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4 Material und Methoden Tabelle 4.3: Verwendete Softwarepakete. Softwarepaket Version Hersteller / Quelle Scaffold 3.6.2 Proteome Software Mascot Server 2.3 Matrix Science Progenesis SameSpots 4.1 Nonlinear Dynamics Progenesis LC-MS 3.1 Nonlinear Dynamics Xcalibur 2.0.7 Thermo NCBI <strong>Datenbank</strong> 18.03.2011 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ MRMPilot TM 2.1 AB Sciex Analyst 1.5.2 AB Sciex MultiQuant TM 2.1 AB Sciex Python 2.7.3 www.python.org 40
4.1 Verwendete Materialien Tabelle 4.4: Häufig verwendete Lösungen. Bezeichnung Waschpuffer Zellernte (pH8) Zusammensetzung 5 mM Magnesium Acetat 10 mM Tris-HCl DIGE-Lysepuffer (pH 8,5) 30 mM TRIS ( Base) 7 M Harnstoff 2 M Thioharnstoff 4% Chaps 2 x Ladepuffer 1D-Frak. (pH 6,8) 150 mM TRIS 1,2% SDS 20 mM DTT 10% Glycerol 0,03% Bromphenolblau 3 x Ladepuffer 1D-SDS PAGE (pH 6,8) 150 mM Tris-HCl, pH 6,8 1,2% SDS 30% Glycerin 15% Mercaptoethanol 0,03% Bromphenolblau Carbonatextraktionspuffer (pH 11,5) 1x Probenpuffer 1D-SDS PAGE (pH 6,8) 100 mM Natriumbicarbonat 4 % SDS 4% Glycerin 0,3% Mercaptoethanol 75 mM Tris-HCl, pH 6,8 Laemmli-Puffer (pH 8,3) 25 mM Tris-HCl, pH 8,3 192 mM Glycin 0,1% SDS Fixierlösung (Silberfärbung) 30% Ethanol (v/v) 41
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Quantitative Proteomanalyse von Pse
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Seite 10 und 11: Inhaltsverzeichnis 5.3.2 Analyse de
Seite 12 und 13: Abbildungsverzeichnis 3.1 Oxidation
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Seite 22 und 23: 3 Einleitung 3.1 Systembiologie in
Seite 24 und 25: 3 Einleitung 1948). Beide Autoren b
Seite 26 und 27: 3 Einleitung schritt im Bereich der
Seite 28 und 29: 3 Einleitung Abbildung 3.2: Glyoxyl
Seite 30 und 31: 3 Einleitung verschiedener Mechanis
Seite 32 und 33: 3 Einleitung Pyruvat zu Acetaldehyd
Seite 34 und 35: 3 Einleitung Wie auch bei der Herst
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5 Ergebnisse 5.2 Untersuchungen zum
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5 Ergebnisse ausgesetzt. Grundlage
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5 Ergebnisse vorherigen Experiment
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5 Ergebnisse Locus-Tag Gen Protein
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5 Ergebnisse mungskettenenzym Cytro
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5 Ergebnisse nicht bekannt. Auch in
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5 Ergebnisse 5.2.2 Transkriptom- un
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5 Ergebnisse Abbildung 5.12: VENN-D
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5 Ergebnisse Da nicht alle Kultivie
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5 Ergebnisse nisse der GeLCMSMS-Ana
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5 Ergebnisse wicht des nach der Zel
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5 Ergebnisse Abbildung 5.16: Prozen
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5 Ergebnisse Viele der differentiel
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5 Ergebnisse Tabelle 5.19: In den v
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5 Ergebnisse 5.3.1 Analyse der zyto
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5 Ergebnisse Tabelle 5.27: Übersic
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5 Ergebnisse nillin induzierten Pro
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5 Ergebnisse unter Glucose spricht
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5 Ergebnisse KT2440 zu. Die Tatsach
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5 Ergebnisse Lipid-Metabolismus Im
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5 Ergebnisse in unseren Experimente
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5 Ergebnisse Abbildung 5.32: Quanti
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5 Ergebnisse mente wurden anschlie
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5 Ergebnisse sion verstärkt. So ko
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5 Ergebnisse Abbildung 5.39: Eintei
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5 Ergebnisse gulation von LiuA war
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5 Ergebnisse Spot gi Nummer Protein
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6 Diskussion in P. putida JM37 deut
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6 Diskussion al., 1995; Toyama et a
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6 Diskussion stoffquelle abhängig
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6 Diskussion angeimpft. Die Zugabe
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6 Diskussion 3 g/l Butanol könnte
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6 Diskussion cken sich dabei nicht
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6 Diskussion setzungsversuche von Y
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6 Diskussion lin zuließ, war die v
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6 Diskussion Analyse unterschiedlic
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6 Diskussion mäßig geringen Grö
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6 Diskussion Publikation Verwendete
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6 Diskussion a) Stabilisierung und
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6 Diskussion nicht nachgewiesen wer
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6 Diskussion senspektrometrischer Q
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6 Diskussion Anteil an Proteinen de
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6 Diskussion gezielte und absolute
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6 Diskussion Wie bereits in den üb
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Literatur Alban, Andrew, Stephen Ol
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Literatur Chattopadhyay, Ava, Karin
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Literatur bp inverted repeat sequen
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Literatur Inui, Masayuki, Masako Su
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Literatur Lovric, Josip (2011). Int
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Literatur comparative analysis of t
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Literatur coding three quinoprotein
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Literatur Schmidt, Alexander, Josef
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Literatur Toyama, Hirohide, Zhi-Wei
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Literatur Wood J. M., W. A. und R.
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Abkürzungsverzeichnis CE DC GeLCMS
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Eidesstattliche Versicherung Eidess
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Anhang Alle Tabellen und Abbildunge
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