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THESE Maryse Bonnin Jusserand - Université de Bourgogne

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Table <strong>de</strong>s figures<br />

mobilisable (ou conjugatif) au site oriT. L’ADN transféré est monocaténaire. 3 : après ligation<br />

<strong>de</strong>s brins d’ADN, 4 : ils sont répliqués dans chacune <strong>de</strong>s cellules. .......................................... 56<br />

Figure 14. Stratégie générale d’intégration par double recombinaison homologue (Biswas et<br />

al, 1993). Dans une première étape à 37,5°C, le plasmi<strong>de</strong> s’intègre par simple recombinaison<br />

homologue. Puis, un changement <strong>de</strong> température à 28°C, active la réplication du plasmi<strong>de</strong><br />

intégré (Ori Ts), stimulant un second évenement <strong>de</strong> recombinaison homologue. .................... 61<br />

Figure 15. Carte du plasmi<strong>de</strong> cryptique pRS2 <strong>de</strong> O. oeni (Mesas et al, 2001) ........................ 63<br />

Figure 16. L. hilgardii 0006 (Lucas et al, 2005) producteur d’histamine, dans le milieu <strong>de</strong><br />

Bover-Cid & Holzapfel (1999) contenant du pourpre <strong>de</strong> bromocrésol comme indicateur<br />

coloré. A gauche: tube ensemencé avec L. hilgardii 0006 : le milieu vire au mauve du à<br />

l’activité décarboxylase qui induit une alcalinisation du pH. A droite : milieu avant<br />

ensemencement. ........................................................................................................................ 67<br />

Figure 17. Stratégie <strong>de</strong> clonage <strong>de</strong>s gènes hdcP, hdcA et hdcB. Les fragments A et B sont<br />

d’abord sous-clonés dans le pCR-XL-TOPO, avant d’être clonés dans le pGID052. .............. 74<br />

Figure 18. Stratégie <strong>de</strong> clonage <strong>de</strong>s gènes odc et potE. ............................................................ 75<br />

Figure 19. Stratégie <strong>de</strong> clonage du gène hisRS dans le pXT en <strong>de</strong>ux parties. ......................... 76<br />

Figure 20. Test <strong>de</strong> clones <strong>de</strong> B. subtilis pour une intégration au site amyE. Les colonies avec<br />

un halo n’ont pas intégrées les gènes d’intérêt. ........................................................................ 77<br />

Figure 21. Evolution du pourcentage du solvant B au cours <strong>de</strong> l’analyse. ............................... 81<br />

Figure 22. PCR en temps réel en présence <strong>de</strong> SYBR green (www.ilm.pf/PCRtempsreel) ...... 87<br />

Figure 23. Organisation génétique <strong>de</strong> la voie <strong>de</strong> biosynthèse <strong>de</strong> l’histamine. Les gènes hdcP,<br />

hdcA et hdcB ont été clonés dans le pGID052 chez O. oeni. Le gène hisRS co<strong>de</strong> pour une<br />

histidyl-tRNA synthétase .......................................................................................................... 93<br />

Figure 24. Cartes plasmidiques <strong>de</strong>s vecteurs pGID052-hdcAB et pGID052-hdcPAB ............ 94<br />

Figure 25. Clonage <strong>de</strong>s régions promotrices <strong>de</strong> hdcP et hdcA dans le pDL. Le nombre <strong>de</strong><br />

paires <strong>de</strong> bases entre chaque gène correspond à la taille <strong>de</strong>s régions intergéniques. ............... 96<br />

Figure 26. Carte du pDL-hdcP et du pDL-hdcAB: la région promotrice <strong>de</strong> hdcP et hdcA a été<br />

clonée en fusion avec le gène codant la β-galactosidase (bgaB) .............................................. 96<br />

Figure 27. Mesure chez B. subtilis <strong>de</strong> l’activité spécifique <strong>de</strong> la β-galactosidase (Umiller.mg -<br />

1 ), <strong>de</strong>s fusions transcriptionnelles portées par les vecteurs pDL, pDL-hdcAB et pDL-hdcP, en<br />

fonction <strong>de</strong> la croissance bactérienne (t1 : DO600nm = 0,6 ; t2 : DO600nm = 1,2 ; t3 : DO600nm =<br />

2,6) ............................................................................................................................................ 97<br />

Figure 28. Carte du vecteur pXT-hisRS ................................................................................... 98<br />

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