Mechanistische Analysen zu Krankheits-korrelierten SNPs in ...
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A.6 Tabellenverzeichnis<br />
3.9 Sequenzier-Primer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25<br />
3.10 Mutagenese-Primer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25<br />
3.11 T7 Promotorsite-Primer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26<br />
3.12 Prob<strong>in</strong>g-Primer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26<br />
3.13 qRT-PCR-Primer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27<br />
3.14 Plasmide . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27<br />
3.15 Kits . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28<br />
3.16 Enzyme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29<br />
3.17 Größenmarker . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29<br />
3.18 Zellkulturmedien . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30<br />
3.19 E.coli Stämme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30<br />
3.20 Puffer und Lösungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30<br />
4.1 Programm der Mutagenese-PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34<br />
4.2 PCR-Programm <strong>zu</strong>m Anfügen der T7 Promotorsite . . . . . . . . . . . . . . . 35<br />
4.3 Programm der Kolonie-PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35<br />
4.4 qPCR: Reaktionsansatz und PCR-Programm . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36<br />
4.5 Sequenzier-PCR: Reaktionsansatz und PCR-Programm . . . . . . . . . . . . 37<br />
4.6 10×dNTP-Mix Zusammenset<strong>zu</strong>ngen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38<br />
4.7 Übersicht klonierter Inserts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39<br />
4.8 Übersicht verwendeter Restriktionsenzyme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44<br />
4.9 Spezifität verwendeter Prob<strong>in</strong>g-Agenzien . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48<br />
4.10 Übersicht der Reaktionsansätze des Anneal<strong>in</strong>gs mit anschließendem Strukturprob<strong>in</strong>g<br />
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52<br />
4.11 Übersicht verwendeter Zelll<strong>in</strong>ien. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52<br />
4.12 Übersicht verwendeter Onl<strong>in</strong>e-Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55<br />
4.13 Übersicht verwendeter Programme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56<br />
5.1 Übersicht der analysierten <strong>SNPs</strong> aus der Literatur . . . . . . . . . . . . . . . 58<br />
5.2 Übersicht der analysierten <strong>SNPs</strong> aus der MKII . . . . . . . . . . . . . . . . . 58<br />
5.3 Ergebnisse der AGTR1 Sekundärstrukturvorhersage . . . . . . . . . . . . . . 67<br />
5.4 Ratenkonstanten des AGTR1 siRNA-Anneal<strong>in</strong>gs . . . . . . . . . . . . . . . . 72<br />
5.5 Ergebnisse der ESR1 RNA Sekundärstrukturvorhersage . . . . . . . . . . . . 81<br />
5.6 Übersicht der SNP-Lokalisation weiterer analysierter <strong>SNPs</strong> . . . . . . . . . . 85<br />
5.7 Übersicht der miRNA B<strong>in</strong>destellen <strong>in</strong>nerhalb der Ziel-Gen 3’-UTRs . . . . . . 86<br />
5.8 Ergebnisse der c17orf39 Sekundärstrukturvorhersage . . . . . . . . . . . . . 87<br />
5.9 Ergebnisse der NT5C2 Sekundärstrukturvorhersage . . . . . . . . . . . . . . 87<br />
5.10 Ergebnisse der SLC22A3 Sekundärstrukturvorhersage . . . . . . . . . . . . . 88<br />
5.11 Ergebnisse der MRAS Sekundärstrukturvorhersage für die SNP-Position . . 92<br />
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