THESE Maryse Bonnin Jusserand - Université de Bourgogne

Synthèse bibliographique
Les simples et doubles recombinants sont résistants à la tétracycline. Cependant, les doubles
recombinants sont également sensibles à l’érythromycine (Em r , cassette de résistance portée
par le plasmide), ce qui permet de les différencier des simples recombinants.
D’autres vecteurs basés sur la même stratégie de mutation ont été développés pour les
bactéries à Gram positif qui ne sont pas transformables naturellement. Ainsi, le pMAD a été
utilisé avec succès chez S. aureus, L. monocytogenes et B. cereus (Arnaud et al, 2004).
III. Transferts génétiques chez O. oeni
A. Les plasmides natifs de O.oeni
L’obtention de transformants ou de transconjugants est en partie dépendante des
plasmides natifs de la souche réceptrice, car chaque plasmide appartient à un groupe
d’incompatibilité. Or, deux plasmides du même groupe ne peuvent co-exister dans une
cellule. La connaissance des plasmides natifs d’une bactérie est donc importante avant la
transformation, afin d’éviter les transferts caduques. Cependant, ces plasmides cryptiques sont
souvent instables et que les souches de laboratoire en sont généralement dénuées.
Brito et al (1999) se sont intéressés à l’ADN extrachromosomique de O. oeni. Sur
trente souches, dix huit contenaient un large plasmide de 40 kpb et cinq autres souches
contenaient de plus petits plasmides, de taille variant entre 2,5 et 4,5 kpb. L’électrophorèse en
champ pulsé (PFGE : pulsed-field gel electrophoresis) constitue une première approche pour
l’étude de ces plasmides, permettant la résolution de grandes molécules d’ADN, d’identifier
leur topologie et ainsi de confirmer leur nature plasmidique. Un grand plasmide, le pOg25 (37
kpb) a pu être isolé. L’étude révèle que les grands plasmides sont fréquents chez O. oeni mais
difficiles à détecter et à extraire, car présents en faible nombre de copies. De plus, les auteurs
supposent un curage rapide et spontané de ces éléments génétiques mobiles.
D’autres petits plasmides ont été décrits chez O. oeni, comme le pLo13 (Fremaux et
al, 1993), le pOg32 (Brito et al, 1996) et le p4028 (Zuniga et al, 2006). De plus, une série de
plasmide cryptiques nommés pRS1 (2523 pb), pRS2 (2544 pb) (Figure 15) et pRS3 (3948 pb)
ont été séquencés (Alegre et al, 1998 ; Mesas et al, 2001). Ils se répliquent selon le mode en
cercle roulant et sont constitués de trois ORF (ORF1, ORF2, ORF3). Les deux premières
ORF (Open Reading Frame) codent respectivement une protéine intervenant dans la
réplication (Rep) et dans la recombinaison (Pre). La troisième ORF code une protéine de
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