Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

Weitere Magazine

Empfehlungen

Info

5 Ergebnisse Abbildung 5.29: Differentiell regulierte Proteine des Arginin- bzw. Putrescin-Metabolismus. Die Abbildung basiert auf den Arbeiten von Chou et al. (2008) und Bandounas et al. (2011). Die Regulationsfaktoren der einzelnen Proteine in den unterschiedlichen Versuchen sind in Tabelle 5.34 zusammengefasst. 164
5.3 Untersuchungen zum Vanillin-Metabolismus ArcB aus P. aeruginosa (91% Sequenzidentität) und könnte somit in P. putida KT2440 die Umwandlung von Citrullin zu Ornithin katalysieren. Auch mehrere am Abbau von Putrescin beteiligte Enzyme, welche laut Bandounas et al. (2011) ortholog zur Putrescin-Aminotransferase (SpuC) aus P. aeruginosa sind, konnten in unseren Versuchen identifiziert werden. Dabei waren die Aminotransferase PP_5182 sowie das hypothetische Protein PP_3718 unter Vanillin induziert. Das hypotetische Protein PP_4421 war entgegengesetzt reguliert. In unmittelbarer Nachbarschaft zu dem am stärksten induzierten Putrescin Transportsystem (PP_1484, PP_1486) liegt das Gen PP_1481, welches für das Enzym γ-Aminobutyraldehyd- Dehydrogenase kodiert. Dieses Enzym katalysiert die Umwandlung von 4-Aminobutyraldehyd zu 4-Aminobutyrat (GABA) und war unter Vanillin induziert. Einige der Enzyme, welche weitere Schritte des Putrescin-Abbaus katalysieren könnten, wurden zwar identifiziert, zeigten in unserem Experiment jedoch keine Regulation. Auch der von Bandounas et al. (2011) in Pseudomonas putida S12 postulierte „γ-Glutamylation“-Weg war bis auf die beiden Glutamin-Synthetasen PP_5183 und PP_5184 nicht reguliert. Ob die Induktion dieser beiden Enzyme tatsächlich auf den Putrescin-Abbau zurückzuführen ist, oder doch auf einer Induktion der Glutaminsynthese aus Glutamat beruht, lässt sich anhand der vorhandenen Daten nicht sagen. Die Regulation der in diesem Abschnitt beschriebenen Proteine in den einzelnen durchgeführten Experimenten ist in Tabelle 5.34 zusammengefasst. Tabelle 5.34: Übersicht über die regulierten Proteine, welche mit dem Putrescin- Metabolismus in Verbindung stehen. Locus-Tag Gen Protein Reg. Reg. Reg. Reg. 1D Mem 2D In PP_0999 arcC carbamate kinase 9,9 - 4,8 Van PP_1000 argI ornithine carbamoyltransferase 7,6 - 5,4 Van PP_1001 arcA arginine deiminase 8,2 - 5 Van PP_1002 arcD arginine/ornithine antiporter 173 28,4 - Van PP_5182 aminotransferase 5,1 - - Van PP_5183 glutamine synthetase 2,4 - - Van PP_5184 glutamine synthetase 2,4 - - Van PP_0382 Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase 4 - - Van PP_3718 hypothetical protein 15,8 - - Van PP_4421 hypothetical protein 2,3 - - Glu 165
Seite 1:
Quantitative Proteomanalyse von Pse
Seite 5:
Veröffentlichungen Ein Teil der Er
Seite 8 und 9:
Inhaltsverzeichnis 4.2.3 Kultivieru
Seite 10 und 11:
Inhaltsverzeichnis 5.3.2 Analyse de
Seite 12 und 13:
Abbildungsverzeichnis 3.1 Oxidation
Seite 14 und 15:
Abbildungsverzeichnis 5.39 Einteilu
Seite 16 und 17:
Tabellenverzeichnis 5.16 Differenti
Seite 18 und 19:
1 Zusammenfassung Induktion der Fet
Seite 20 und 21:
2 Summary The main focus of this wo
Seite 22 und 23:
3 Einleitung 3.1 Systembiologie in
Seite 24 und 25:
3 Einleitung 1948). Beide Autoren b
Seite 26 und 27:
3 Einleitung schritt im Bereich der
Seite 28 und 29:
3 Einleitung Abbildung 3.2: Glyoxyl
Seite 30 und 31:
3 Einleitung verschiedener Mechanis
Seite 32 und 33:
3 Einleitung Pyruvat zu Acetaldehyd
Seite 34 und 35:
3 Einleitung Wie auch bei der Herst
Seite 36 und 37:
3 Einleitung Pseudomonas putida KT2
Seite 38 und 39:
3 Einleitung schwierig. Substanzen,
Seite 40 und 41:
3 Einleitung werden die Zeit und da
Seite 42 und 43:
3 Einleitung definierten Massenbere
Seite 44 und 45:
3 Einleitung 3.3.4 Proteinidentifiz
Seite 46 und 47:
3 Einleitung Silberfärbung überle
Seite 48 und 49:
3 Einleitung 3.3.7 Labelfreie masse
Seite 50 und 51:
3 Einleitung 3.3.8 Selected reactio
Seite 52 und 53:
3 Einleitung weiter zu erhöhen, is
Seite 54 und 55:
4 Material und Methoden 4.1 Verwend
Seite 56 und 57:
4 Material und Methoden Tabelle 4.3
Seite 58 und 59:
4 Material und Methoden Bezeichnung
Seite 60 und 61:
4 Material und Methoden Medium Zusa
Seite 62 und 63:
4 Material und Methoden geführten
Seite 64 und 65:
4 Material und Methoden 0,05% Oktan
Seite 66 und 67:
4 Material und Methoden in ein neue
Seite 68 und 69:
4 Material und Methoden die in eine
Seite 70 und 71:
4 Material und Methoden 30 min im D
Seite 72 und 73:
4 Material und Methoden der unteren
Seite 74 und 75:
4 Material und Methoden Quotienten
Seite 76 und 77:
4 Material und Methoden 4.5.2 Ident
Seite 78 und 79:
4 Material und Methoden Tabelle 4.1
Seite 80 und 81:
4 Material und Methoden 4.5.3.1 bes
Seite 82 und 83:
4 Material und Methoden Abbildung 4
Seite 84 und 85:
4 Material und Methoden SRM-Überga
Seite 86 und 87:
4 Material und Methoden getrennt. D
Seite 88 und 89:
5 Ergebnisse Abbildung 5.1: Durchf
Seite 90 und 91:
5 Ergebnisse pH-Gradienten lediglic
Seite 92 und 93:
5 Ergebnisse Differenzielle Regulat
Seite 94 und 95:
5 Ergebnisse (31-fach), bei welchem
Seite 96 und 97:
5 Ergebnisse Position der beiden Sp
Seite 98 und 99:
5 Ergebnisse Differenzielle Regulat
Seite 100 und 101:
5 Ergebnisse Für die quantitative
Seite 102 und 103:
5 Ergebnisse Porin (PP_2662) und ei
Seite 104 und 105:
5 Ergebnisse Abbildung 5.4: Einteil
Seite 106 und 107:
5 Ergebnisse Abbildung 5.5: Einteil
Seite 108 und 109:
5 Ergebnisse Abbildung 5.6: Postuli
Seite 110 und 111:
5 Ergebnisse Abbildung 5.7: Unter G
Seite 112 und 113:
5 Ergebnisse 5.2 Untersuchungen zum
Seite 114 und 115:
5 Ergebnisse ausgesetzt. Grundlage
Seite 116 und 117:
5 Ergebnisse vorherigen Experiment
Seite 118 und 119:
5 Ergebnisse Locus-Tag Gen Protein
Seite 120 und 121:
5 Ergebnisse mungskettenenzym Cytro
Seite 122 und 123:
5 Ergebnisse nicht bekannt. Auch in
Seite 124 und 125:
5 Ergebnisse 5.2.2 Transkriptom- un
Seite 126 und 127:
5 Ergebnisse Abbildung 5.12: VENN-D
Seite 128 und 129:
5 Ergebnisse Da nicht alle Kultivie
Seite 130 und 131: 5 Ergebnisse nisse der GeLCMSMS-Ana
Seite 132 und 133: 5 Ergebnisse wicht des nach der Zel
Seite 134 und 135: 5 Ergebnisse Abbildung 5.16: Prozen
Seite 136 und 137: 5 Ergebnisse Abbildung 5.17: Darste
Seite 138 und 139: 5 Ergebnisse Viele der differentiel
Seite 140 und 141: 5 Ergebnisse Abbildung 5.19: Regula
Seite 142 und 143: 5 Ergebnisse Abbildung 5.20: Differ
Seite 144 und 145: 5 Ergebnisse Locus-Tag Gen Protein
Seite 146 und 147: 5 Ergebnisse Tabelle 5.19: In den v
Seite 150 und 151: 5 Ergebnisse exprimiert. Darunter d
Seite 158 und 159: 5 Ergebnisse 5.3.1 Analyse der zyto
Seite 160 und 161: 5 Ergebnisse Tabelle 5.27: Übersic
Seite 164 und 165: 5 Ergebnisse nillin induzierten Pro
Seite 168 und 169: 5 Ergebnisse unter Glucose spricht
Seite 172 und 173: 5 Ergebnisse KT2440 zu. Die Tatsach
Seite 174 und 175: 5 Ergebnisse PP_3739 zeigte bei ein
Seite 176 und 177: 5 Ergebnisse portsystems identifizi
Seite 184 und 185: 5 Ergebnisse Tabelle 5.36: Vergleic
Seite 186 und 187: 5 Ergebnisse Lipid-Metabolismus Im
Seite 190 und 191: 5 Ergebnisse in unseren Experimente
Seite 192 und 193: 5 Ergebnisse Abbildung 5.32: Quanti
Seite 194 und 195: 5 Ergebnisse mente wurden anschlie
Seite 196 und 197: 5 Ergebnisse Abbildung 5.34: Vertei
Seite 198 und 199: 5 Ergebnisse sion verstärkt. So ko
Seite 202 und 203: 5 Ergebnisse Abbildung 5.39: Eintei
Seite 204 und 205: 5 Ergebnisse gulation von LiuA war
Seite 206 und 207: 5 Ergebnisse Locus- Gen Protein Glu
Seite 208 und 209: 5 Ergebnisse Abbildung 5.41: Schema
Seite 210 und 211: 5 Ergebnisse Tabelle 5.43: Differen
Seite 212 und 213: 5 Ergebnisse Abbildung 5.42: Gelbil
Seite 214 und 215: 5 Ergebnisse Tabelle 5.44: Vergleic
Seite 216 und 217: 5 Ergebnisse Spot gi Nummer Protein
Seite 218 und 219: 6 Diskussion in P. putida JM37 deut
Seite 220 und 221: 6 Diskussion al., 1995; Toyama et a
Seite 222 und 223: 6 Diskussion stoffquelle abhängig
Seite 224 und 225: 6 Diskussion angeimpft. Die Zugabe
Seite 226 und 227: 6 Diskussion 3 g/l Butanol könnte
Seite 228 und 229: 6 Diskussion cken sich dabei nicht
Seite 230 und 231:
6 Diskussion setzungsversuche von Y
Seite 232 und 233:
6 Diskussion lin zuließ, war die v
Seite 234 und 235:
6 Diskussion Analyse unterschiedlic
Seite 236 und 237:
6 Diskussion mäßig geringen Grö
Seite 238 und 239:
6 Diskussion Publikation Verwendete
Seite 240 und 241:
6 Diskussion a) Stabilisierung und
Seite 242 und 243:
6 Diskussion nicht nachgewiesen wer
Seite 244 und 245:
6 Diskussion senspektrometrischer Q
Seite 246 und 247:
6 Diskussion Anteil an Proteinen de
Seite 248 und 249:
6 Diskussion gezielte und absolute
Seite 250 und 251:
6 Diskussion Wie bereits in den üb
Seite 252 und 253:
Literatur Alban, Andrew, Stephen Ol
Seite 254 und 255:
Literatur Chattopadhyay, Ava, Karin
Seite 256 und 257:
Literatur bp inverted repeat sequen
Seite 258 und 259:
Literatur Inui, Masayuki, Masako Su
Seite 260 und 261:
Literatur Lovric, Josip (2011). Int
Seite 262 und 263:
Literatur comparative analysis of t
Seite 264 und 265:
Literatur coding three quinoprotein
Seite 266 und 267:
Literatur Schmidt, Alexander, Josef
Seite 268 und 269:
Literatur Toyama, Hirohide, Zhi-Wei
Seite 270 und 271:
Literatur Wood J. M., W. A. und R.
Seite 272 und 273:
Abkürzungsverzeichnis CE DC GeLCMS
Seite 274 und 275:
Eidesstattliche Versicherung Eidess
Seite 276:
Anhang Alle Tabellen und Abbildunge
Alle anzeigen

Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

Erfolgreiche ePaper selbst erstellen

Template löschen?

Als Template speichern?