVTPEVDKLYQDDAVWIISSSFIIFTMHSGFGLLESGSVSAKDEV 70<br />
Consensus IIF M GF LE G V K 11<br />
Ce AT NILIKNLLDSCICIIGYWAIGWALAYGDS-GEGVNLFVGHSQFFLSG--------------------FSD 111<br />
Ce AT1 NILIKNLLDSCIAIVGYWALGWALAFGDCPNNTIGLFVGYSEFFLAN--------------------FSN 92<br />
Ce AT2 NCMVKNVFDVIFGGLAYWMFGYGLTFGDS-KHQLGRYVGFGDFFFDPERVSDDDSTDETHRGLLPKQITD 134<br />
Ce AT3 NIMVKNVVDVVFGGLSYWSCGFGFSYGDI-PEWRNPYVGFGKFFYDP---TRDYGTRETIN----QEGWS 132<br />
Consensus N KN D YW G GD VG FF 24<br />
Ce AT YPRFFFQYVFSATAAT-------IVSGAVAERCEFITYVTYCTVISTFIYPVLTHWGWTENGWMAKGITS 174<br />
Ce AT1 YPKFFFQYVFAATSAT-------IVSGAVAERCEFANYITYCSVISTLVYPILTHWGWHPKGWMALGITS 155<br />
Ce AT2 SESLRCQLSHNTFTFTRSHRIVKTLPTGMSERIHLKSHCFIS-FFITLVHSVAGHWVWDQEGVFRM---- 199<br />
Ce AT3 YASFLFQLSLATTAST-------IVSGAVAERAKLKSYILLG-CIVILIQALPAHWVWDKEGVFYK---- 190<br />
Consensus Q T ER HW W G 32<br />
Ce AT GIIDTKYDDFAGSGLVHLCGGSISFLAAWIMGPRIGKFPDDEDDESDEILGHSVPFTALGGFILMFGFLA 244<br />
Ce AT1 GVINTHYDDFAGSGVVHLCGGSISFLAAYMIGPRIGRFPEDDDDECDEILGHSVPFAALGGFILMFGFLA 225<br />
Ce AT2 ----MGVVDSAGCSAVHLVGGVSGLVATLYLKPRRNRFAKNGIRTVS-----DPTKAILGFLMIWWGWLA 260<br />
Ce AT3 ----KGVVDFAGCSAVHLVGGIIGLIATVFLKPRRNRFNEDSVHQMS-----SPTNALLGTFLLWWGWFG 251<br />
Consensus D AG VHL GG A PR F LG G 47<br />
Ce AT FNGGSVASISH--AGDGHTVALAMINTILSG---------------------AFAALIYLGVHYYQHGKW 291<br />
Ce AT1 FNGGSMADIVK--PGEGHIVALAMVNTILSG---------------------AFAALTYLIAHYLYHGKW 272<br />
Ce AT2 FNTSSNYAVTHGQWTEGMRSAVGTILASAGGVLQQSEILNLKNMYELKKLKHKFRGVVTVIITRLSTKKI 330<br />
Ce AT3 INAGSVWGITGGRWRLGARAAVATIMASIGG------------------------GATAITISFVKTKKL 297<br />
Consensus N S G A G K 53<br />
Ce AT TLLLTINACLSGMVAACAGCNKMEPWACIWVGLGAGLIYLAFSKLMIRLKIDDPLDAFAVHAGGGFWGLM 361<br />
Ce AT1 TLLLTINACLAGMVASCAGCNKMEPWACIWVGVGAGLIYLGLSKLMVRLKIDDPLDAFAVHAGGGFWGLT 342<br />
Ce AT2 QMDMLIDGMLASLVASTGGCLYFTPWQATLVGAIGSSLALAAYPVTEWLKIDDPVGVFPVHVVGSIWGMI 400<br />
Ce AT3 QVNFLINGILSSIVSITAICAVSRPWHALVIGSISSVFSIAVLPLLDRLHIDDPVGIVPIHLTSSIWGMI 367<br />
Consensus I L V C PW G L IDDP H WG 68<br />
Ce AT SSSIISHGGVAYALA---DAVSGAKNSGDHLTQAFAQLGWQMICALAIIAWSLGVMLPIFWILKKTGK-L 427<br />
Ce AT1 SVAFIGHDGVVYSIG---NTIGGATNGGDQIAQAFAQLGWQWVCALAIVTWSILWMWPIFALLRKIGK-L 408<br />
Ce AT2 APAIFVYRRPMNFGPPECDFQTSDEINGLLYGGGFYLLFLQSFVILVIGTYSAICAFIILFLIHHSPVGL 470<br />
Ce AT3 AVGIFCEE-DKYLG------SATNNRSGLLYSWSFELLWVQLQCTAAILIYSATTGFLALFLISKSPLGL 430<br />
Consensus G F L Q I S L 75<br />
Ce AT RVSEEVEINGLDVFKHGEMAYPLRAYGHGWHDFERANKIQAFSAKITVGEGKNTRIMKIHP--------- 488<br />
Ce AT1 RVSAEVEINGLDIYKHGESAYPLHAYGHGWHDFEAAPDSKINHSKHLP-VGRKNRIMSVHP--------- 468<br />
Ce AT2 RVDKYTEELGADLIEHGLAGFNVMTY-----TIEKKLDTKTLSAVLMIIVRWRAKAKLGAQ--------- 526<br />
Ce AT3 RVTDYEEQIGADVIEHGLAGTNVARY-----VLEKPLSTRTFQTVTKAITKWKMLAKKKSRQKRMEAAKL 495<br />
Consensus RV E G D HG Y E 84<br />
Ce AT --------------------------EMSIEQLASVYDRSGNIIPMP-----------KKSRTLFTNSAE 521<br />
Ce AT1 --------------------------EMSLEQLASVYDRTG-SVGES-----------DQPKRLFMNQTE 500<br />
Ce AT2 -------------------------RRKKIHDSGSVAPQQAESVEMN-----------VIHRRH------ 554<br />
Ce AT3 KRQEEQETFTNGTAIANGNGNVLHHRTNATESNGTGAPKRSNGPAFNNQITPLAVSSTVSTARNGPSTGR 565<br />
Consensus 84<br />
Ce AT RKMSQMMYD---------------------------------------ENKM------------------ 534<br />
Ce AT1 RRKSRMIEANALHALYLDDNEVPERKNTNPKTVSLQVPTTIIEAAEDEADKMTENDRM------------ 558<br />
Ce AT2 ---------------------------------------------------------------------- 554<br />
Ce AT3 RTESTAIEIEQPIEAVPPEVVAAAVLPPEERPGPSTNSNVSIEASVEKSPSSSTSRRSISIRSSPSIHTV 635<br />
Consensus 84<br />
Ce AT ---------------------------------------------------- 534<br />
Ce AT1 ---------------------------------------------------- 558<br />
Ce AT2 ---------------------------------------------------- 554<br />
Ce AT3 SAISTAAPDSRPSTASATSIISKKSSKNSTVGKFVKAPAPRALSPPDNNPPV 687<br />
Consensus 84<br />
Abb. 51: Alignment des Amoniumtransporter (AT) aus C. elegans (Ce) mit weiteren putativen<br />
Ammoniumtransportern (AT1-3) aus C. elegans. Je nach Konservierungsgrad sind die Aminosäuren<br />
rot (identisch) bzw. blau (strukturell ähnlich) dargestellt. Die Ammoniumtransporter–Signatur<br />
(Konsensussequenz: DxAGxxxVHLxGGxxxxxAxxxxx PR) ist gelb unterlegt. Das<br />
Alignment wurde mit Hilfe des ClustalX-1.81-Programmes (Thompson et al., 1997) erstellt.<br />
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