Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

5 Ergebnisse
5.2.2 Transkriptom- und Proteomanalyse im Vergleich
Neben den in dieser Arbeit vorgestellten Proteomdaten wurden für die im vorherigen
Abschnitt besprochenen Vergleiche „Glucose vs. 0,5 g/l Butanol“ und „Glucose vs. 3 g/l
Butanol“ auch Transkriptomdaten erhoben. Diese Arbeiten wurden von Björn Mückschel
(AG Hauer, Institut für Technische Biochemie, Universität Stuttgart) durchgeführt
und werden daher an dieser Stelle nur kurz zu den Proteomdaten in Bezug gesetzt.
Das VENN-Diagramm in Abbildung 5.12 zeigt einen Vergleich der in den beiden Experimenten
differentiell regulierten Transkripte und Proteine.
In beiden analysierten Vergleichen waren lediglich zehn Proteine sowohl auf Transkriptom-
als auch auf Proteomebene reguliert (Tabelle 5.9, Tabelle 5.10). Diese in beiden
Analysen differentiell regulierten Proteine konnten größtenteils dem für Butanol postulierten
Abbauweg zugeordnet werden.
Tabelle 5.9: Proteine welche im Vergleich zwischen Glucose und 0,5 g/l Butanol sowohl auf
Transkriptom- als auch auf Proteomebene differentiell reguliert waren.
Trans.
Locus-Tag Gen Protein Reg.-
Reg.-
Prot.
PP_2673 Pentapeptide Repeat-Containing Protein 5,8 3,7
PP_2674 qedH Quinoprotein Ethanol-Dehydrogenase 6,5 6,4
PP_2680 Aldehyd Dehydrogenase 6,6 4,3
PP_3553 Acyl-CoA Synthetase 3,4 9,2
PP_3754 Beta-Ketothiolase 4,4 6,7
PP_3755 paaH 3-Hydroxybutyryl-CoA Dehydrogenase 5 7,6
PP_4116 aceA Isocitrate Lyase 4,2 3,9
PP_4201 Electron Transfer Flavoprotein 1,9 1,8
PP_4203 Electron-Transferring-Flavoprotein Dehydrogenase 2,3 2,5
PP_4487 acsA Acetyl-CoA Synthetase 2,5 3,2
Reg.-Trans.: Regulation auf Transkriptomebene. Transkripte wurden als reguliert betrachtet, wenn
sie eine Regulation von ±2,5 und einen p-Wert < 0,05 aufwiesen.
Reg.-Prot.: Proteine wurden als reguliert betrachtet, wenn sie um einen Faktor von mehr als 1,8
(bzw. weniger als 0,6) reguliert waren und einen p-Wert < 0,05 aufwiesen.
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