Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

5.3 Untersuchungen zum Vanillin-Metabolismus
Locus-Tag Gen Protein Reg.
Reg.
Reg.
Reg.
1D
Mem
2D
In
PP_4549 fadD long-chain-fatty-acid–CoA ligase 2,3 - - Van
PP_4550 fadD2 long-chain-fatty-acid–CoA ligase 7,8 - - Van
PP_4666 mmsB 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase 11,3 - - Van
PP_4667
mmsA-
methylmalonate-semialdehyde
8,1 - - Van
2
dehydrogenase
PP_4702 acsB acetyl-CoA synthetase 33,4 - - Van
PP_4780
acyl-CoA dehydrogenase
domain-containing protein
7,8 - - Van
PP_5003 phaA poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase
1
PP_5005 phaC poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase
2
4,1 - - Van
7 - - Van
PP_5365
cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid
synthase
28,2 - - Van
-: Nicht identifiziert / reguliert.
Reg. 1D: Regulationsfaktoren aus dem GeLCMSMS Experiment.
Reg. Mem: Regulationsfaktoren aus der Analyse der Membranfraktion.
Reg. 2D: Regulationsfaktoren aus der 2D-DIGE-Analyse.
Reg. In: Zustand, in welchem das Protein induziert war.
Stressantwort
Im Gegensatz zu den mit anderen monozyklischen aromatischen Verbindungen wie Phenol
und Toluol durchgeführten Proteomics- und Transkriptomics-Experimenten (Santos
et al., 2004; Segura et al., 2005; Domínguez-Cuevas et al., 2006; Roma-Rodrigues et al.,
2010), zeigte sich in unserem Versuch nur eine geringe Induktion von Chaperonen und
anderen Stressproteinen. Während in einer Transkriptomanalyse von P. putida KT2440
in Gegenwart von Toluol (Domínguez-Cuevas et al., 2006) 12 Proteine aus dieser Kategorie
induziert (Regulation > 2) waren, wurden in den von uns durchgeführten Experimenten
unter dem Einfluss von Vanillin lediglich drei dieser Proteine (GroEL, HtpG,
DnaK) verstärkt exprimiert. Zusätzlich waren die beiden Stressproteine PP_1210 und
PP_2648 unter Vanillin induziert.
Im Gegensatz zu den Daten von Domínguez-Cuevas et al. (2006) zeigten die beiden
Proteine PP_1478 und PP_2187, welche unter Toluol vermindert exprimiert wurden
(Regulation < 0,5), in unserem Experiment unter Vanillin eine Induktion. Das Stressprotein
AhpC (PP_2439), das in anderen Studien sowohl unter der Einwirkung von
Phenol als auch von Vanillin reguliert war (Santos et al., 2004; Kim et al., 2006), konnte
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