Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

3.3 Massenspektrometrie und quantitative Proteomanalyse
Abbildung 3.11: Vereinfachte Darstellung der labelfreien Quantifizierung.
Die einzelnen Analysen werden auf Basis ihres „Contour Plots“, ähnlich zweier Gelbilder während
der 2D-DIGE-Analyse, übereinandergelegt (A). Zur Quantifizierung wird die „Fläche“,
welche durch den Elutionszeitraum und die Intensität eines Peptids (Isotopenmusters) aufgespannt
wird, für jedes Peptid eines Laufes erfasst und zwischen den verschiedenen analysierten
Zuständen verglichen (B). Für die Identifizierung der auf MS-Ebene quantifizierten Peptide
werden die über DDA aufgenommenen MS/MS-Spektren herangezogen (C).
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