Phylogénie Et Evolution Du Comportement Social Chez Les Blattes ...

II. Mat é r i e l s e t m é t h o d e sclairement observés et décrits comme une succession d’actes. Une séquence comportementaleest donc une série ordonnée d’actes comportementaux exprimés par un ou plusieurs individus.Si cette série d’actes est assez standardisée, alors on parlera de séquences comportementalesstéréotypées. Dans le cas contraire, on parlera de séquences non-stéréotypées. La descriptiondes comportements sous la forme de séquence permet d’affiner les hypothèses d’homologieset de perfectionner leur analyse phylogénétique notamment grâce à des outils développés pourl’analyse de séquences.II.4.2. L’analyse phylogénétique de séquences comportementalesstéréotypéesNous avons vus que des algorithmes de comparaisons de séquences avaient été produitset utilisés en phylogénie moléculaire. Certains de ces algorithmes ont été appliqués à laclassification des données comportementales afin de réaliser des comparaisons de séquencesdans une même espèce (Abbott, 1995 ; Wilson et al., 1999 ; Hay et al., 2003 ; van derAalst et al., 2003). Comme pour les séquences nucléotidiques, l’alignement des séquencescomportementales se révèle problématique dès lors que ces dernières ont des longueurstrès différentes. De telles séquences peuvent être analysées à l’aide de l’optimisation directe(Wheeler, 1996). Cette analyse peut être en outre réalisée dans un contexte phylogénétiqueoù chaque séquence correspond à un taxon particulier. Cela a été démontré avec l’exemple deséquences comportementales de chants de grillons (Robillard et al., 2006). Dans cette étude,nous avons montré comment les chants pouvaient être décrits d’une manière plus préciseet comment cette méthodologie utilisait tout le contenu informatif au sens phylogénétiquedes données comportementales. Une telle méthode peut être utilisée avec d’autres types deséquences stéréotypées telles que des séquences ontogénétiques (Schulmeister et Wheeler,2004) comme celles du développement des termites (cf. IV.4. Ev o l u t i o n d u p o ly p h é n i s m e :79