Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

Inhaltsverzeichnis
1 Zusammenfassung 1
2 Summary 4
3 Einleitung 6
3.1 Systembiologie in Pseudomonas putida . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
3.1.1 Pseudomonas putida . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
3.1.2 Systembiologie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
3.1.3 Proteomics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
3.2 Biotransformationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
3.2.1 Synthese von Glyoxylsäure aus Ethylenglycol . . . . . . . . . . . 10
3.2.2 Lösungsmitteltoleranz in Mikroorganismen . . . . . . . . . . . . 13
3.2.3 Biotechnologische Herstellung von Butanol . . . . . . . . . . . . 15
3.2.4 Biotechnologische Herstellung von Vanillin . . . . . . . . . . . . 17
3.2.5 Biotransformation von Terpenoiden . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.3 Massenspektrometrie und quantitative Proteomanalyse . . . . . . . . . 21
3.3.1 Reversed Phase-HPLC und Massenspektrometrie . . . . . . . . 21
3.3.2 Elektrospray-Ionisation (ESI) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
3.3.3 Massenanalysatoren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
3.3.4 Proteinidentifizierung (Datenbanksuche) . . . . . . . . . . . . . 28
3.3.5 Quantitative Proteomanalyse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
3.3.6 Zweidimensionale Gelelektrophorese und 2D-DIGE . . . . . . . 29
3.3.7 Labelfreie massenspektrometrische Quantifizierung . . . . . . . 32
3.3.8 Selected reaction monitoring (SRM) . . . . . . . . . . . . . . . . 34
3.4 Zielsetzung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
4 Material und Methoden 38
4.1 Verwendete Materialien . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
4.1.1 Chemikalien, Verbrauchsmittel und Geräte . . . . . . . . . . . . 38
4.2 Kultivierung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
4.2.1 Verwendete Bakterienstämme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
4.2.2 Kulturmedien . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
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