Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

5 Ergebnisse
Abbildung 5.34: Verteilung der während des 1D-Fraktionierungs-Experiments identifizierten
Proteine auf die einzelnen subzellulären Kompartimente im Vergleich zur Verteilung aller
Proteine im Gesamtproteom. Die Verteilung der Proteine des Gesamtproteoms von P. putida
KT2440 wurde der „Pseudomonas Genome Database“ entnommen.
Gene des atu- und liu-Genclusters kodiert wurden oder der β-Oxidation der Fettsäuren
zugeordnet werden konnten. Es wird aktuell davon ausgegangen, dass Gene des
atu-Clusters für die Enzyme des ersten Teils des Terpenabbaus kodieren. Das durch
das Enzym HHG-CoA Lyase (AtuA) erzeugte „7-Methyl-3-oxo-6-octenoyl-CoA“ wird
anschließend über verschiedene Enzyme der β-Oxidation zu 3-Methylcrotonyl-CoA abgebaut
und in den Leucin-Abbau (liu-Cluster) eingeschleust (Díaz-Pérez et al., 2004;
Höschle et al., 2005; Förster-Fromme et al., 2006).
Auch wenn verschiedene Genprodukte des atu-Clusters bereits einer Reaktion in diesem
Abbauweg eindeutig zugeordnet werden konnten, sind die an der initialen Oxidation
von Citronellol zu Citronellsäure beteiligten Enzyme noch nicht bekannt. Auch die für
die anschließende Aktivierung zu Citronellyl-CoA benötigen Proteine konnten bis jetzt
nicht eindeutig identifiziert werden. Ein möglicher Kandidat für diesen Schritt ist AtuH.
Zudem ist nicht bekannt, ob der Abbau unverzweigter und verzweigter Fettsäuren von
den gleichen oder unterschiedlichen Enzymen katalysiert wird.
Von den neun Genen des atu-Clusters waren acht unter Citronellol induziert. Lediglich
die „Very-long chain Acyl-CoA Synthetase (atuH ) konnte in diesem (und auch in keinem
anderen) Experiment identifiziert werden. Die sechs Gene des liu-Clusters zeigten
unter Citronellol ebenfalls eine deutliche Induktion (Abbildung 5.35). Wie erwartet,
waren auch verschiedene Enzyme der β-Oxidation unter Citronellol in ihrer Expres-
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