THESE Maryse Bonnin Jusserand - Université de Bourgogne
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Matériels et métho<strong>de</strong>s<br />
A. Construction <strong>de</strong>s vecteurs pGID052-hdcAB et pGID052hdcPAB<br />
Les vecteurs pGID052-hdcAB et pGID052-hdcPAB contiennent respectivement les<br />
gènes hdcA et hdcB ou les gènes hdcP, hdcA et hdcB <strong>de</strong> Lactobacillus hilgardii 0006,<br />
impliqués dans la production d’histamine.<br />
1) Construction du vecteur pGID052-hdcAB<br />
Le fragment hdcAB <strong>de</strong> 2198 pb a été amplifié avec les amorces hdcA5’-2 et hdcB3’-2,<br />
à l’ai<strong>de</strong> <strong>de</strong> la Taq haute fidélité (Roche) ; puis cloné dans le pCR2.1-TOPO (Invitrogen),<br />
selon les recommendations du fournisseur. Après transformation <strong>de</strong>s bactéries E. coli Match 1<br />
(fournies avec le kit), les cellules sont étalées sur milieu LB contenant 100 µg.mL -1<br />
d’ampicilline, en présence <strong>de</strong> X-gal (40 µg.mL -1 ), ce qui permet une sélection blanc/bleu <strong>de</strong>s<br />
clones. Les clones obtenus sont repiqués, puis une minipréparation d’ADN plasmidique est<br />
effectuée. Les plasmi<strong>de</strong>s sont vérifiés par PCR puis séquençage. Le clone pTOPO-hdcAB<br />
obtenu est ensuite digéré par SmaI et SacI, et le fragment hdcAB est excisé sur gel et purifié.<br />
Il est ensuite cloné dans le pGID052, digéré préalablement par SacI et SmaI. Les bactéries E.<br />
coli EC101 électrocompétentes sont électroporées avec 1/5 ème <strong>de</strong> la réaction <strong>de</strong> ligation, puis<br />
étalées sur milieu LB contenant 250 µg.mL -1 d’érythromycine.<br />
2) Construction du vecteur pGID052-hdcPAB<br />
Le clonage du fragment hdcPAB contenant 3958 pb, <strong>de</strong> L. hilgardii 0006 dans le<br />
pGID052, s’est effectué en <strong>de</strong>ux parties (Figure 17). Dans un premier temps un fragment A <strong>de</strong><br />
1446 pb correspondant à hdcP a été amplifié à partir <strong>de</strong> l’ADN <strong>de</strong> Lactobacillus hilgardii<br />
0006 avec les amorces A5’ et A3’, et un second fragment B <strong>de</strong> 2512 pb correspondant à hdcA<br />
et hdcB a été amplifié avec les amorces B5’ et B3’. Ces <strong>de</strong>ux fragments (A et B) ont ensuite<br />
été clonés dans le pCR-XL-TOPO (Invitrogen) suivant les recommandations du fournisseur.<br />
Les clones portant les plasmi<strong>de</strong>s recombinants pTOPO-hdcP et pTOPO-hdcAB ont été<br />
sélectionnés après vérification <strong>de</strong>s inserts par PCR et séquençage (Beckman Coulter<br />
Genomics). Puis le vecteur pTOPO-hdcP a été digéré par les enzymes SalI et KpnI tandis que<br />
pTOPO-hdcAB a été digéré par KpnI et SacI. Les fragments hdcP et hdcAB ont ensuite été<br />
séparés sur gel d’agarose 0,9%, les ban<strong>de</strong>s correspondantes ont été découpées et purifiées<br />
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