Faglig rapport 2005 - Helse Vest

Forskerutdanning - dr.grad 911164:Anvendelse af mikromatriseteknologi ved psykomotoriskudviklingshæmningProsjektansvarlig: Helle Lybæk (hlyb@helse-bergen.no), Helse Bergen HFPå leting etter kromosomfeilFor å være i stand til å stille den riktige diagnose er det viktig at man har godediagnostiske metoder til rådighet. Dette prosjekt går ut på å utvikle nye metoder forundersøkelse av kromosomene, hvilket vil forbedre det diagnostiske tilbud for pasientermed psykomotorisk utviklingshemning.Barn og voksne med psykomotorisk utviklingshemning utgjør ca. 2 % av vår befolkning. Som oftestskyldes utviklingshemningen en feil i pasientens kromosomer, som ved den mest kjente type forutviklingshemning, Down Syndrom, som skyldes en ekstra kopi av kromosom 21. En viktig del av denkliniske virksomhet ved Senter for medisinsk genetikk og molekylærmedisin, HaukelandUniversitetssykehus, går ut på å undersøke kromosomene hos pasientene i denne gruppen. Hvis vifinner en feil i pasientens kromosomer, kan vi derved gi pasienten – eller de pårørende - en forklaringpå hvorfor utviklingshemningen er oppstått.På bakgrunn av dette ble doktorgradsprosjekt startet opp februar 2005 med følgende tittel:”Anvendelse av mikromatriseteknologi ved psykomotorisk utviklingshemning”. Hovedformålet er åutvikle nye kromosomundersøkelses metoder, slik at pasienter med psykomotorisk utviklingshemningkan få et bedre diagnostisk tilbud.For å være i stand til å oppdage en feil i kromosomene, er det helt avgjørende at de undersøkelsesmetoder vi bruker er følsomme nok til at feilen blir funnet. På grunn av begrenset følsomhet ved deanalysemetoder vi bruker i dag, er det dessverre ofte at kromosomfeilen som ligger til grunn forpasientens utviklingshemning ikke blir funnet. Det er derfor et stort behov for å utvikle nye og merfølsomme metoder til å undersøke kromosomene med, slik at enda flere pasienter, og derespårørende, kan få en forklaring på hvorfor utviklingshemningen er inntruffet.Til leting etter små kromosomfeil, benytter vi oss pr i dag av en avansert mikroskopbasert metode derkalles Komparativ genomisk hybridisering (CGH). I løpet av de siste årene er det kommet ny teknologisom gjør det mulig å finne kromosomfeil der er mindre enn det der kan detekteres med CGHmetoden.Den nye teknologien baserer seg på bruken av mikromatriser (også kallet DNA-chips),hvilket forbedrer følsomheten for oppdagelse av kromosomfeil betydelig. Metoden for undersøkelse avkromosomene som er basert på mikromatriser kalles Array-CGH.I doktorgradsprosjektet har vi undersøkt nær 100 prøver fra pasienter med psykomotoriskutviklingshemning ved hjelp av 1Mb Array-CGH metoden. Hovedparten av prøvene var tidligereundersøkt for kromosomfeil ved hjelp av CGH metoden. Resultatene fra studiet viser:• Array-CGH metoden var i stand til å finne alle de kromosomfeil som var funnet ved CGHmetoden.• Array-CGH metoden i stand til at finne nye kromosomfeil som CGH metoden ikke kunneoppdage, på grunn av begrenset størrelse på kromosomfeilen.• Array-CGH metoden gjorde oss i flere tilfelle i stand til at forklare hvordan kromosomfeilen varoppstått.• Array-CGH metoden gir i forhold til CGH metoden bedre informasjon om den nøyaktigestørrelsen på kromosomfeilen og den presise lokalisering hvor feilen er på kromosomet. Dettehar meget stor betydning når man ønsker å undersøke hvilke gener som befinner seg i detområde hvor kromosomfeilen er.276