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5 Ergebnisse Abbildung 5.39: Einteilung der differenziell regulierten Proteine anhand ihrer COG- Kategorie. Die einzelnen Balken spiegeln den Anteil der entsprechenden Kategorie an den insgesamt in einem der beiden Zustände (Glucose bzw. Oktansäure) regulierten Proteine wider. Die Kategorie „Not in COGs“ enthält Proteine, für die in der <strong>Datenbank</strong> keine COG- Informationen vorhanden waren. 186
5.4 Untersuchungen zum Metabolismus von Terpenen Wie zu erwarten zeigte sich vor allem eine Induktion der Enzyme der β-Oxidation (Abbildung 5.40). Abbildung 5.40: Differentielle Regulation der Enzyme der β-Oxidation zwischen auf Glucose und auf Oktansäure kultivierten Zellen. Die Regulationsfaktoren der einzelnen Enzyme sind in Tabelle 5.41 zu finden. Im Gegensatz zum vorherigen Versuch, waren keine Enzyme des Atu-Clusters und, bis auf LiuA, auch keine Proteine des Liu-Gencluster unter Oktansäure induziert. Die Re- 187
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Quantitative Proteomanalyse von Pse
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Veröffentlichungen Ein Teil der Er
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Inhaltsverzeichnis 4.2.3 Kultivieru
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Inhaltsverzeichnis 5.3.2 Analyse de
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Abbildungsverzeichnis 3.1 Oxidation
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Abbildungsverzeichnis 5.39 Einteilu
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Tabellenverzeichnis 5.16 Differenti
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1 Zusammenfassung Induktion der Fet
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2 Summary The main focus of this wo
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3 Einleitung 3.1 Systembiologie in
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3 Einleitung 1948). Beide Autoren b
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3 Einleitung schritt im Bereich der
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3 Einleitung Abbildung 3.2: Glyoxyl
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3 Einleitung verschiedener Mechanis
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3 Einleitung Pyruvat zu Acetaldehyd
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3 Einleitung Wie auch bei der Herst
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3 Einleitung Pseudomonas putida KT2
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3 Einleitung schwierig. Substanzen,
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3 Einleitung werden die Zeit und da
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3 Einleitung definierten Massenbere
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3 Einleitung 3.3.4 Proteinidentifiz
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3 Einleitung Silberfärbung überle
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3 Einleitung 3.3.7 Labelfreie masse
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3 Einleitung 3.3.8 Selected reactio
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3 Einleitung weiter zu erhöhen, is
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4 Material und Methoden 4.1 Verwend
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4 Material und Methoden Tabelle 4.3
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4 Material und Methoden Bezeichnung
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4 Material und Methoden Medium Zusa
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4 Material und Methoden geführten
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4 Material und Methoden 0,05% Oktan
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4 Material und Methoden in ein neue
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4 Material und Methoden die in eine
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4 Material und Methoden 30 min im D
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4 Material und Methoden der unteren
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4 Material und Methoden Quotienten
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4 Material und Methoden 4.5.2 Ident
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4 Material und Methoden Tabelle 4.1
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4 Material und Methoden 4.5.3.1 bes
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4 Material und Methoden Abbildung 4
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4 Material und Methoden SRM-Überga
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4 Material und Methoden getrennt. D
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5 Ergebnisse Abbildung 5.1: Durchf
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5 Ergebnisse pH-Gradienten lediglic
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5 Ergebnisse Differenzielle Regulat
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5 Ergebnisse (31-fach), bei welchem
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5 Ergebnisse Position der beiden Sp
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5 Ergebnisse Differenzielle Regulat
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5 Ergebnisse Für die quantitative
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5 Ergebnisse Porin (PP_2662) und ei
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5 Ergebnisse Abbildung 5.4: Einteil
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5 Ergebnisse Abbildung 5.5: Einteil
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5 Ergebnisse Abbildung 5.6: Postuli
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5 Ergebnisse Abbildung 5.7: Unter G
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5 Ergebnisse 5.2 Untersuchungen zum
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5 Ergebnisse ausgesetzt. Grundlage
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5 Ergebnisse vorherigen Experiment
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5 Ergebnisse Locus-Tag Gen Protein
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5 Ergebnisse mungskettenenzym Cytro
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5 Ergebnisse nicht bekannt. Auch in
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5 Ergebnisse 5.2.2 Transkriptom- un
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5 Ergebnisse Abbildung 5.12: VENN-D
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5 Ergebnisse Da nicht alle Kultivie
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5 Ergebnisse nisse der GeLCMSMS-Ana
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5 Ergebnisse wicht des nach der Zel
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5 Ergebnisse Abbildung 5.16: Prozen
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5 Ergebnisse Abbildung 5.17: Darste
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5 Ergebnisse Viele der differentiel
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5 Ergebnisse Abbildung 5.19: Regula
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5 Ergebnisse Abbildung 5.20: Differ
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5 Ergebnisse Locus-Tag Gen Protein
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5 Ergebnisse Tabelle 5.19: In den v
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5 Ergebnisse Tabelle 5.20: In den v
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5 Ergebnisse exprimiert. Darunter d
Seite 152 und 153: 5 Ergebnisse Abbildung 5.22: Differ
Seite 154 und 155: 5 Ergebnisse Locus-Tag Gen Protein
Seite 156 und 157: 5 Ergebnisse Tabelle 5.25: In den v
Seite 158 und 159: 5 Ergebnisse 5.3.1 Analyse der zyto
Seite 160 und 161: 5 Ergebnisse Tabelle 5.27: Übersic
Seite 164 und 165: 5 Ergebnisse nillin induzierten Pro
Seite 168 und 169: 5 Ergebnisse unter Glucose spricht
Seite 172 und 173: 5 Ergebnisse KT2440 zu. Die Tatsach
Seite 174 und 175: 5 Ergebnisse PP_3739 zeigte bei ein
Seite 176 und 177: 5 Ergebnisse portsystems identifizi
Seite 184 und 185: 5 Ergebnisse Tabelle 5.36: Vergleic
Seite 186 und 187: 5 Ergebnisse Lipid-Metabolismus Im
Seite 190 und 191: 5 Ergebnisse in unseren Experimente
Seite 192 und 193: 5 Ergebnisse Abbildung 5.32: Quanti
Seite 194 und 195: 5 Ergebnisse mente wurden anschlie
Seite 196 und 197: 5 Ergebnisse Abbildung 5.34: Vertei
Seite 198 und 199: 5 Ergebnisse sion verstärkt. So ko
Seite 204 und 205: 5 Ergebnisse gulation von LiuA war
Seite 206 und 207: 5 Ergebnisse Locus- Gen Protein Glu
Seite 208 und 209: 5 Ergebnisse Abbildung 5.41: Schema
Seite 210 und 211: 5 Ergebnisse Tabelle 5.43: Differen
Seite 212 und 213: 5 Ergebnisse Abbildung 5.42: Gelbil
Seite 214 und 215: 5 Ergebnisse Tabelle 5.44: Vergleic
Seite 216 und 217: 5 Ergebnisse Spot gi Nummer Protein
Seite 218 und 219: 6 Diskussion in P. putida JM37 deut
Seite 220 und 221: 6 Diskussion al., 1995; Toyama et a
Seite 222 und 223: 6 Diskussion stoffquelle abhängig
Seite 224 und 225: 6 Diskussion angeimpft. Die Zugabe
Seite 226 und 227: 6 Diskussion 3 g/l Butanol könnte
Seite 228 und 229: 6 Diskussion cken sich dabei nicht
Seite 230 und 231: 6 Diskussion setzungsversuche von Y
Seite 232 und 233: 6 Diskussion lin zuließ, war die v
Seite 234 und 235: 6 Diskussion Analyse unterschiedlic
Seite 236 und 237: 6 Diskussion mäßig geringen Grö
Seite 238 und 239: 6 Diskussion Publikation Verwendete
Seite 240 und 241: 6 Diskussion a) Stabilisierung und
Seite 242 und 243: 6 Diskussion nicht nachgewiesen wer
Seite 244 und 245: 6 Diskussion senspektrometrischer Q
Seite 246 und 247: 6 Diskussion Anteil an Proteinen de
Seite 248 und 249: 6 Diskussion gezielte und absolute
Seite 250 und 251: 6 Diskussion Wie bereits in den üb
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Literatur Alban, Andrew, Stephen Ol
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Literatur Chattopadhyay, Ava, Karin
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Literatur bp inverted repeat sequen
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Literatur Inui, Masayuki, Masako Su
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Literatur Lovric, Josip (2011). Int
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Literatur comparative analysis of t
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Literatur coding three quinoprotein
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Literatur Schmidt, Alexander, Josef
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Literatur Toyama, Hirohide, Zhi-Wei
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Literatur Wood J. M., W. A. und R.
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Abkürzungsverzeichnis CE DC GeLCMS
Seite 274 und 275:
Eidesstattliche Versicherung Eidess
Seite 276:
Anhang Alle Tabellen und Abbildunge
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