Phylogénie Et Evolution Du Comportement Social Chez Les Blattes ...

III. Réversibilité, c o n t r a i n t e s e t e x a p t a t i o n c h e z l e s b l at t e s z e t o b o r i n a eIII.2.4. DiscussionDzDz Information apportée par les différents marqueurs moléculairesLes échantillonnages taxonomique et de caractères influent beaucoup sur les résultatsdes analyses phylogénétiques. Il a été montré l’importance d’avoir un échantillon taxonomiquesuffisamment grand pour représenter la diversité du groupe que l’on étudie et ainsi limiter lesartefacts de reconstruction (Pollock et al., 2002 ; Zwickl et Hillis, 2002). Cependant, plus lenombre de taxons augmente, plus le nombre de nœuds à documenter sur l’arbre augmenteégalement. Accroître son échantillonnage taxonomique nécessite donc un échantillonnageplus important de caractères. Dans cette optique, les caractères moléculaires sont devenus deplus en plus utilisés en phylogénie. Néanmoins, certains marqueurs moléculaires évoluentplus rapidement que les autres. Utiliser des marqueurs évoluant lentement ne semble donc pastrès pertinent pour réaliser une analyse à échelle relativement restreinte, c’est-à-dire pour desévènements relativement récents, et inversement. Toutefois, reconstruire une phylogénie ne serésume pas à s’intéresser à des évènements anciens ou récents mais à un ensemble d’évènementss’étant déroulés au cours d’une période de temps plus ou moins étendue. Dans ce contexte, desapproches utilisant divers marqueurs phylogénétiques se sont multipliées. Classiquement, lepari réalisé est le suivant : les marqueurs les plus lents vont nous renseigner sur les évènementsles plus anciens, les marqueurs les plus rapides vont nous renseigner sur les évènements lesplus récents, le tout formant un résultat cohérent aux différents niveaux de l’arbre.Les gènes retenus pour cette étude présentent des propriétés variées : gènesmitochondriaux, gènes nucléaires, gènes codants, gènes ribosomiques. Ils sont donc soumisà des pressions diverses et présentent certainement des vitesses d’évolution différentes, ycompris pour leurs propres différentes régions. Cette vitesse d’évolution peut être évaluée enregard du degré de conservation des séquences. Les calculs présentés dans le Tableau III.3127