Funktionelle Analyse von Proteinen der Gpr1/Fun34/yaaH ...

Ergebnisse
Yl Gpr1p -----MNTEIPDLEKQ---------------------QIDHNSG-----SDDPQPIHDDMAPVSRIRSSG 39
Sc Ycr10cp MSDKEQTSGNTDLENA---------------------PAGYYSSHDNDVNGVAEDERPSHDSLGKIYTGG 49
Sc Ynr002cp MSDREQSSGNTAFEN----------------------PKALDSSEGEFISENNDQSRHSQESICKIYTAG 48
Yl Gpr2p ------MSQPIDLERGE------SH--------------SSLNDME---------------KVAQVHTSG 29
Yl Gpr3p ------MSDDLKPHT------------------------SHPQDIETPSSHQDEPV-----VLGRVRTSG 35
Yl Gpr4p ------MTHH-----------------------------DLETGVDSLSSAGMD-------KLMRVVTSG 28
Yl Gpr5p ------MTTLNNSSH------------------------AMASDLDLERGGSTDRI-----SHVENGKDG 35
Yl Gpr6p ------MSHTVDLEHGYSLNHQVSHRSKTQAIDEEAVASSNASNIQGLTGDECSDI-----KLAKVETSG 59
Sc Ydr384cp --MTSSASSPQDLEKG---------------------VNTLENIETLPQQGSIAGVSQGFPNIQEIYSDR 47
Consensus 1
Yl Gpr1p ---PNHEYIHIADQKFHRDDFYRAFG-GTLNPG-GAPQPSRKFGNPAPLGLSAFALTTLVFSLCTVQARG 104
Sc Ycr10cp ---DNNEYIYIGRQKFLKSDLYQAFG-GTLNPG-LAPAPVHKFANPAPLGLSAFALTTFVLSMFNARAQG 114
Sc Ynr002cp ---KNNEYIYIGRQKFLRDDLFEAFG-GTLNPG-LAPAPVHKFANPAPLGLSGFALTTFVLSMFNARAQG 113
Yl Gpr2p ---DNNEYIHIAGNRYHKEDFMRAFG-GTLNPG-SAPMPSRKFGNAAPIGLFSFSITIFILGMCLVNARG 94
Yl Gpr3p ---ERDEYIHIGGVKYHRDDFARAFG-GTLNPG-SAPVPTRQFGNAAPSGLFAFSMTMFILGMCLVNARN 100
Yl Gpr4p ---DNDEYIHLGGHKYHRNELAKAFG-GQFNPG-SAPIPSRKFANTAPIGVFAFSIAIILLGLYLTETRG 93
Yl Gpr5p RVLENGEYLIIAGTRYHRNEFMQAFG-GTLNPG-SAPAPSRKFGNAAPIGLFAFSVTMIILGFCTCGVRG 103
Yl Gpr6p ---TNGEYIHIAGVKYHKDDFMSAFG-GTLNPG-SAPIPSRRFANAAPIGLFSFSITCFILGMCLVNARG 124
Sc Ydr384cp ------DFITLGSSTYRRRDLLNALDRGDGEEGNCAKYTPHQFANPVPLGLASFSLSCLVLSLINANVRG 111
Consensus A G G A F N P G F 9
Yl Gpr1p VPNPSIAVGLALFYGGVCQFAAGMWEFVQENTFGAAALTSYGGFWMSWAAIEMNAFGIKDSYNDP-IEVQ 173
Sc Ycr10cp ITVPNVVVGCAMFYGGLVQLIAGIWEIALENTFGGTALCSYGGFWLSFAAIYIPWFGILEAYEDNESDLN 184
Sc Ynr002cp ITIPNVVVGCAMFYGGLVQLIAGIWEIALENTFGGTALCSFGGFWLSFGAIYIPWFGILDAYKDKESDLG 183
Yl Gpr2p VHAPNVMVGCAIFGGGLVEFTAGIWEIVAENTFAATVFMCFACFWWSWAVLNLP-IGIEKYYATE-EEFM 162
Yl Gpr3p VHAPNVMVGCAFFGGGLIEVIAGIWEIVAENTFAATVFFCFGAFWFSWSMLNFP-IGIEKYYSTP-DEFA 168
Yl Gpr4p IMTPNLVVGNALFGAGLVLFVAGLWEIVAENTFAAIVFMCFSCFWMSYAAINIPWFGIIEAYTDP-GEFA 162
Yl Gpr5p IGAPNVMVGCAIFGGGLCELIAGIWEIVAENTFAACVFLCFSCFWFSWAMLNLP-IGIEKYYATE-DEFA 171
Yl Gpr6p VHAPNVMVGCAIFGGGLVEFVAGIWEIVAENTFAATVFLCFSCFWWSWSLLHLP-IGIEKYYETA-DEFS 192
Sc Ydr384cp VTDGKWALSLFMFFGGAIELFAGLLCFVIGDTYAMTVFSSFGGFWICYGYGLTDTDNLVSGYTDP-TMLN 180
Consensus F G AG T FW Y 17
Yl Gpr1p NAVGIYLFGWFIFTLMLTLCTLKSTVAFFGLFFMLMMTFLVLACANVTQHHGTAIGGGWLGIITAFFGFY 243
Sc Ycr10cp NALGFYLLGWAIFTFGLTVCTMKSTVMFFLLFFLLALTFLLLSIGHFANRLGVTRAGGVLGVVVAFIAWY 254
Sc Ynr002cp NALGFYLLGWALFTFGLSVCTMKSTIMFFALFFLLAVTFLLLSIANFTGEVGVTRAGGVLGVIVAFIAWY 253
Yl Gpr2p QAVGIFLMGWFIFAILMTLCTLKSTVAFFILFVSLDLAVIFLAAGYFNNNPKLLQAGGGFCISTGLLGCW 232
Yl Gpr3p QSVGIFLMGWFIFAFLMTLCTLKATVAFFLLFISLDLALIFLAAGYFQSNSKLTNAGGGFCISTGLLGCW 238
Yl Gpr4p NAMGVYLMVWFAFAVVLTLCTVRATIPFFLLFFFLDLALMFLAIGYFTDNYAFINAGGGFCIACGVMGFW 232
Yl Gpr5p QAVGVFLMGWFVFCVLMTLCTLKATVAFFVMFVSLDLAVIFLAAGNFTGNPRLLVAGGSFCISTGLLGCW 241
Yl Gpr6p QAVGLFLMGWFIFAILMTLCTVKATVAFFLLFCSLDLAIIFLASGHFLNNPKLVQAGGGFCISTGLLGCY 262
Sc Ydr384cp NVIGFFLAGWTVFTFLMLMCTLKSTWGLFLLLTFLDLTFLLLCIGTFIDNNNLKMAGGYFGILSSCCGWY 250
Consensus G L W F CT T F L L GG 29
Yl Gpr1p NAYAGLANPGNSY--IVPVPLDMPFVKKD--- 270
Sc Ycr10cp NAYAGVATKQNSY--VLARPFPLPSTERVIF- 283
Sc Ynr002cp NAYAGIATRQNSY--IMVHPFALPSNDKVFF- 282
Yl Gpr2p NGFSGVATPQSTYKWLIPKAIMMPGAHA---- 260
Yl Gpr3p NGYAGVASPQSTYKWLIPKAVMMPGAHQ---- 266
Yl Gpr4p NAWAGMATADNTFTWLLPGTFMMPWAKKTD-- 262
Yl Gpr5p NAMAGVATPQSTYKWFIPVPIMMPGAHKPKMT 273
Yl Gpr6p NGFGGVATPQSTFTWIIPRAIMMPGAHKKDY- 293
Sc Ydr384cp SLYCSVVSPSNSY--LAFRAHTMPNAP----- 275
Consensus P 30
Abb. 5: Multiples Alignment der Gpr1p-Homologen und –Orthologen in Y. lipolytica (Yl) und
S. cerevisiae (Sc). Je nach Konservierungsgrad sind die Aminosäuren rot (identisch)
bzw. blau (hoch konserviert) hervorgehoben. Das Alignment wurde mit Hilfe
des Programms ClustalW 1 (Thompson et al., 1994) erstellt.
1 http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_clustalw.html
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