PhylogÃ©nie Et Evolution Du Comportement Social Chez Les Blattes ...

More documents

Recommendations

Info

Ev o l u t i o n d u c o m p o r t e m e n t s o c i a lla liste des espèces intégrées dans cette étude et les marqueurs moléculaires obtenus.Les 78 caractères morphologiques définis par Grandcolas (1993b) ont également étéutilisés dans cette étude phylogénétique. Seules les données morphologiques de 18 espèces,celles pour lesquelles des données moléculaires ont été obtenues, ont été conservées.Tableau III.2 : Tableau récapitulatif des espèces de blattes intégrées dans cette étude et des différents gènes obtenus pour chaquetaxon (en vert).Espèces Familles Sous-familles 12S 16S 18S 28S COI COIIEctobius sylvestris Blattellidae EctobiinaeBlattella germanica Blattellidae BlattellinaeParcoblatta uhleriana Blattellidae BlattellinaeParatemnopteryx collonianie Blattellidae BlattellinaeLoboptera decipiens Blattellidae BlattellinaeXestoblatta cavicola Blattellidae BlattellinaeIsoldaia sp Pseudophyllodromiidae PseudophyllodromiinaeDendroblatta sp Pseudophyllodromiidae PseudophyllodromiinaeSupella longipalpa Pseudophyllodromiidae PseudophyllodromiinaeArchimandrita tessellata Blaberidae BlaberinaeBlaberus discoidalis Blaberidae BlaberinaeEublaberus distanti Blaberidae BlaberinaeMonastria sp Blaberidae BlaberinaeParadicta rotunda Blaberidae BlaberinaePhoetalia pallida Blaberidae BlaberinaeCalolampra sp Blaberidae DiplopterinaeDiploptera punctata Blaberidae DiplopterinaeEpilampra sp Blaberidae EpilamprinaeRhabdoblatta formosana Blaberidae EpilamprinaeGeoscapheus woodwardi Blaberidae GeoscapheinaeMacropanesthia rhinoceros Blaberidae GeoscapheinaeGyna capucina Blaberidae GyninaeGromphadorhina portentosa Blaberidae OxyhaloinaeHenschoutedenia sp Blaberidae OxyhaloinaeNauphoeta cinerea Blaberidae OxyhaloinaePanchlora nivea Blaberidae PanchlorinaeAncaudellia shawi Blaberidae PanesthiinaeCaeparia crenulata Blaberidae PanesthiinaeMiopanesthia deplanata Blaberidae PanesthiinaePanesthia cribrata Blaberidae Panesthiinae106
III. Réversibilité, c o n t r a i n t e s e t e x a p t a t i o n c h e z l e s b l at t e s z e t o b o r i n a eEspèces Familles Sous-familles 12S 16S 18S 28S COI COIIGenre non identifié Blaberidae PanesthiinaeSalganea esakii Blaberidae PanesthiinaeLaxta sp Blaberidae PerisphaeriinaePseudoglomeris sp Blaberidae PerisphaeriinaeTrichoblatta pygmaea Blaberidae PerisphaeriinaePycnoscelus surinamensis Blaberidae PycnoscelinaeLanxoblatta emarginata Blaberidae ZetoborinaeParasphaeria boleiriana Blaberidae ZetoborinaePhortioeca nimbata Blaberidae ZetoborinaeSchultesia lampyridiformis Blaberidae ZetoborinaeThanatophyllum akinetum Blaberidae ZetoborinaeZetobora sp Blaberidae Zetoborinaeǲǲ Méthodes phylogénétiquesLes analyses phylogénétiques ont été réalisées en utilisant la méthode d’optimisationdirecte (Wheeler, 1996), telle qu’elle est implémentée dans le programme POY 4 (Wheeler etal., 2006). Les analyses séparées et combinées ont été réalisées sur divers postes informatiquesindividuels et diverses versions de POY 4 ont été utilisées, ce dernier étant en cours dedéveloppement. Cependant, l’utilisation de différentes versions n’a engendré aucun biais dansles résultats d’analyse. Les séquences de la grande sous-unité ribosomique nucléaire (28S)ont été partitionnées en quatre fragments (approximativement les régions A, B, C et DEF)correspondant aux quatre régions séquencées séparément et non chevauchantes. Toutes lesséquences ribosomiques (12S, 16S, 18S et 28S) ont été alignées de manière préliminaire avecMuscle v3.6 (Edgar, 2004), puis les séquences de 16S, de18S, de 28SA et de 28SDEF ont étépartitionnées en fonction de régions hautement conservées. Cette pratique permet de réduirele temps de traitement des analyses phylogénétiques et évite au logiciel de considérer, à tort,des portions de séquences comme homologues en cas de données manquantes. La stratégie derecherche pour chaque analyse séparée a consisté à construire 100 arbres de Wagner sur lesquelsdu réarrangement de branches (TBR) a été effectué. Les 100 arbres ainsi obtenus étaient alors107
Page 1:
UFR des Sciences de la VieEcole Doc
Page 4 and 5:
Je remercie toutes les personnes av
Page 7 and 8:
Ta b l e d e s Mat i è r e sRe m e
Page 9 and 10:
Données moléculaires sans les sé
Page 11:
Ch a p i t r e V : Di s c u s s i o
Page 14 and 15:
Figure 3.10 : Analyse cladistique d
Page 17 and 18:
Li s t e d e s Ta b l e au xTableau
Page 19:
In t r o d u c t i o nNothing in bi
Page 22 and 23:
Ev o l u t i o n d u c o m p o r t
Page 24 and 25:
Page 27 and 28:
I. An a ly s e d u c o n t e x t e
Page 29 and 30:
Page 31 and 32:
Page 33:
Page 36 and 37:
Page 38 and 39:
Page 40 and 41:
Page 42 and 43:
Page 44 and 45:
Page 46 and 47:
Page 48 and 49:
Page 50 and 51:
Page 52 and 53:
Page 54 and 55:
Page 56 and 57:
Page 58 and 59:
Page 61 and 62:
II. Mat é r i e l s e t m é t h o
Page 63 and 64:
Page 65:
ABCDEGHFJIK
Page 68 and 69:
Page 71 and 72:
Page 73 and 74: II. Mat é r i e l s e t m é t h o
Page 111: II. Mat é r i e l s e t m é t h o
Page 115 and 116: III. Réversibilité, c o n t r a i
Page 123: III. Réversibilité, c o n t r a i
Page 175 and 176:
III. Réversibilité, c o n t r a i
Page 177 and 178:
Page 179 and 180:
Page 181 and 182:
Page 183 and 184:
Page 185 and 186:
Page 187:
CHAPITRE IVEv o l u t i o n d e s c
Page 190 and 191:
Page 192 and 193:
Page 194 and 195:
Page 196 and 197:
Page 198 and 199:
Page 200 and 201:
Page 202 and 203:
Page 204 and 205:
Page 206 and 207:
Page 208 and 209:
Page 210 and 211:
Page 212 and 213:
Page 214 and 215:
Page 216 and 217:
Page 218 and 219:
Page 220 and 221:
Page 222 and 223:
Page 224 and 225:
Page 226 and 227:
Page 228 and 229:
Page 230 and 231:
Page 232 and 233:
Page 234 and 235:
Page 236 and 237:
Page 238 and 239:
Page 240 and 241:
Page 242 and 243:
Page 244 and 245:
Page 246 and 247:
Page 248 and 249:
Page 250 and 251:
Page 252 and 253:
Page 254 and 255:
Page 256 and 257:
Page 259 and 260:
V. Dis c u s s ion g é n é r a l
Page 261 and 262:
Page 263 and 264:
Page 265 and 266:
Page 267 and 268:
Page 269 and 270:
Page 271:
Page 274 and 275:
Ré f é r e n c e s b i b l i o g
Page 276 and 277:
Page 278 and 279:
Page 280 and 281:
Page 282 and 283:
Page 284 and 285:
Page 286 and 287:
Page 288 and 289:
Page 291 and 292:
ANNEXE IDéf i n i t i o n s deq u
Page 293 and 294:
ANNEXE IIPr o t o c o l e d’ex t
Page 295 and 296:
ANNEXE IIILeg e n d r e et al . (Bi
Page 297 and 298:
An n e x e sAbstractA new method is
Page 299 and 300:
An n e x e sexpressed in such non-s
Page 301 and 302:
An n e x e sanother species would a
Page 303 and 304:
An n e x e sMolecular data for all
Page 305 and 306:
An n e x e sevolutionary ecological
Page 307 and 308:
An n e x e sThe comparison of the t
Page 309 and 310:
An n e x e sDefining and including
Page 311 and 312:
An n e x e s“avoiding” acts (GD
Page 313 and 314:
An n e x e sGautier JY, Deleporte P
Page 315 and 316:
An n e x e sMcLennan DA, Brooks DR,
Page 317 and 318:
An n e x e sWenzel JW. 1993. Applic
Page 319 and 320:
An n e x e sTable 1: PCR primers na
Page 321 and 322:
An n e x e sTable 4: Phylogenetic a
Page 323 and 324:
An n e x e sPhortioeca nimbataP.n.
Page 325 and 326:
An n e x e sSchultesia lampyridifor
Page 327 and 328:
An n e x e sSpecies 1 = outgroupInd
Page 329:
An n e x e sAnalysis AEublaberus di
Page 332 and 333:
Page 334 and 335:
Page 336 and 337:
Page 338 and 339:
Page 340 and 341:
Page 342 and 343:
Page 344 and 345:
Page 346 and 347:
Page 348 and 349:
Page 350 and 351:
Page 352 and 353:
Page 354 and 355:
Page 356 and 357:
Page 358 and 359:
Page 360 and 361:
Page 362 and 363:
Page 364 and 365:
Page 366 and 367:
Page 368 and 369:
Page 370 and 371:
Page 372 and 373:
Page 374 and 375:
Page 376 and 377:
Page 378 and 379:
Page 380 and 381:
Page 382 and 383:
igureEv o l u t i o n d u c o m p o
Page 384 and 385:
FigureEv o l u t i o n d u c o m p
Page 386 and 387:
Figure Ev o l u t i o n d u c o m p
Page 388 and 389:
FigureEv o l u t i o n d u c o m p
Page 390 and 391:
Page 392 and 393:
ablesEvo l u t i o n d u c o m p o
Page 395 and 396:
ANNEXE VICom m a n d e s de s an a
Page 397:
An n e x e sCommandes relatives à
Page 400 and 401:
Page 402 and 403:
Page 404 and 405:
Page 406 and 407:
Page 408 and 409:
Page 410 and 411:
Page 412 and 413:
Page 415 and 416:
ANNEXE XIICur r i c u l u m Vi t a
Page 417 and 418:
An n e x e s
Page 419 and 420:
An n e x e s
Page 421 and 422:
Ré s u m éPh y l o g é n i e e t
show all

PhylogÃ©nie Et Evolution Du Comportement Social Chez Les Blattes ...

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?