Faglig rapport 2005 - Helse Vest

Forskerutdanning - dr.grad 911080:Identifisering av genforandringer, epigenetiske forandringer oggene slicing i relasjon til kjemoresistens ved primær-, samtmetastatisk brystkreft.Prosjektansvarlig: Ranjan Chrisanthar (ranjan.chrisanthar@mbi.uib.no), Helse Bergen HFProsjektet er tilknyttet Kompetansesenter for genterapi.Genforandringer som årsak til kjemoresistans ved primær brystkreftKjemoresistans er hovedårsak til terapisvikt og død ved de fleste kreftsykdommer. Selvom en rekke teorier er utledet på grunnlag av in vitro eksperimenter, har man så langtliten viten om årsakene til kjemoresistans in vivo.Prosjektet tar utgangspunkt i ønske om å kartlegge genforandringer som årsak til resistens motkjemoterapi, spesielt taxaner, ved brystkreft.Gjennom en nasjonal studie har vi tilgang til 115 brystkreft tumores der pasienter er randomisert ogbehandlet prospektivt med taxol, videre et tilsvarende antall pasienter randomisert til primærbehandlingmed epirubicin monotherapi. For tumores i begge armer ønsker vi å karakteriseregenforandringer assosiert med manglende respons. Ved at de pasienter som ikke responderte påprimærbehandling ble krysset over til den andre behandlingsarm, gir dette mulighet for å evaluererespons / manglende respons på det alternative regime hos de som oppviste primærresistens.Resultat så langt: Total RNA og genomisk DNA er blitt renset. cDNA er blitt syntetisert. Det er gjortmutasjonsanalyse av TP53, PTEN, CHK2, p14, p16 og andre gen kandidater i TP53 kaskaden vedsekvens analyse. Funn er blitt verifisert med uavhengig cDNA.Det er også gjort endel hypermetylerings analyse for aktuelle genkandidater. I det påfølgende arbeidvil det bli gjort genanalyser og funksjonelle studier som er direkte knyttet til funn som er oppdagetved genanalyse.Preliminære data foreligger allerede for taxol-armen, og viser interessante funn, i det det ser ut til åforeligge gen-assosiasjoner som ikke er påvist tidligere. Samtidig med at vi planlegger publisering avde første delfunn i 2006 pågår det videre arbeidet med analyser av andre mulige gener.149