Mechanistische Analysen zu Krankheits-korrelierten SNPs in ...
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3.5 Nukle<strong>in</strong>säuren<br />
Sequenzier-Primer<br />
Zur Überprüfung der klonierten Reportergen-Konstrukte wurden die verschiedenen Inserts<br />
über ihre gesamte Länge unter Verwendung der folgenden Primer sequenziert (siehe 4.1.2).<br />
Tabelle 3.9: Sequenzier-Primer<br />
Name Sequenz (5’ → 3’) Insert-Position<br />
pMIR-Luci FW AGGCGATTAA GTTGGGTA - (Vektor)<br />
pMIR-Luci RV TTCCAGGGAT ACGACAAGG - (Vektor)<br />
AGTR1 Seq FW GCAAGTGTAG CACAGTTGC 452-470<br />
ESR1 Seq FW CAACTTGCTG CTCTCCATAG G 734-751<br />
pmirGLO FW GGTTACAACC GCCAAGAAG - (Vektor)<br />
MRAS Seq FW1 TTTTATTAAA GGGGTCTGGG C 459-479<br />
MRAS Seq FW2 CAGATCTGTC TCTTGCTGCG 953-972<br />
MRAS Seq FW3 GCTGCACCAA AGAAAAGGTC 1453-1472<br />
MRAS Seq FW4 AGGTGAGGCG GAGGAAAG 1958-1975<br />
MRAS Seq FW5 GGTAGCTTCC AGATAGGCCA 2450-2469<br />
MRAS Seq FW6 GACCCACTAA CGTGGCAACT 2957-2976<br />
MRAS Seq RV CCCAGCCTTC CTTACTTCTC A 1276-1296<br />
TCF21 Seq FW1 ACCAGAGGGA TAGAGCCCAT 397-416<br />
TCF21 Seq FW2 CAGGAAGTTC CAAGGGATGT 995-1014<br />
TCF21 Seq FW3 AAGAATGGGG AACTCCCTTG 1601-1620<br />
TCF21 Seq FW4 CACTACTTAA TGCAGTGGGA AAGA 2206-2229<br />
TCF21 Seq RV ATTGGAAAAT TTGCGAAACG 480-499<br />
TCF21 Kolonie PCR RV ATGAAGTCAC CGAAGTTCTC AG 225-2246<br />
Mutagenese-Primer<br />
Folgende Primer wurden verwendet, um mittels Mutagenese-PCR (siehe 4.1.1) den Basenaustausch<br />
an der SNP-Position des jeweiligen 3’-UTR Inserts durch<strong>zu</strong>führen. Die SNP-<br />
Positionen s<strong>in</strong>d durch Unterstreichung hervorgehoben.<br />
Tabelle 3.10: Mutagenese-Primer<br />
Name Sequenz (5’ → 3’) mRNA Position<br />
AGTR1 FW SNP CCAAATGAGC CTTAGCTACT TTTC 1602-1625<br />
ESR1 FW SNP GCATACACTC TGGCATGCAT C 2244-2264<br />
MRAS FW SNP GGTGCCTCTC TGATATGAAT ACACTG 1743-1758<br />
TCF21 FW SNP CGGTGAGTTC ATCCACC 1052-1068<br />
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