Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

5 Ergebnisse
Viele der differentiell regulierten Proteine konnten dem „Aminosäure Transport und
Metabolismus“, dem „Lipid Metabolismus“, dem „Kohlenhydrat Transport und Metabolismus“
sowie dem „Energie-Metabolismus“ zugeordnet werden.
Differenzielle Regulation von Proteinen in Pseudomonas putida KT2440 im Vergleich
zwischen Steady-State II und Steady-State III
Die Zahl der in diesem Experiment identifizierten Proteine betrug 1400, wovon 146 eine
Regulation in einem der beiden Zustände zeigten. 48 Proteine wurden in Steady-State
III verstärkt, 99 vermindert exprimiert. Die Verteilung der identifizierten Proteine auf
die einzelnen subzellulären Kompartimente unterschied sich nicht von den vorherigen
Experimenten. Auch die Einteilung in verschiedene funktionelle Gruppen zeigte keine
Auffälligkeiten. Wie bereits bei den vorherigen Methoden brachte auch hier der direkte
Vergleich zwischen Steady-State II und Steady-State III keine neuen Erkenntnisse.
5.2.3.4 Der Metabolismus von Butanol in Pseudomonas putida KT2440
Der folgende Abschnitt fasst die Ergebnisse der verschiedenen Methoden für die aus dem
Bioreaktor entnommenen Proben zusammen. Da die GeLCMSMS-Analyse den umfangreichsten
Datensatz lieferte, beziehen sich die im Folgenden beschriebenen Regulationen
der Stoffwechselwege , wenn nicht explizit anders erwähnt, auf diese Analysemethode.
Generell konnten im Rahmen dieser Analyse eine Vielzahl der am Entner-Doudoroff-
Weg und der β-Oxidation beteiligten Enzyme identifiziert werden.
PedR1-Regulon
Wie bereits unter Ethylenglycol, waren auch unter Butanol große Teile des PedR1-
Regulons induziert (Abbildung 5.19).
Tabelle 5.16: In den verschiedenen 1D-Fraktionierungs-Experimenten differentiell regulierte
Proteine aus dem Genbereich PP_2662 bis PP_2683. Zudem sind die Regulationsfaktoren
weiterer, mit dem PedR1-Regulon assoziierten, Proteine angegeben. Proteine wurden als reguliert
angesehen, wenn sie einen p-Wert < 0,05 und eine Regulation um einen Faktor > 2
aufwiesen.
Locus-Tag Gen Protein I vs.
I vs.
II vs.
Reg.
II
III
III
In
PP_2662 hypothetical protein NID 24,1 266,4 BuOH
PP_2663 hypothetical protein NID 46,9 15 BuOH
PP_2664 pedS1 PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase NID 80,3 9,7 BuOH
PP_2665 pedR1 AgmR 6,2 13,4 NID BuOH
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