Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

5.5 SRM-Analyse
der SRM-Übergänge zu verbessern. Um eine größere Zahl von SRM-Übergängen ohne
Sensitivitätsverlust in einem einzigen HPLC-Lauf analysieren zu können wurde eine
„Scheduled-SRM-Methode“ eingesetzt.
Abbildung 5.43: Bei der Analyse einer mit Glucose behandelten Probe detektierte SRM-
Übergänge.
Die unterschiedlichen Farben geben die verschiedenen, detektierten Übergänge wieder. Es wird
deutlich, dass ein großer Teil der SRM-Übergänge in einem Zeitfenster zwischen Minute 20
und 28 aufgenommen wurde.
Nach erfolgter Optimierung der Kollisionsenergie wurden alle SRM-Übergänge auf Basis
ihrer Retentionszeiten in einer einzigen „Scheduled-SRM-Methode“ zusammengefasst
und die beiden Zustände (je drei Replikate) mit dieser Methode analysiert. Abbildung
5.43 zeigt die während einer „Scheduled SRM-Analyse“ detektierten SRM-Übergänge.
Die Auswertung erfolgte mit Hilfe der Software MultiQuant. SRM-Übergänge welche
in einzelnen Analysen nicht oder nur schwer (verrauschte Signale) detektiert werden
konnten, wurden von der weiteren Auswertung ausgeschlossen. Alle weiteren Schritte
der Auswertung (Normalisierung, etc.) sind in Kapitel 4 beschrieben. Tabelle 5.44
zeigt die Ergebnisse der SRM-Analyse im Vergleich zu den Ergebnissen der 2D-DIGE
Analyse.
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