Funktionelle Analyse von Proteinen der Gpr1/Fun34/yaaH ...

Anlagen
Tab. 22: Verschiedene Topologiemodelle für Ydr384cp. Es sind jeweils die Sequenzen angegeben,
die die Membrandomänen bilden.
Programm Helix 1 Helix 2 Helix 3 Helix 4 Helix 5 Helix 6
TMHMM 85-107 117-139 144-163 178-199 206-228 238-257
HMMTOP 88-105 118-140 145-164 177-199 206-225 238-257
TMpred
(N-Term. innen)
87-105 117-140 144-163 182-199 208-224 235-257
TMpred
90-107 117-136 131-159 182-202 208-228 235-252
(N-Term. außen)
TopPred2 87-107 119-139 143-163 182-202 205-225 237-257
DAS (cutoff 1,7) 91-106 119-143 148-158 182-202 204-227 241-247
249-252
DAS (cutoff 2,2) 94-105 121-141 - 183-200 206-226 -
PSORT II 89-105 124-140 - 182-198 208-224 -
Tab. 23: Verschiedene Topologiemodelle für Ynr002cp. Es sind jeweils die Sequenzen angegeben,
die die Membrandomänen bilden.
Programm Helix 1 Helix 2 Helix 3 Helix 4 Helix 5 Helix 6
TMHMM - 116-138 150-172 182-204 211-230 234-256
HMMTOP 91-110 123-142 155-176 189-208 213-232 245-264
TMpred
(N-Term. innen)
89-107 111-134 150-172 185-205 212-228 239-259
TMpred
92-108 116-134 150-172 185-205 209-228 235-260
(N-Term. außen
TopPred2 89-109 118-138 146-166 - 207-227 239-259
DAS (cutoff 1,7) 99-110 122-141 156-174 190-207 211-233 244-257
DAS (cutoff 2,2) 101-108 123-139 161-171 192-204 213-232 245-256
PSORT II 95-111 123-139 154-170 190-206 213-229 238-254
7.3 Potentielle Modifizierungsorte der Gpr1p-Orthologen in Saccharomyces cerevisiae
Die Gpr1p-Orthologen wurden mit Hilfe des ELM-Servers (Eucaryotic Linear Motif resource
for functional sites; http://elm.eu.org) auf potentielle Modifizierungsorte untersucht. Die Ergebnisse
sind in den folgenden Abbildungen dargestellt.
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