Mechanistische Analysen zu Krankheits-korrelierten SNPs in ...
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3.5 Nukle<strong>in</strong>säuren<br />
miR-224 guide<br />
miR-224_SNP guide<br />
miR-224 passenger<br />
miR-24 guide<br />
caagucacua gugguuccgu u<br />
caacucacua gugguuccgu u<br />
aaaauggugc ccuagugacu aca<br />
uggcucaguu cagcaggaac ag<br />
TCF21 (1042-1061)<br />
Pre-miR -155* unbekannt AGTR1 (1594-1616)<br />
Pre-miR -122* unbekannt ESR1 (2233-2255)<br />
* chemisch synthetisierte und modifizierte Oligonukleotide, partielle Doppelstränge;<br />
Sequenz und Modifikationen werden vom Hersteller Ambion ® 3 nicht benannt<br />
# B<strong>in</strong>destelle 1, ## B<strong>in</strong>destelle 2<br />
3.5.3 siRNAs<br />
In folgender Tabelle s<strong>in</strong>d die während dieser Arbeit verwendeten small <strong>in</strong>terfer<strong>in</strong>g RNAs<br />
(siRNAs) aufgeführt. Die Sequenzen der siAGTR1, siESR1 bzw. siTCF21 guide Stränge<br />
wurden so gewählt, dass diese komplementär <strong>zu</strong>r entsprechenden miR-155, miR-122 bzw.<br />
miR-224 B<strong>in</strong>destelle s<strong>in</strong>d.<br />
Tabelle 3.7: siRNAs<br />
Name Sequenz (5’ → 3’) Ziel-mRNA (Position)<br />
siAGTR1 A guide<br />
cuaaugcuca uuugguagug aTT<br />
siAGTR1 A passenger ucacuaccaa augagcauua gTT<br />
AGTR1 (1596-1618)<br />
siAGTR1 C guide<br />
siAGTR1 C passenger<br />
siESR1 C guide<br />
siESR1 C passenger<br />
siESR1 U guide<br />
siESR1 U passenger<br />
siTCF21 C guide<br />
siTCF21 C passenger<br />
siTCF21 G guide<br />
siTCF21 G passenger<br />
cuaaggcuca uuugguagug aTT<br />
ucacuaccaa augagccuua gTT<br />
cggaguguau gcaggagaca gTT<br />
cugucuccug cauacacucc gTT<br />
cugucuccug cauacacucu gTT<br />
cagaguguau gcaggagaca gTT<br />
gaagucaccg aaguucucag cTT<br />
gcugagaacu ucggugacuu cTT<br />
gaacucaccg aaguucucag cTT<br />
gcugagaacu ucggugaguu cTT<br />
AGTR1 (1596-1618)<br />
ESR1 (2235-2255)<br />
ESR1 (2235-2255)<br />
TCF21 (1041-1061)<br />
TCF21 (1041-1061)<br />
3 http://de-de.<strong>in</strong>vitrogen.com/site/de/de/home/Products-and-Services/Applications/<br />
epigenetics-noncod<strong>in</strong>g-rna-research/miRNA-Profil<strong>in</strong>g-/ambion-pre-mir-precursors.html<br />
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