THESE Maryse Bonnin Jusserand - Université de Bourgogne
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Synthèse bibliographique<br />
Des PCR multiplex ont également été mises au point pour détecter aisément en une<br />
seule expérience, les producteurs d’amines biogènes potentiellement présents dans une<br />
matrice alimentaire complexe (Coton & Coton, 2005 ; De Las Rivas et al, 2006). Cette<br />
technique consiste à mélanger plusieurs couples d’amorces pour détecter la présence <strong>de</strong><br />
différents gènes en même temps. Une souche peut produire plusieurs types d’amines biogènes<br />
telle que Lactobacillus 30a qui produit à la fois l’histamine et la putrescine. La PCR<br />
multiplexe représente donc un gain <strong>de</strong> temps comparé à la PCR classique.<br />
La quantification par qPCR, permet d’estimer le nombre <strong>de</strong> bactéries productrices.<br />
Nannelli et al (2008) a développé cette métho<strong>de</strong> pour énumérer les bactéries lactiques du vin<br />
productrices d’histamine, <strong>de</strong> tyramine et <strong>de</strong> putrescine. Pour cela <strong>de</strong>s amorces ont été<br />
<strong>de</strong>ssinées par rapport à la similitu<strong>de</strong> <strong>de</strong>s séquences nucléotidiques <strong>de</strong>s gènes, codant les<br />
décarboxylases i<strong>de</strong>ntifiés chez différentes bactéries lactiques. Par cette même technique,<br />
La<strong>de</strong>ro et al (2010) détectent et quantifient spécifiquement les entérocoques ainsi que<br />
Lactobacillus brevis et Lactobacillus curvatus, producteurs <strong>de</strong> tyramine dans le fromage. Une<br />
métho<strong>de</strong> similaire a <strong>de</strong>rnièrement été décrite par La<strong>de</strong>ro et al (2011) pour la détection et la<br />
quantification <strong>de</strong>s bactéries productrices isolées du cidre.<br />
Enfin la RT-qPCR permet <strong>de</strong> quantifier l’expression <strong>de</strong>s gènes impliqués dans la<br />
production d’amines biogènes. Dans le lait et le fromage, le couple Hdc1/ Hdc2 est employé<br />
pour quantifier l’expression du gène hdcA (Fernan<strong>de</strong>z et al, 2006 ; La<strong>de</strong>ro et al, 2009). Le<br />
développement <strong>de</strong> cette métho<strong>de</strong> ne s’arrête pas aux souches productrices d’histamine, mais<br />
est également appliquée aux bactéries à Gram positif productrices <strong>de</strong> tyramine (Torriani et al,<br />
2008). La présence du gène codant la décarboxylase est corrélée à la production d’amines<br />
biogènes.<br />
B. Quantification <strong>de</strong>s amines biogènes<br />
Parallèlement à la détection <strong>de</strong>s microorganismes producteurs d’amines biogènes, il<br />
est important <strong>de</strong> doser ces métabolites. A cette fin, <strong>de</strong> nombreuses métho<strong>de</strong>s analytiques ont<br />
été développées et <strong>de</strong>s exemples sont décrits dans le paragraphe qui suit.<br />
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