Funktionelle Analyse von Proteinen der Gpr1/Fun34/yaaH ...

-488 AAGTTCTTGA CTACCCCTAT CTCACACTAG TACGTAATTC AATGTATCAT NIT2 ABAA
TTCAAGAACT GATGGGGATA GAGTGTGATC ATGCATTAAG TTACATAGTA STRE (-)
Ergebnisse
-438 TCGTATTGTA AGTAGATAGA GACGCAATAC AGGAAAGCTG ACCTTCCTTC GCR1 HAP234
AGCATAACAT TCATCTATCT CTGCGTTATG TCCTTTCGAC TGGAAGGAAG NIT2 (-)
-388 CAATCACCAC GGCTGAAATG CTTTGTTGAC CAATTACGGA CGCTTAAGAG STE11 HAP234
GTTAGTGGTG CCGACTTTAC GAAACAACTG GTTAATGCCT GCGAATTCTC
-338 CGGACGCGGC TGGAACGGCT CCATCCTAAA TCGGCGGAGG GAGAACTCCG STUAP1 (+/-)
GCCTGCGCCG ACCTTGCCGA GGTAGGATTT AGCCGCCTCC CTCTTGAGGC NIT2 (-)
-288 ATACCAGCCG ACATGGCAAT AATAGTGACA GTAGATGCTA CCAGCCCCGC
TATGGTCGGC TGTACCGTTA TTATCACTGT CATCTACGAT GGTCGGGGCG MIG1 (-)
-238 AATAATTTCA CAGTAGATCA TCAACAGTCT CCTCATTTCT GGAAATGATC HSF5 FacB
TTATTAAAGT GTCATCTAGT AGTTGTCAGA GGAGTAAAGA CCTTTACTAG HSF5 (-)
-188 AGCAACTTCG ACGGATTTAA CTCTCAAGCA GTTACGCACT CCGAGAACAG
TCGTTGAAGC TGCCTAAATT GAGAGTTCGT CAATGCGTGA GGCTCTTGTC
-138 CCGTGATCAT CTTTGAACAA GCAAAATATA TAAAGCAGGA GAACTGTCCT
GGCACTAGTA GAAACTTGTT CGTTTTATAT ATTTCGTCCT CTTGACAGGA
-88 ACCTAGAGCT AGAATAGCCA TAACTAACTA TGTAACATTC TACAGATCAA ABAA
TGGATCTCGA TCTTATCGGT ATTGATTGAT ACATTGTAAG ATGTCTAGTT
-38 TCAAAAACAA TCTTCAATCA CAGAAAAAAA TAAAAGGCAT G Start YNR002c
AGTTTTTGTT AGAAGTTAGT GTCTTTTTTT ATTTTCCG
Abb. 21: Sequenz des YNR002c-Promotorbereiches bis Position -488. Mögliche regulatorische
Sequenzen sind farbig hervorgehoben. NIT2: Bindungsstelle für Nit2p Regulator,
ABAA: Motiv für AbaAp aus A. nidulans, STRE: stress response element,
GCR1: Motiv für Gcr1p Aktivator, HAP234: HAP2/3/4 Motiv, STE11: Motiv für
Transkriptionsaktivator Ste11p aus S. pombe, STUAP1: Bindemotiv für StuAp,
MIG1: Motiv für Mig1p Repressor, HSF5: Bindungsstelle für Hitzeschutzfaktor, (-):
das Motiv liegt in umgekehrter Orientierung vor.
In den Promotoren von YCR010c und YNR002c konnten potentielle Bindungsstellen für
Mig1p identifiziert werden. Mig1p ist für die Repression Glucose-reprimierbarer Gene notwendig
(Nehlin and Ronne, 1990; Lundin et al., 1994; Lutfiyya et al., 1998). Weiterhin enthalten
die Promotoren aller drei Homologen ein Sequenzmotiv für die Bindung von Gcr1p, das
für die positive Regulierung glycolytischer Gene wichtig ist (Holland et al., 1987, Willis et al.,
2003). Ein CSRE-Motiv (carbon source responsive element, Consensussequenz
CCRTYSRNCCG), das nicht in der verwendeten Datenbank aufgeführt ist, konnte im Promotor
von YCR010c identifiziert werden (Schöler and Schüller, 1994). Diese genannten Bindungsstellen
für Transkriptionsfaktoren Mig1p, Gcr1p und das CSRE-Motiv deuten auf eine
Glucose-abhängige Regulation der Promotoren hin.
In allen drei Promotoren wurden ein bzw. mehrere Bindemotive für den FacBp Aktivator aus
Aspergillus nidulans und Neurospora crassa mit der Consensussequenz TCC/G N8-10 C/GGA
gefunden (Todd et al., 1997; Todd et al., 1998; Bibbins et al., 2002). Das FacBp ist in die
Verwertung von Acetat involviert.
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