Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

5.3 Untersuchungen zum Vanillin-Metabolismus
Tabelle 5.32: Übersicht über die identifizierten Proteine des pca-Clusters sowie deren Regulation
in den verschiedenen Analysen.
Zusätzlich wurden weitere, mutmaßlich am Vanillin-Abbau beteiligte Proteine in die Tabelle
aufgenommen.
Locus-Tag Gen Protein Reg.
Reg.
Reg.
Reg.
1D
Mem
2D
In
PP_1375 pcaR pca regulon regulatory protein 2,2 - - Van
PP_1376 pcaK benzoate transport 41,9 211,8 - Van
PP_1377 pcaF beta-ketoadipyl CoA thiolase 219 22,8 7,2 Van
PP_1379 pcaB 3-carboxy-cis,cis-muconate
cycloisomerase
92,7 117 6,1 Van
PP_1380 pcaD 3-oxoadipate enol-lactonase 35,1 59,3 - Van
PP_1381 pcaC 4-carboxymuconolactone
decarboxylase
- - 4,9 Van
PP_1383 pcaP BenF-like porin 223,3 154,8 - Van
PP_3537 pobA 4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase 545,6 46 - Van
PP_3736 vanA Rieske (2Fe-2S) domain protein 126,1 482,2 7,6 Van
PP_3737 vanB ferredoxin 412,9 77,7 9,3 Van
PP_3951 pcaI 3-oxoadipate CoA-transferase,
subunit A
PP_3952 pcaJ 3-oxoadipate CoA-transferase,
subunit B
PP_4656 pcaH protocatechuate 3,4-dioxygenase,
beta subunit
1349,9 549 14 Van
4442 up 5,1 Van
105,7 1794,2 - Van
PP_1948 benzaldehyde dehydrogenase 57,2 - - Van
PP_5120 conifer aldehyde dehydrogenase 6,9 - - Van
-: Nicht identifiziert / reguliert.
Reg. 1D: Regulationsfaktoren aus dem GeLCMSMS Experiment.
Reg. Mem: Regulationsfaktoren aus der Analyse der Membranfraktion.
Reg. 2D: Regulationsfaktoren aus der 2D-DIGE-Analyse.
Reg. In: Zustand, in welchem das Protein induziert war.
up: Das Protein wurde nur in Gegenwart von Vanillin gefunden.
Unter Vanillin induzierte Transporter und Efflux-Systeme
Zu den Genen vanA und vanB benachbart liegt ein stark induzierter (2000-fach) Transporter
der inneren Membran (PP_3740), welcher der „Major Facilitator of Transport“-
Superfamilie angehört, sowie ein in der P. putida KT2440 Datenbank nicht in eine Proteinsequenz
übersetztes Gen (PP_3739), welches einen „Frameshift“ aufweist. Das Gen
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