Dokument 2.pdf - OPUS-Datenbank - Universität Hohenheim

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portsystems identifiziert werden konnten, wurde auch bei einer Induktion einer Komponente
von der Induktion des Gesamtsystems ausgegangen. Unter Vanillin induziert
waren unter anderem PP_0176, PP_0178, PP_0179 und PP_0804-PP_0806 sowie
PP_0906-PP_0907. Die Funktion der potentiellen Efflux-Systeme PP_0804-PP_0806
und PP_0906-PP_0907 ist unbekannt.
Neben dem komplett regulierten System PP_0176, PP_0178, PP_0179 war auch
PP_1152 (HlyD family protein), welches einem ähnlichen Cluster angehört induziert.
Obwohl die beiden Export-Systeme als Fusarinsäure-Transporter in der „Pseudomonas
Genome Datenbank“ annotiert sind, könnten sie laut der Conserved Domain Datenbank
(CDD), auch eine Rolle beim Transport anderer Aromaten spielen (Marchler-Bauer et
al., 2011). Ein entsprechendes OEP war auf dem Genom nicht benachbart, was aufgrund
der Tatsache, dass mehrere Transportsysteme das gleiche OEP nutzen können nicht
gegen eine Funktion des Transport-Systems im Vanillin-Metabolismus spricht. Ebenfalls
induziert war das Typ-I-Sekretionssystem PP_1271-PP_1273, wovon PP_1272
und PP_1273 unter Vanillin induziert waren. PP_1272 war auch in P. putida S12
nach Behandlung mit Toluol induziert (Wijte et al., 2011). Die in der gleichen Arbeit
beschriebene Acetat Permease (ActP) wurde auch in unseren Experimenten unter Vanillin
verstärkt exprimiert und war bereits unter Butanol und Ethylenglycol ebenfalls
induziert. Die mögliche Funktion von ActP wird in Kapitel 6.1 diskutiert. Das MFP
EmrA (PP_3549), welches zusammen mit PP_3548 ein weiteres Sekretionssystem bildet,
zeigte unter Vanillin ebenfalls eine verstärkte Expression. Auch hier konnte kein
auf dem Genom benachbartes OEP identifiziert werden. Ein weiteres OEP, welches zur
TolC-Familie gehört, wurde wiederum mit PP_4923 identifiziert. Die beiden letzten in
diesem Versuch induzierten Typ I-Sekretionssysteme waren PP_5173-PP_5175 sowie
PP_5206-PP_5208. Dabei kodieren PP_5174 und PP_5175 beide für MFPs, während
PP_5206 und PP_5207 beide für die ABC-Transporter-Untereinheit des Sekretionssystems
kodieren. Neben den beschriebenen Typ I-Sekretionssystemen war auch ein
Typ-IV-Sekretionssystem unter Vanillin induziert. Dabei stellen die beiden regulierten
Proteine PP_1121 und PP_1122 die Komponente der äußeren Membran dar. Ein zugehöriges
OEP konnte in beiden Fällen nicht identifiziert werden. Tabelle 5.33 fasst alle
in den Vanillin-Versuchen regulierten Transportsysteme und Porine zusammen.
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