Mechanistische Analysen zu Krankheits-korrelierten SNPs in ...

A Anhang
5.12 Ergebnisse der MRAS Sekundärstrukturvorhersage für die miR-195 und
miR-135 Bindestellen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
5.13 Ratenkonstanten des Annealings von MRAS 3’-UTR und miR-195 in Anwesenheit
von CTAB . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98
5.14 Ergebnisse der DHFR Sekundärstrukturvorhersage der miR-24 Bindestelle 1 101
5.15 Ergebnisse der DHFR Sekundärstrukturvorhersage der miR-24 Bindestelle 2 102
5.16 Ergebnisse der TCF21 Sekundärstrukturvorhersage . . . . . . . . . . . . . . 107
5.17 Ratenkonstanten des miRNA-Annealings der TCF21 3’-UTR-Varianten in Anund
Abwesenheit von CTAB . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123
5.18 Vergleich der Ratenkonstanten des TCF21 miRNA-Annealings von Gesamtlänge
und verkürzten in vitro Transkripten in Anwesenheit von CTAB . . . . . 127
5.19 Thermodynamische Parameter des TCF21-miR-224-Annealings bei 37°C . . 129
5.20 Ratenkonstanten des Annealings von TCF21 3’-UTR und siTCF21 . . . . . . 133
5.21 Vergleich der Ratenkonstanten des siRNA-Annealings von Gesamtlänge und
verkürzten TCF21 in vitro Transkripten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
5.22 Tabellarische Übersicht ausgewählter Ergebnisse . . . . . . . . . . . . . . . . 136
A.1 PCR-Details zur Amplifikation der AGTR1 3’-UTR . . . . . . . . . . . . . . . . 165
A.2 PCR-Details zur Amplifikation der ESR1 3’-UTR . . . . . . . . . . . . . . . . 165
A.3 PCR-Details zur Amplifikation der MRAS 3’-UTR . . . . . . . . . . . . . . . . 166
A.4 PCR-Details zur Amplifikation der TCF21 3’-UTR . . . . . . . . . . . . . . . . 166
A.5 Übersicht verwendetern Templates und Primer zur Mutagenese-PCR . . . . 166
A.6 Allgemeiner Reaktionsansatz der Mutagenese-PCR . . . . . . . . . . . . . . 167
A.7 Mutagenese-PCR Programme AGTR1 und ESR1 . . . . . . . . . . . . . . . . 167
A.8 Mutagenese-PCR Programm MRAS und TCF21 . . . . . . . . . . . . . . . . 167
A.9 Details der AGTR1 T7-PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
A.10 Details der MRAS T7-PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
A.11 Details der TCF21 T7-PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168
A.12 Details der TCF21 200er T7-PCR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 169
A.13 Details zur Kolonie-PCR von AGTR1, ESR1 und MRAS . . . . . . . . . . . . 169
A.14 Details zur Kolonie-PCR von TCF21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 169
A.15 Gebräuchliche, fremsprachige Begriffe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173
178