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5 Ergebnisse Abbildung 5.7: Unter GXS induzierte Abbauwege in A) P. putida JM37 und B) P. putida KT2440. 94
5.1 Untersuchungen zum Abbau von Ethylenglycol Abbildung 5.8: Mögliches, unter EG induziertes, zum ErbR-Regulon aus P. aeruginosa homologes Regulon in P. putida KT2440 und JM37. Wo möglich wurde die Nomenklatur aus Mückschel et al. (2012) übernommen. Die Abbildung wurde auf Basis des von Mern und Kretzschmar et al. (Kretzschmar et al. 2010; Mern et al. 2010) für P. aeruginosa vorgeschlagenen Netzwerkmodells erstellt. Pfeile drücken vermutete regulatorische Beziehungen aus. KT2440 und JM37 induziert. Dieser Response-Regulator ist zu dem erstmals von Schweizer (1991) beschriebenen Regulator ErbR aus P. aeruginosa sowie zu dem von Arias et al. (2008) in P. putida U beschriebenen Regulator PedR1 homolog. Aufgrund der Verwandtschaft von P. putida KT2440 und P. putida U wird im Folgenden, wenn möglich, die Nomenklatur aus P. putida U übernommen. PedR1 (ErbR) ist in P. aeruginosa als zentraler Regulator des Ethanol-Abbaus beschrieben (Mern et al., 2010; Schobert et al., 2001). Dabei kontrolliert PedR1, teilweise über das Sensor-Kinase/Response Regulator Paar PedS2/PedR2, die Expression verschiedener, am Ethanol-Abbau beteiligter, Enzyme . Unter den durch dieses System kontrollierten Enzymen befinden sich auch mehrere der unter EG induzierte Proteine (bzw. Homologe dieser Proteine) wie PedE (PP_2674), PedI (PP_2680) und PqqC (PP_0378). Die Expression der Acetyl-CoA Synthetase AcsA, welche ebenfalls unter mehreren Bedingungen induziert war, wird (in P. aeruginosa) von einer höheren Ebene des gleichen Regulons kontrolliert (Kretzschmar et al., 2010). Abbildung 5.8 gibt den von Mern und Kretzschmar et al. (Kretzschmar et al. 2010; Mern et al. 2010) für P. aeruginosa postulierten Abbauweg mit den entsprechenden homologen Proteinen aus P. putida KT2440 wieder. 95
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Quantitative Proteomanalyse von Pse
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Veröffentlichungen Ein Teil der Er
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Inhaltsverzeichnis 4.2.3 Kultivieru
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Inhaltsverzeichnis 5.3.2 Analyse de
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Abbildungsverzeichnis 3.1 Oxidation
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Abbildungsverzeichnis 5.39 Einteilu
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Tabellenverzeichnis 5.16 Differenti
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1 Zusammenfassung Induktion der Fet
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2 Summary The main focus of this wo
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3 Einleitung 3.1 Systembiologie in
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3 Einleitung 1948). Beide Autoren b
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3 Einleitung schritt im Bereich der
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3 Einleitung Abbildung 3.2: Glyoxyl
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3 Einleitung verschiedener Mechanis
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3 Einleitung Pyruvat zu Acetaldehyd
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3 Einleitung Wie auch bei der Herst
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3 Einleitung Pseudomonas putida KT2
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3 Einleitung schwierig. Substanzen,
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3 Einleitung werden die Zeit und da
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3 Einleitung definierten Massenbere
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3 Einleitung 3.3.4 Proteinidentifiz
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3 Einleitung Silberfärbung überle
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3 Einleitung 3.3.7 Labelfreie masse
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3 Einleitung 3.3.8 Selected reactio
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3 Einleitung weiter zu erhöhen, is
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4 Material und Methoden 4.1 Verwend
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4 Material und Methoden Tabelle 4.3
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4 Material und Methoden Bezeichnung
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5 Ergebnisse Tabelle 5.27: Übersic
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5 Ergebnisse nillin induzierten Pro
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5 Ergebnisse unter Glucose spricht
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5 Ergebnisse Locus-Tag Gen Protein
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5 Ergebnisse KT2440 zu. Die Tatsach
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5 Ergebnisse Abbildung 5.29: Differ
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5 Ergebnisse Tabelle 5.36: Vergleic
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5 Ergebnisse Lipid-Metabolismus Im
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5 Ergebnisse in unseren Experimente
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5 Ergebnisse Tabelle 5.44: Vergleic
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5 Ergebnisse Spot gi Nummer Protein
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6 Diskussion in P. putida JM37 deut
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6 Diskussion al., 1995; Toyama et a
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6 Diskussion stoffquelle abhängig
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6 Diskussion angeimpft. Die Zugabe
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6 Diskussion 3 g/l Butanol könnte
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6 Diskussion cken sich dabei nicht
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6 Diskussion setzungsversuche von Y
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6 Diskussion lin zuließ, war die v
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6 Diskussion Analyse unterschiedlic
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6 Diskussion mäßig geringen Grö
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6 Diskussion Publikation Verwendete
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6 Diskussion a) Stabilisierung und
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6 Diskussion nicht nachgewiesen wer
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6 Diskussion senspektrometrischer Q
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6 Diskussion Anteil an Proteinen de
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6 Diskussion gezielte und absolute
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6 Diskussion Wie bereits in den üb
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Literatur Alban, Andrew, Stephen Ol
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Literatur Chattopadhyay, Ava, Karin
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Literatur bp inverted repeat sequen
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Literatur Inui, Masayuki, Masako Su
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Literatur Lovric, Josip (2011). Int
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Literatur comparative analysis of t
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Literatur coding three quinoprotein
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Literatur Schmidt, Alexander, Josef
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Literatur Toyama, Hirohide, Zhi-Wei
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Literatur Wood J. M., W. A. und R.
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Abkürzungsverzeichnis CE DC GeLCMS
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Eidesstattliche Versicherung Eidess
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Anhang Alle Tabellen und Abbildunge
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